161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4448 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  100 
 
 		 587 aa  1210    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  52.12 
 
 		 579 aa  581  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  43 
 
 		 594 aa  441  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  39.8 
 
 		 595 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  30.57 
 
 		 575 aa  253  5.000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  30.13 
 
 		 546 aa  240  5e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  32.38 
 
 		 579 aa  231  2e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  31.67 
 
 		 607 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  31.87 
 
 		 577 aa  229  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  30.54 
 
 		 591 aa  219  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  28.15 
 
 		 569 aa  211  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  29.96 
 
 		 593 aa  204  4e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  29.83 
 
 		 550 aa  196  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  26.22 
 
 		 709 aa  185  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  26.91 
 
 		 591 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  28.26 
 
 		 693 aa  175  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  30.79 
 
 		 623 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  26.41 
 
 		 670 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  26.57 
 
 		 570 aa  166  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  26.61 
 
 		 659 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  27.83 
 
 		 674 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  28.1 
 
 		 709 aa  161  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  27.25 
 
 		 679 aa  160  9e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  28.04 
 
 		 662 aa  159  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5744  hypothetical protein  27.35 
 
 		 590 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575418 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2792  protein of unknown function DUF87  28.97 
 
 		 679 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.744858  normal  0.636348 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  38.22 
 
 		 714 aa  154  5.9999999999999996e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  26.97 
 
 		 612 aa  153  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1486  hypothetical protein  24.94 
 
 		 560 aa  150  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  27.03 
 
 		 599 aa  150  9e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  33.85 
 
 		 544 aa  150  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  33.33 
 
 		 569 aa  143  7e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1803  hypothetical protein  24.27 
 
 		 626 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321314  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  39 
 
 		 664 aa  136  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  25.73 
 
 		 526 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  35.82 
 
 		 674 aa  130  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2238  protein of unknown function DUF87  33.33 
 
 		 583 aa  126  9e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  32.86 
 
 		 628 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2094  hypothetical protein  33.82 
 
 		 582 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  32.86 
 
 		 583 aa  124  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  31.6 
 
 		 617 aa  123  8e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  33.33 
 
 		 584 aa  122  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  33 
 
 		 617 aa  117  5e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  35.94 
 
 		 496 aa  117  5e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3526  hypothetical protein  33.33 
 
 		 583 aa  117  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  41.18 
 
 		 497 aa  111  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  42.65 
 
 		 493 aa  112  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  40.6 
 
 		 497 aa  110  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  40.6 
 
 		 497 aa  110  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  42.24 
 
 		 559 aa  108  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  32.29 
 
 		 603 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  23.82 
 
 		 567 aa  108  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  34.59 
 
 		 608 aa  107  5e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  33.88 
 
 		 611 aa  107  7e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  33.33 
 
 		 605 aa  106  9e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  24.63 
 
 		 570 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  35.03 
 
 		 563 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  26.7 
 
 		 531 aa  103  8e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  34.55 
 
 		 616 aa  102  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3715  hypothetical protein  31.58 
 
 		 601 aa  99  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  33.13 
 
 		 492 aa  95.5  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  32.56 
 
 		 508 aa  92  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  32.32 
 
 		 557 aa  92.4  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  37.82 
 
 		 581 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  33.51 
 
 		 520 aa  92.4  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  30.54 
 
 		 557 aa  91.7  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  34.48 
 
 		 561 aa  91.7  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  32.94 
 
 		 360 aa  91.3  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  30.12 
 
 		 496 aa  89.4  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  35.77 
 
 		 500 aa  89  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  36.6 
 
 		 574 aa  87.4  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  28.96 
 
 		 510 aa  84  0.000000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  27.65 
 
 		 564 aa  82.4  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  28.65 
 
 		 560 aa  81.3  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2030  hypothetical protein  31.78 
 
 		 589 aa  80.5  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309935 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  32.61 
 
 		 600 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  23.6 
 
 		 524 aa  75.9  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2366  protein of unknown function DUF87  36.23 
 
 		 592 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.250268  normal  0.14702 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  26.38 
 
 		 427 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0753  protein of unknown function DUF87  34.88 
 
 		 506 aa  72.8  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0799035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  30.43 
 
 		 559 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  32.65 
 
 		 628 aa  73.2  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  23.38 
 
 		 524 aa  71.2  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2954  hypothetical protein  33.09 
 
 		 589 aa  68.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000103337 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3279  hypothetical protein  33.09 
 
 		 590 aa  67.8  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  31.34 
 
 		 523 aa  67.8  0.0000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1515  protein of unknown function DUF87  22.4 
 
 		 530 aa  65.1  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.649754  normal  0.132485 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0213  hypothetical protein  33.12 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0846575  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1865  hypothetical protein  33.33 
 
 		 655 aa  63.9  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0131162 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  28.22 
 
 		 523 aa  63.9  0.000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2778  hypothetical protein  33.33 
 
 		 580 aa  62.8  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145513  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2256  hypothetical protein  25.43 
 
 		 651 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.562267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1752  protein of unknown function DUF87  32 
 
 		 643 aa  61.6  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0349  protein of unknown function DUF87  27.27 
 
 		 540 aa  59.7  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0018  protein of unknown function DUF87  30.11 
 
 		 537 aa  59.3  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.989354  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  37.66 
 
 		 537 aa  59.7  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2369  hypothetical protein  30.48 
 
 		 659 aa  59.7  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2149  ATPase  30.28 
 
 		 605 aa  58.5  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5115  hypothetical protein  28.82 
 
 		 595 aa  58.9  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1619  hypothetical protein  25.93 
 
 		 532 aa  57.8  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>