193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5073 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  100 
 
 		 567 aa  1154    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  57.77 
 
 		 574 aa  678    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  55.2 
 
 		 570 aa  621  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  44.17 
 
 		 600 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  46.96 
 
 		 427 aa  361  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3692  protein of unknown function DUF87  34.56 
 
 		 382 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.703061  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  28.03 
 
 		 546 aa  147  5e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  27 
 
 		 591 aa  137  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  26.07 
 
 		 577 aa  130  6e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  25.75 
 
 		 575 aa  126  9e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  25.05 
 
 		 594 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  24.94 
 
 		 579 aa  120  7.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  25.36 
 
 		 709 aa  117  6.9999999999999995e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  24.16 
 
 		 550 aa  115  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  23.85 
 
 		 603 aa  113  8.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  23.82 
 
 		 587 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3715  hypothetical protein  24.68 
 
 		 601 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  22.58 
 
 		 617 aa  105  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  28.82 
 
 		 595 aa  104  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  25.12 
 
 		 709 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0715  HerA helicase  26.87 
 
 		 409 aa  102  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2954  hypothetical protein  21.1 
 
 		 589 aa  100  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000103337 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  24.77 
 
 		 599 aa  97.4  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2030  hypothetical protein  25.11 
 
 		 589 aa  97.4  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2238  protein of unknown function DUF87  24.81 
 
 		 583 aa  97.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  25.13 
 
 		 583 aa  97.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  22.74 
 
 		 593 aa  96.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  24.35 
 
 		 628 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  24.3 
 
 		 612 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2366  protein of unknown function DUF87  22.7 
 
 		 592 aa  94.7  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.250268  normal  0.14702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3526  hypothetical protein  25.72 
 
 		 583 aa  94.4  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0349  protein of unknown function DUF87  22.86 
 
 		 540 aa  92.8  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5744  hypothetical protein  25.49 
 
 		 590 aa  91.7  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575418 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2094  hypothetical protein  25.51 
 
 		 582 aa  91.3  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  30.73 
 
 		 579 aa  91.3  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  22.74 
 
 		 607 aa  90.5  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  26.28 
 
 		 617 aa  89.7  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  25.42 
 
 		 584 aa  89.4  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  25.47 
 
 		 679 aa  87.4  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  28.91 
 
 		 714 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.74185 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  24.42 
 
 		 500 aa  84.7  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3279  hypothetical protein  33.58 
 
 		 590 aa  84.3  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  39.17 
 
 		 591 aa  80.9  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  28.65 
 
 		 659 aa  81.3  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  30.72 
 
 		 670 aa  79.7  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  24.57 
 
 		 693 aa  79.3  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  28.9 
 
 		 623 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  24.01 
 
 		 563 aa  77  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  22.91 
 
 		 561 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  22.8 
 
 		 544 aa  75.1  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  25 
 
 		 531 aa  74.7  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  29.49 
 
 		 674 aa  74.7  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  35.42 
 
 		 569 aa  73.9  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1486  hypothetical protein  25.16 
 
 		 560 aa  73.2  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  36.69 
 
 		 569 aa  72.4  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  31.37 
 
 		 492 aa  71.2  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  30 
 
 		 557 aa  70.9  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0326  hypothetical protein  30.36 
 
 		 530 aa  70.9  0.00000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_268  hypothetical protein  30.36 
 
 		 530 aa  70.5  0.00000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  29.93 
 
 		 628 aa  70.5  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0306  hypothetical protein  30.36 
 
 		 530 aa  70.5  0.00000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  25.25 
 
 		 559 aa  69.7  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  25.66 
 
 		 559 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  29.2 
 
 		 664 aa  69.7  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  23.75 
 
 		 662 aa  68.2  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  28.87 
 
 		 570 aa  67.4  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  30.17 
 
 		 581 aa  65.1  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2792  protein of unknown function DUF87  32.48 
 
 		 679 aa  64.3  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.744858  normal  0.636348 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  30.89 
 
 		 520 aa  64.3  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0132  protein of unknown function DUF87  33.33 
 
 		 534 aa  64.3  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0970919  decreased coverage  0.000025846 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1803  hypothetical protein  24.27 
 
 		 626 aa  64.3  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321314  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  33.9 
 
 		 524 aa  64.3  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  33.05 
 
 		 608 aa  63.9  0.000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  23.5 
 
 		 674 aa  63.9  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  33.05 
 
 		 605 aa  63.5  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1701  hypothetical protein  33.33 
 
 		 539 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.016697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1389  hypothetical protein  32.48 
 
 		 606 aa  63.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.103576 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1752  protein of unknown function DUF87  34.19 
 
 		 643 aa  62.4  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0926  protein of unknown function DUF87  33.82 
 
 		 553 aa  62.4  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  32.04 
 
 		 497 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1479  hypothetical protein  31.62 
 
 		 580 aa  62.8  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0102316  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  33.33 
 
 		 510 aa  62  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2549  hypothetical protein  32.58 
 
 		 542 aa  61.6  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.170922  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  35.29 
 
 		 611 aa  62  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  32.04 
 
 		 497 aa  62  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  32.04 
 
 		 497 aa  62  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1849  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  32.03 
 
 		 511 aa  61.6  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.892343  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4844  hypothetical protein  31.62 
 
 		 579 aa  60.1  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.415691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1825  ATPase-like protein  33.04 
 
 		 1065 aa  60.5  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.071271 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  31.36 
 
 		 616 aa  60.5  0.00000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1906  hypothetical protein  29.91 
 
 		 579 aa  60.1  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000004225  normal  0.0184215 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  24.39 
 
 		 564 aa  60.1  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1716  ATPase-like protein  33.04 
 
 		 1065 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00601254 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  37.5 
 
 		 524 aa  59.7  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0453  protein of unknown function DUF87  33.33 
 
 		 568 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2778  hypothetical protein  31.47 
 
 		 580 aa  58.9  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145513  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  31.73 
 
 		 493 aa  59.3  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0321  hypothetical protein  34.38 
 
 		 499 aa  58.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  33.33 
 
 		 523 aa  58.5  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1585  protein of unknown function DUF87  30.77 
 
 		 572 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.049395 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>