152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1243 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  100 
 
 
510 aa  1035    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  33.46 
 
 
500 aa  300  3e-80  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  34.29 
 
 
497 aa  276  5e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  32.62 
 
 
492 aa  273  5.000000000000001e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  34.03 
 
 
497 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  33.79 
 
 
497 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  34.39 
 
 
493 aa  268  2e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  32.95 
 
 
520 aa  264  2e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  30.8 
 
 
496 aa  256  7e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  27.18 
 
 
560 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  27.01 
 
 
559 aa  147  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  28.17 
 
 
557 aa  145  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  28.11 
 
 
523 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  24.15 
 
 
564 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  24.8 
 
 
524 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  24.89 
 
 
531 aa  128  3e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  25.26 
 
 
523 aa  124  3e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  26.48 
 
 
524 aa  124  3e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  23.67 
 
 
611 aa  123  9e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  26.06 
 
 
569 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  24.18 
 
 
508 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  26.2 
 
 
581 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  24.4 
 
 
544 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  26.37 
 
 
546 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  24.68 
 
 
563 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  28.39 
 
 
524 aa  111  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  23.27 
 
 
616 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  22.2 
 
 
605 aa  110  5e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  25.52 
 
 
557 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  23.57 
 
 
628 aa  109  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  23.99 
 
 
569 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  23.82 
 
 
496 aa  106  9e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  23.49 
 
 
693 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  25.85 
 
 
550 aa  101  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  34.03 
 
 
559 aa  97.4  5e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  23.97 
 
 
617 aa  97.4  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1515  protein of unknown function DUF87  23.38 
 
 
530 aa  96.7  9e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.649754  normal  0.132485 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  31.49 
 
 
608 aa  96.7  9e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0074  hypothetical protein  24.37 
 
 
495 aa  96.3  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0871233  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  32.33 
 
 
599 aa  92.4  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  33.1 
 
 
593 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  34.67 
 
 
709 aa  87.8  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  35.44 
 
 
617 aa  85.9  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  31.62 
 
 
575 aa  85.1  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  30.32 
 
 
594 aa  85.1  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  27.31 
 
 
595 aa  84.7  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  32.82 
 
 
679 aa  84  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  28.96 
 
 
587 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1803  hypothetical protein  34.51 
 
 
626 aa  83.6  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321314  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  32.32 
 
 
561 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  35.97 
 
 
714 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  31.41 
 
 
579 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  35.62 
 
 
659 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  33.64 
 
 
623 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  33.64 
 
 
709 aa  80.1  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  34.19 
 
 
591 aa  79.7  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  35.16 
 
 
574 aa  76.3  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  32.62 
 
 
577 aa  76.3  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  28.47 
 
 
628 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2094  hypothetical protein  29.2 
 
 
582 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2792  protein of unknown function DUF87  32.03 
 
 
679 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.744858  normal  0.636348 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  26.81 
 
 
607 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  34.07 
 
 
579 aa  74.3  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  29.41 
 
 
600 aa  74.3  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2238  protein of unknown function DUF87  28.47 
 
 
583 aa  74.3  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  33.1 
 
 
670 aa  73.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  32.03 
 
 
674 aa  73.6  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  31.09 
 
 
583 aa  73.2  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  26.62 
 
 
584 aa  73.2  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3526  hypothetical protein  30.25 
 
 
583 aa  72  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543626  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  38.2 
 
 
526 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1259  protein of unknown function DUF87  23.75 
 
 
540 aa  71.6  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  29.61 
 
 
591 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  34.23 
 
 
612 aa  70.9  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5744  hypothetical protein  29.41 
 
 
590 aa  70.5  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575418 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  34.13 
 
 
427 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  35.43 
 
 
570 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1486  hypothetical protein  32.2 
 
 
560 aa  69.7  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0937  hypothetical protein  20.4 
 
 
540 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0147133  normal  0.254287 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  26.06 
 
 
664 aa  68.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  26.9 
 
 
603 aa  68.6  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3715  hypothetical protein  24.57 
 
 
601 aa  68.2  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  31.09 
 
 
662 aa  67.4  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  29.75 
 
 
570 aa  67.4  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1882  protein of unknown function DUF87  29.01 
 
 
581 aa  67  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000610913 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0047  hypothetical protein  24.81 
 
 
486 aa  66.6  0.0000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0355  ATPase-like protein  35.29 
 
 
250 aa  66.2  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  23.53 
 
 
674 aa  66.6  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0018  protein of unknown function DUF87  24.72 
 
 
537 aa  65.5  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.989354  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0306  hypothetical protein  23.34 
 
 
530 aa  64.7  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0926  protein of unknown function DUF87  22.65 
 
 
553 aa  64.7  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2387  protein of unknown function DUF87  21.84 
 
 
708 aa  63.2  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.10181  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1337  hypothetical protein  23.51 
 
 
445 aa  62.4  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  33.33 
 
 
567 aa  62.4  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1482  hypothetical protein  24.71 
 
 
546 aa  62.4  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.431628  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2263  ATPase-like protein  25.38 
 
 
533 aa  62.8  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.539345 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1619  hypothetical protein  33.67 
 
 
532 aa  62  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2164  hypothetical protein  29.66 
 
 
582 aa  62  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000710411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1585  protein of unknown function DUF87  22.52 
 
 
572 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.049395 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0751  protein of unknown function DUF87  22.41 
 
 
499 aa  61.2  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.14388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>