179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1138 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  100 
 
 		 561 aa  1146    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  67.86 
 
 		 563 aa  788    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  30.75 
 
 		 496 aa  204  3e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  28.62 
 
 		 564 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  28.7 
 
 		 560 aa  190  5e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  28.29 
 
 		 557 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  32.47 
 
 		 523 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  27.13 
 
 		 559 aa  183  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  28.62 
 
 		 496 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  33.26 
 
 		 523 aa  181  4e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  28.09 
 
 		 508 aa  178  3e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  30.63 
 
 		 531 aa  176  9e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  32.62 
 
 		 524 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  30.57 
 
 		 524 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  30.77 
 
 		 524 aa  171  2e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  27.43 
 
 		 493 aa  161  4e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  27.11 
 
 		 557 aa  156  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  27.4 
 
 		 559 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  26.55 
 
 		 605 aa  144  6e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  24.91 
 
 		 628 aa  135  9.999999999999999e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  27.8 
 
 		 607 aa  127  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  30.94 
 
 		 608 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  29.31 
 
 		 616 aa  120  9e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  33.9 
 
 		 611 aa  119  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  35.84 
 
 		 497 aa  118  3e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  35.84 
 
 		 497 aa  118  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  27.27 
 
 		 569 aa  117  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  26.9 
 
 		 599 aa  117  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  36.84 
 
 		 497 aa  117  6e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  25.05 
 
 		 544 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  36.87 
 
 		 594 aa  110  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  23.26 
 
 		 575 aa  108  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  33.55 
 
 		 581 aa  103  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  33.33 
 
 		 500 aa  101  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  34.48 
 
 		 587 aa  100  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  31.43 
 
 		 617 aa  99  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  31.25 
 
 		 492 aa  99  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  33.91 
 
 		 520 aa  99  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  24.01 
 
 		 570 aa  98.6  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  33.33 
 
 		 546 aa  97.4  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  35.95 
 
 		 569 aa  97.4  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  35.33 
 
 		 579 aa  97.1  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  30.24 
 
 		 709 aa  95.9  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  25.06 
 
 		 574 aa  94.7  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  34.38 
 
 		 595 aa  94.7  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  30.49 
 
 		 659 aa  94.4  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1515  protein of unknown function DUF87  23.81 
 
 		 530 aa  92.4  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.649754  normal  0.132485 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  23.13 
 
 		 600 aa  92.4  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0937  hypothetical protein  23.38 
 
 		 540 aa  92.8  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0147133  normal  0.254287 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  36.16 
 
 		 579 aa  90.9  5e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  42.86 
 
 		 591 aa  90.1  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  35.43 
 
 		 593 aa  89.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  32.77 
 
 		 679 aa  89.7  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  32.32 
 
 		 510 aa  89.7  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  29.94 
 
 		 670 aa  89.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  27.62 
 
 		 674 aa  89.7  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  34.5 
 
 		 714 aa  89.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  34.57 
 
 		 623 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0753  protein of unknown function DUF87  31.21 
 
 		 506 aa  89.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0799035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  30.27 
 
 		 591 aa  89.4  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  30.88 
 
 		 550 aa  89  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1619  hypothetical protein  23.24 
 
 		 532 aa  87.4  6e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2954  hypothetical protein  21.86 
 
 		 589 aa  87  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000103337 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  38.74 
 
 		 612 aa  83.6  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  37.17 
 
 		 583 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1482  hypothetical protein  31.41 
 
 		 546 aa  82.8  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.431628  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3526  hypothetical protein  39.82 
 
 		 583 aa  82.4  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5744  hypothetical protein  38.26 
 
 		 590 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575418 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  39.82 
 
 		 693 aa  81.6  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  31.61 
 
 		 577 aa  81.3  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2164  hypothetical protein  24.82 
 
 		 582 aa  81.3  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000710411 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  38.05 
 
 		 584 aa  80.9  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  29.76 
 
 		 709 aa  80.9  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  38.05 
 
 		 617 aa  80.5  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2094  hypothetical protein  38.05 
 
 		 582 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  23.15 
 
 		 567 aa  79  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  38.05 
 
 		 662 aa  79.3  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  32.32 
 
 		 664 aa  79.3  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2238  protein of unknown function DUF87  35.71 
 
 		 583 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  36.28 
 
 		 628 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0074  hypothetical protein  24.37 
 
 		 495 aa  78.2  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0871233  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  29.01 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  31.13 
 
 		 570 aa  77.8  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0132  protein of unknown function DUF87  23.27 
 
 		 534 aa  76.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0970919  decreased coverage  0.000025846 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1389  hypothetical protein  40.54 
 
 		 606 aa  75.1  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.103576 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  33.33 
 
 		 526 aa  74.3  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1585  protein of unknown function DUF87  23.96 
 
 		 572 aa  73.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.049395 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0453  protein of unknown function DUF87  22.81 
 
 		 568 aa  73.9  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1486  hypothetical protein  37.61 
 
 		 560 aa  73.2  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1752  protein of unknown function DUF87  24.94 
 
 		 643 aa  72.8  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2792  protein of unknown function DUF87  38.05 
 
 		 679 aa  72.8  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.744858  normal  0.636348 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3279  hypothetical protein  22.09 
 
 		 590 aa  72.4  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  34.29 
 
 		 674 aa  72  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2419  protein of unknown function DUF87  23.1 
 
 		 569 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3692  protein of unknown function DUF87  23.1 
 
 		 569 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.407099 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3183  hypothetical protein  22.88 
 
 		 538 aa  72  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.837382  normal  0.234519 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0751  protein of unknown function DUF87  24.3 
 
 		 499 aa  71.2  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.14388  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5114  AAA ATPase  26.15 
 
 		 1076 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078899 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1803  hypothetical protein  36.21 
 
 		 626 aa  71.6  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321314  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0018  protein of unknown function DUF87  24.4 
 
 		 537 aa  70.9  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.989354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>