207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1359 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  100 
 
 
570 aa  1154    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2238  protein of unknown function DUF87  42.38 
 
 
583 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  41.19 
 
 
584 aa  422  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  42.22 
 
 
628 aa  422  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2094  hypothetical protein  41.77 
 
 
582 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  41.42 
 
 
583 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  43.07 
 
 
612 aa  410  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  40.82 
 
 
617 aa  410  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3526  hypothetical protein  40.45 
 
 
583 aa  405  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543626  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5744  hypothetical protein  43.99 
 
 
590 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575418 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  39.36 
 
 
693 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1486  hypothetical protein  38.37 
 
 
560 aa  381  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  40.12 
 
 
544 aa  382  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  41.53 
 
 
569 aa  374  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  38.12 
 
 
569 aa  373  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  39.03 
 
 
674 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  39.02 
 
 
662 aa  371  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1803  hypothetical protein  37.71 
 
 
626 aa  364  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321314  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2792  protein of unknown function DUF87  39.03 
 
 
679 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.744858  normal  0.636348 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  29.58 
 
 
593 aa  234  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  27.22 
 
 
550 aa  226  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  28.11 
 
 
595 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  33.82 
 
 
546 aa  218  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  31.56 
 
 
575 aa  218  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  26.1 
 
 
607 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  30.37 
 
 
623 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  26.82 
 
 
594 aa  211  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  27.02 
 
 
591 aa  195  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  26.85 
 
 
679 aa  195  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  30.02 
 
 
709 aa  187  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  27.9 
 
 
599 aa  186  7e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  26.79 
 
 
577 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  30 
 
 
591 aa  182  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  29.46 
 
 
579 aa  178  2e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  34.36 
 
 
579 aa  176  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  26.38 
 
 
587 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  27.1 
 
 
526 aa  157  6e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  29.09 
 
 
559 aa  151  3e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  36.63 
 
 
664 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  30.47 
 
 
714 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  24.21 
 
 
603 aa  116  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  28.34 
 
 
616 aa  113  9e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  27.32 
 
 
608 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  33.61 
 
 
674 aa  111  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  26.25 
 
 
611 aa  110  6e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  23.7 
 
 
659 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  26.76 
 
 
520 aa  110  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  25.29 
 
 
564 aa  105  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  25.71 
 
 
605 aa  104  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  25.72 
 
 
496 aa  104  4e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  31 
 
 
709 aa  103  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  25.49 
 
 
492 aa  102  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  27.34 
 
 
531 aa  100  8e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  23.7 
 
 
497 aa  99.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  38.65 
 
 
670 aa  98.2  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  23.7 
 
 
497 aa  97.4  5e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  28.07 
 
 
524 aa  97.8  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  22.78 
 
 
496 aa  97.4  6e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  22.76 
 
 
497 aa  97.4  7e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  24.14 
 
 
493 aa  93.6  8e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  33.9 
 
 
557 aa  93.6  9e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  23.27 
 
 
600 aa  90.9  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  26.07 
 
 
557 aa  90.5  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  23.43 
 
 
500 aa  89.7  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  32.42 
 
 
563 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3715  hypothetical protein  32.3 
 
 
601 aa  88.6  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  23.15 
 
 
559 aa  87.4  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  26.79 
 
 
628 aa  85.5  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  24.51 
 
 
508 aa  84.3  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  31.25 
 
 
617 aa  83.6  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  28.87 
 
 
567 aa  79.3  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  32.08 
 
 
574 aa  78.6  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  24.64 
 
 
570 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  35.09 
 
 
560 aa  77.4  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  25.19 
 
 
581 aa  77.4  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  31.13 
 
 
561 aa  77  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  35.12 
 
 
523 aa  73.2  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  29.75 
 
 
510 aa  72  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  25.83 
 
 
427 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  40.37 
 
 
524 aa  68.9  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1752  protein of unknown function DUF87  40.78 
 
 
643 aa  68.2  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0753  protein of unknown function DUF87  29.33 
 
 
506 aa  67.4  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0799035  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1625  hypothetical protein  21.58 
 
 
783 aa  65.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2778  hypothetical protein  30.37 
 
 
580 aa  63.5  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145513  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  38.6 
 
 
360 aa  63.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  32.14 
 
 
523 aa  63.2  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1440  hypothetical protein  26.27 
 
 
539 aa  62  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.828058  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0326  hypothetical protein  28.67 
 
 
530 aa  61.6  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1865  hypothetical protein  36.36 
 
 
655 aa  61.2  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0131162 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2954  hypothetical protein  20.13 
 
 
589 aa  61.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000103337 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_268  hypothetical protein  28.67 
 
 
530 aa  61.2  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5115  hypothetical protein  33.04 
 
 
595 aa  60.5  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  35.57 
 
 
524 aa  60.5  0.00000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3041  protein of unknown function DUF87  33.04 
 
 
744 aa  59.7  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0018  protein of unknown function DUF87  21.88 
 
 
537 aa  58.9  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.989354  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2366  protein of unknown function DUF87  27.47 
 
 
592 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.250268  normal  0.14702 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2030  hypothetical protein  28.26 
 
 
589 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309935 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1389  hypothetical protein  33.04 
 
 
606 aa  58.9  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.103576 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1479  hypothetical protein  33.91 
 
 
580 aa  58.2  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0102316  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0349  protein of unknown function DUF87  20.38 
 
 
540 aa  58.2  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>