106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0453 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1906  hypothetical protein  74.78 
 
 
579 aa  913    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000004225  normal  0.0184215 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4844  hypothetical protein  70.66 
 
 
579 aa  846    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.415691  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2419  protein of unknown function DUF87  84.53 
 
 
569 aa  1006    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0453  protein of unknown function DUF87  100 
 
 
568 aa  1176    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1585  protein of unknown function DUF87  71.4 
 
 
572 aa  845    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.049395 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3692  protein of unknown function DUF87  84.71 
 
 
569 aa  1008    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.407099 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1479  hypothetical protein  72.92 
 
 
580 aa  879    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0102316  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1701  hypothetical protein  52.67 
 
 
539 aa  574  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.016697  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3183  hypothetical protein  52.28 
 
 
538 aa  569  1e-161  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.837382  normal  0.234519 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2549  hypothetical protein  52.62 
 
 
542 aa  551  1e-155  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.170922  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0132  protein of unknown function DUF87  51.12 
 
 
534 aa  521  1e-146  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0970919  decreased coverage  0.000025846 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0926  protein of unknown function DUF87  48.45 
 
 
553 aa  498  1e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_268  hypothetical protein  45.57 
 
 
530 aa  472  1e-132  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0326  hypothetical protein  45.44 
 
 
530 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0306  hypothetical protein  45.07 
 
 
530 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1140  protein of unknown function DUF87  39.05 
 
 
554 aa  364  3e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0937  hypothetical protein  26 
 
 
540 aa  102  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0147133  normal  0.254287 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1619  hypothetical protein  25.18 
 
 
532 aa  95.5  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1482  hypothetical protein  27.46 
 
 
546 aa  88.2  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.431628  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1515  protein of unknown function DUF87  24.76 
 
 
530 aa  84.7  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.649754  normal  0.132485 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1440  hypothetical protein  25.06 
 
 
539 aa  80.1  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.828058  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  23.39 
 
 
605 aa  75.9  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  23.92 
 
 
559 aa  73.9  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  24.03 
 
 
628 aa  73.6  0.000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  24.19 
 
 
608 aa  73.2  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0751  protein of unknown function DUF87  25.27 
 
 
499 aa  72  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.14388  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  24.69 
 
 
611 aa  71.2  0.00000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  21.59 
 
 
563 aa  70.5  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  23.12 
 
 
557 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  24.52 
 
 
524 aa  68.9  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  22.99 
 
 
612 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  24.84 
 
 
593 aa  68.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0074  hypothetical protein  24.89 
 
 
495 aa  67.4  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0871233  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  22.81 
 
 
561 aa  67  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  21.15 
 
 
496 aa  67  0.0000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  24.42 
 
 
564 aa  65.5  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  22.03 
 
 
497 aa  63.9  0.000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  33.33 
 
 
591 aa  63.5  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  22.11 
 
 
560 aa  63.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  24.03 
 
 
520 aa  62.8  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  29.58 
 
 
496 aa  62  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  35.71 
 
 
544 aa  61.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  31.3 
 
 
570 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  35.14 
 
 
623 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  24.47 
 
 
546 aa  60.5  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  33.62 
 
 
569 aa  60.5  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  29.82 
 
 
508 aa  60.5  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  21.33 
 
 
497 aa  60.1  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  21.62 
 
 
497 aa  60.1  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  23 
 
 
524 aa  59.7  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  33.33 
 
 
567 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  30.58 
 
 
574 aa  58.9  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  25.82 
 
 
659 aa  58.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  30.97 
 
 
570 aa  58.2  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  33.87 
 
 
709 aa  58.2  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  35.09 
 
 
594 aa  58.2  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  32.2 
 
 
616 aa  57.8  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  32.56 
 
 
591 aa  57.4  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  34.19 
 
 
599 aa  57.4  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  22.36 
 
 
577 aa  57  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  31.3 
 
 
427 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  21.27 
 
 
579 aa  55.8  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  32.09 
 
 
670 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.187802 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  33.33 
 
 
500 aa  55.1  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  25.41 
 
 
674 aa  54.7  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2792  protein of unknown function DUF87  26.32 
 
 
679 aa  54.3  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.744858  normal  0.636348 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  36.99 
 
 
526 aa  54.3  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  30.7 
 
 
679 aa  54.3  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  25.18 
 
 
559 aa  53.5  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  39.19 
 
 
531 aa  53.5  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  28.67 
 
 
492 aa  53.5  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3526  hypothetical protein  32.76 
 
 
583 aa  53.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543626  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1389  hypothetical protein  29.22 
 
 
606 aa  53.5  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.103576 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  31.93 
 
 
709 aa  52.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  33.33 
 
 
617 aa  52.8  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  39.19 
 
 
569 aa  52.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  32.76 
 
 
584 aa  52.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  20.27 
 
 
493 aa  52.4  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  32.76 
 
 
557 aa  52.8  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  33.33 
 
 
628 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  32.76 
 
 
583 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2094  hypothetical protein  32.46 
 
 
582 aa  50.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  34.58 
 
 
523 aa  50.4  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  27.48 
 
 
662 aa  50.8  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5744  hypothetical protein  31.03 
 
 
590 aa  50.8  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575418 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  33.02 
 
 
524 aa  50.8  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2238  protein of unknown function DUF87  32.46 
 
 
583 aa  50.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  25.83 
 
 
603 aa  50.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1803  hypothetical protein  28.46 
 
 
626 aa  50.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321314  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  25.69 
 
 
714 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  31.48 
 
 
523 aa  49.3  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  30.65 
 
 
575 aa  49.3  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1882  protein of unknown function DUF87  21.04 
 
 
581 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000610913 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  24.22 
 
 
693 aa  47.8  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  36.14 
 
 
550 aa  47.8  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  29.31 
 
 
600 aa  47.4  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  25.26 
 
 
595 aa  47.4  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  28.79 
 
 
579 aa  47.4  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2164  hypothetical protein  32 
 
 
582 aa  47  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000710411 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3715  hypothetical protein  26.09 
 
 
601 aa  47  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>