213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1112 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  75.33 
 
 
523 aa  847    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  76.05 
 
 
524 aa  836    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  100 
 
 
524 aa  1063    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  72.85 
 
 
523 aa  828    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  47.92 
 
 
524 aa  470  1.0000000000000001e-131  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  29.61 
 
 
508 aa  173  6.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  30.88 
 
 
496 aa  164  4.0000000000000004e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  30.57 
 
 
561 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  28.39 
 
 
581 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  28.06 
 
 
557 aa  154  4e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  29.81 
 
 
531 aa  150  4e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  29.11 
 
 
560 aa  146  9e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  27.21 
 
 
559 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  26.98 
 
 
493 aa  144  4e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  27.89 
 
 
605 aa  141  3e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  24.49 
 
 
497 aa  141  3e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  28.78 
 
 
564 aa  138  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  24.49 
 
 
497 aa  137  4e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  24.7 
 
 
497 aa  137  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  28.85 
 
 
616 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  25.75 
 
 
628 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.891235 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  25.2 
 
 
500 aa  127  3e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  25.18 
 
 
510 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  27.63 
 
 
611 aa  125  2e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  27.08 
 
 
557 aa  125  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  38.51 
 
 
563 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  34.64 
 
 
496 aa  102  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  28.89 
 
 
559 aa  101  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  25.5 
 
 
526 aa  99  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  36.36 
 
 
520 aa  92.4  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  26.12 
 
 
569 aa  90.9  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  32.93 
 
 
608 aa  90.5  7e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  29 
 
 
492 aa  88.2  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  24.4 
 
 
591 aa  87.8  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5744  hypothetical protein  27.37 
 
 
590 aa  87.4  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575418 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  24.2 
 
 
570 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  25.36 
 
 
679 aa  84  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  25.24 
 
 
544 aa  81.3  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0018  protein of unknown function DUF87  25.17 
 
 
537 aa  79.7  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.989354  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  25.89 
 
 
693 aa  78.2  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  25.77 
 
 
612 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  30.14 
 
 
709 aa  77  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1484  hypothetical protein  26.57 
 
 
1144 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0469742  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  33.33 
 
 
617 aa  73.9  0.000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1803  hypothetical protein  23.47 
 
 
626 aa  73.9  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321314  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  32.89 
 
 
599 aa  73.6  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1482  hypothetical protein  24.75 
 
 
546 aa  73.2  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.431628  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  32.74 
 
 
537 aa  73.2  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0074  hypothetical protein  23.26 
 
 
495 aa  72.4  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0871233  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0941  AAA ATPase  24.25 
 
 
456 aa  72  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0685894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  23.38 
 
 
587 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1183  AAA ATPase  26.01 
 
 
1043 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  33.61 
 
 
546 aa  70.1  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  27.78 
 
 
623 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  37.93 
 
 
593 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0453  protein of unknown function DUF87  24.52 
 
 
568 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1259  protein of unknown function DUF87  24.57 
 
 
540 aa  68.2  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5114  AAA ATPase  27.27 
 
 
1076 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078899 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1344  hypothetical protein  22.74 
 
 
451 aa  68.2  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  34.23 
 
 
591 aa  66.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  29.45 
 
 
579 aa  66.6  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1515  protein of unknown function DUF87  22.22 
 
 
530 aa  66.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.649754  normal  0.132485 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  33.58 
 
 
714 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  30.49 
 
 
360 aa  65.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2419  protein of unknown function DUF87  23.99 
 
 
569 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  32.46 
 
 
594 aa  66.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3692  protein of unknown function DUF87  23.99 
 
 
569 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.407099 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  26.95 
 
 
595 aa  65.1  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0645  hypothetical protein  28.36 
 
 
686 aa  65.1  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.549524  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  36.13 
 
 
574 aa  65.1  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  32.12 
 
 
674 aa  64.7  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0751  protein of unknown function DUF87  23.37 
 
 
499 aa  64.7  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.14388  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  29.75 
 
 
709 aa  64.3  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0816  hypothetical protein  23.9 
 
 
452 aa  64.3  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.723695  normal  0.916322 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  24.8 
 
 
662 aa  64.3  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0132  protein of unknown function DUF87  23.89 
 
 
534 aa  64.3  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0970919  decreased coverage  0.000025846 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5149  AAA ATPase  26.01 
 
 
1031 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120671  normal  0.52051 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1374  protein of unknown function DUF87  23.3 
 
 
538 aa  63.9  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.627609 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  28.1 
 
 
607 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25990  predicted ATPase  25.52 
 
 
540 aa  63.9  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  35.06 
 
 
569 aa  63.5  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  37.17 
 
 
674 aa  63.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_268  hypothetical protein  24.43 
 
 
530 aa  63.5  0.000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2792  protein of unknown function DUF87  37.17 
 
 
679 aa  63.5  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.744858  normal  0.636348 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  47.83 
 
 
570 aa  63.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0937  hypothetical protein  23.27 
 
 
540 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0147133  normal  0.254287 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  32.08 
 
 
664 aa  62.4  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  32.74 
 
 
427 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  33.83 
 
 
670 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1906  hypothetical protein  23.92 
 
 
579 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000004225  normal  0.0184215 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  33.33 
 
 
659 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  30.26 
 
 
550 aa  62  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0326  hypothetical protein  24.21 
 
 
530 aa  62  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2366  protein of unknown function DUF87  26.03 
 
 
592 aa  62  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.250268  normal  0.14702 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1337  hypothetical protein  24.07 
 
 
445 aa  62  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1389  hypothetical protein  32.82 
 
 
606 aa  62  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.103576 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  34.82 
 
 
600 aa  62  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3967  AAA ATPase  23.12 
 
 
1046 aa  61.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0795  ATPase-like protein  32.95 
 
 
396 aa  61.2  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.412059  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  27.61 
 
 
603 aa  60.5  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>