179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4332 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  100 
 
 		 427 aa  879    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  57.61 
 
 		 600 aa  512  1e-144  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  45.73 
 
 		 574 aa  379  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  46.96 
 
 		 567 aa  361  2e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  44.21 
 
 		 570 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3692  protein of unknown function DUF87  55.3 
 
 		 382 aa  252  9.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.703061  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  27.02 
 
 		 546 aa  131  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  25.55 
 
 		 591 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  25.46 
 
 		 575 aa  124  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  25.98 
 
 		 595 aa  123  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  25.74 
 
 		 550 aa  120  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  23.45 
 
 		 659 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  27.49 
 
 		 599 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  25.38 
 
 		 623 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  24.9 
 
 		 670 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  31.6 
 
 		 714 aa  109  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2366  protein of unknown function DUF87  25.68 
 
 		 592 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.250268  normal  0.14702 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  25.79 
 
 		 569 aa  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2954  hypothetical protein  24.02 
 
 		 589 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000103337 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  21.95 
 
 		 607 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  26.7 
 
 		 591 aa  101  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0349  protein of unknown function DUF87  23.82 
 
 		 540 aa  99.8  8e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  25.05 
 
 		 603 aa  99.8  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  40.29 
 
 		 569 aa  99  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  28.94 
 
 		 709 aa  96.7  8e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2030  hypothetical protein  35.37 
 
 		 589 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309935 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  30.29 
 
 		 544 aa  95.5  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  26.29 
 
 		 628 aa  94.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  34.03 
 
 		 709 aa  93.2  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3279  hypothetical protein  30.67 
 
 		 590 aa  92.4  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  30.28 
 
 		 579 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  24.75 
 
 		 492 aa  91.7  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  23.93 
 
 		 563 aa  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  24.33 
 
 		 581 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  23.8 
 
 		 557 aa  89  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2094  hypothetical protein  26.06 
 
 		 582 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  26.17 
 
 		 524 aa  87.8  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  33.54 
 
 		 579 aa  87.4  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  25.69 
 
 		 583 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2238  protein of unknown function DUF87  25.49 
 
 		 583 aa  87.4  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5744  hypothetical protein  26.28 
 
 		 590 aa  87  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575418 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  34.31 
 
 		 577 aa  85.9  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  23.28 
 
 		 497 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  32.11 
 
 		 679 aa  84.7  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  25.17 
 
 		 584 aa  84  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  32.61 
 
 		 593 aa  83.2  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  23.45 
 
 		 693 aa  82.8  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  23.79 
 
 		 616 aa  82.8  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  28.86 
 
 		 594 aa  82.4  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  33.33 
 
 		 674 aa  82.4  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  34.39 
 
 		 664 aa  82.8  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  25.87 
 
 		 617 aa  82  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  23.56 
 
 		 564 aa  82  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3526  hypothetical protein  24.89 
 
 		 583 aa  81.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  22.61 
 
 		 496 aa  80.9  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  24.94 
 
 		 628 aa  80.5  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  33.33 
 
 		 557 aa  80.1  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0715  HerA helicase  24.86 
 
 		 409 aa  79.7  0.00000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  23.89 
 
 		 500 aa  79  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  24.53 
 
 		 496 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  24.56 
 
 		 617 aa  76.3  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  23 
 
 		 674 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  25.77 
 
 		 520 aa  74.7  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  26.38 
 
 		 587 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  24.24 
 
 		 559 aa  73.9  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  21.27 
 
 		 508 aa  73.6  0.000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1482  hypothetical protein  31.33 
 
 		 546 aa  72.8  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.431628  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  30.37 
 
 		 497 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  30.37 
 
 		 497 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2792  protein of unknown function DUF87  23 
 
 		 679 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.744858  normal  0.636348 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3715  hypothetical protein  29.14 
 
 		 601 aa  70.9  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  30.37 
 
 		 493 aa  70.5  0.00000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  34.13 
 
 		 510 aa  69.7  0.00000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  34.88 
 
 		 612 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  38.04 
 
 		 526 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0132  protein of unknown function DUF87  34.44 
 
 		 534 aa  68.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0970919  decreased coverage  0.000025846 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1619  hypothetical protein  29.5 
 
 		 532 aa  67.4  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1803  hypothetical protein  28.81 
 
 		 626 aa  66.6  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321314  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  33.86 
 
 		 531 aa  66.2  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  29.17 
 
 		 611 aa  65.9  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  30.58 
 
 		 605 aa  66.2  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  33.61 
 
 		 662 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  26.37 
 
 		 570 aa  65.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  28.47 
 
 		 608 aa  66.2  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  24.07 
 
 		 561 aa  65.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0937  hypothetical protein  29.6 
 
 		 540 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0147133  normal  0.254287 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  33.04 
 
 		 524 aa  63.5  0.000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0926  protein of unknown function DUF87  34.38 
 
 		 553 aa  63.2  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1389  hypothetical protein  33.33 
 
 		 606 aa  63.2  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.103576 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4844  hypothetical protein  34.11 
 
 		 579 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.415691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  31.3 
 
 		 523 aa  62.8  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  31.62 
 
 		 523 aa  62.4  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1752  protein of unknown function DUF87  32.09 
 
 		 643 aa  62  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0074  hypothetical protein  34.83 
 
 		 495 aa  62.4  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0871233  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  32.74 
 
 		 524 aa  62.4  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1625  hypothetical protein  39.24 
 
 		 783 aa  61.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1716  ATPase-like protein  24.16 
 
 		 1065 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00601254 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2778  hypothetical protein  32.14 
 
 		 580 aa  61.6  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145513  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  28.15 
 
 		 559 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1701  hypothetical protein  32.82 
 
 		 539 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.016697  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>