134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2778 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2778  hypothetical protein  100 
 
 
580 aa  1172    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145513  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2369  hypothetical protein  57.74 
 
 
659 aa  674    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70292  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1865  hypothetical protein  54.51 
 
 
655 aa  573  1.0000000000000001e-162  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0131162 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5115  hypothetical protein  67.15 
 
 
595 aa  461  9.999999999999999e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3041  protein of unknown function DUF87  66.86 
 
 
744 aa  462  9.999999999999999e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  33.59 
 
 
537 aa  140  7e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0355  ATPase-like protein  34.92 
 
 
250 aa  96.3  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5533  hypothetical protein  25.87 
 
 
608 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.423742  normal  0.336707 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5935  hypothetical protein  25.87 
 
 
608 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0918921  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  31.38 
 
 
550 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  29.38 
 
 
577 aa  75.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  35.24 
 
 
595 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  32 
 
 
508 aa  72.8  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  31.88 
 
 
579 aa  71.6  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  35.78 
 
 
496 aa  71.2  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  33.33 
 
 
557 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  28.28 
 
 
591 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  33.94 
 
 
579 aa  67.4  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  32.33 
 
 
664 aa  65.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  34.91 
 
 
594 aa  65.1  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3638  hypothetical protein  27.73 
 
 
500 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.689622  normal  0.0322237 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  31.62 
 
 
546 aa  63.5  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  29.41 
 
 
569 aa  63.5  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  33.33 
 
 
587 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  28.37 
 
 
569 aa  62.4  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  33.33 
 
 
659 aa  62.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  30.83 
 
 
593 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  30.72 
 
 
674 aa  62.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  34.03 
 
 
570 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  29.75 
 
 
591 aa  62.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  30.22 
 
 
617 aa  61.6  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  32.14 
 
 
427 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  28.28 
 
 
599 aa  61.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3442  hypothetical protein  27.2 
 
 
499 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.41425  normal  0.022696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3751  hypothetical protein  27.2 
 
 
499 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0972722  normal 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  28.05 
 
 
563 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  28.39 
 
 
544 aa  60.8  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  32.33 
 
 
574 aa  60.5  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  31.43 
 
 
600 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  31.47 
 
 
567 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  32.23 
 
 
559 aa  59.3  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  31.96 
 
 
570 aa  59.3  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  26.85 
 
 
714 aa  59.7  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  32.77 
 
 
670 aa  58.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  26.61 
 
 
524 aa  58.2  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5552  hypothetical protein  27.23 
 
 
498 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.508667  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2167  AAA ATPase  25.65 
 
 
507 aa  58.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.283139  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6263  hypothetical protein  26.36 
 
 
504 aa  57  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.311693 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2035  ATPase  26.36 
 
 
506 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3657  ATPase-like protein  25.32 
 
 
490 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16812  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  25.86 
 
 
693 aa  55.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  28.96 
 
 
679 aa  55.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0795  ATPase-like protein  29.86 
 
 
396 aa  55.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.412059  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7061  AAA ATPase  26.17 
 
 
500 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0332905  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  23.42 
 
 
709 aa  55.1  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  30.9 
 
 
623 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0213  hypothetical protein  29.26 
 
 
363 aa  55.1  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0846575  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  28.77 
 
 
607 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3413  ATPase  25.86 
 
 
516 aa  54.7  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.747505 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0484  hypothetical protein  26.82 
 
 
266 aa  54.7  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1337  hypothetical protein  26.26 
 
 
445 aa  54.3  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  36.49 
 
 
526 aa  54.3  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  26.53 
 
 
493 aa  54.3  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  29.81 
 
 
581 aa  53.9  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2157  AAA ATPase  25.97 
 
 
504 aa  53.9  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.969754  normal  0.641302 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2283  AAA ATPase  26.09 
 
 
511 aa  53.9  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1948  AAA ATPase  25.54 
 
 
503 aa  53.9  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.315114  normal  0.618024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0753  protein of unknown function DUF87  25.96 
 
 
506 aa  53.5  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0799035  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  33.01 
 
 
523 aa  53.5  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1579  ATPase-like protein  25.54 
 
 
498 aa  53.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0994986  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1920  hypothetical protein  26.58 
 
 
526 aa  53.5  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5744  hypothetical protein  30.43 
 
 
590 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575418 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  28.39 
 
 
608 aa  53.1  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  26.45 
 
 
575 aa  53.5  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0592  hypothetical protein  25 
 
 
498 aa  53.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000492944 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0349  protein of unknown function DUF87  27.01 
 
 
540 aa  52.4  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0461  ATPase  24.79 
 
 
492 aa  52.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  23.91 
 
 
531 aa  52.4  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  27.61 
 
 
561 aa  52.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2628  hypothetical protein  30 
 
 
351 aa  52.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.791354  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2792  protein of unknown function DUF87  24.2 
 
 
679 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.744858  normal  0.636348 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6246  AAA ATPase  25.6 
 
 
520 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  24.2 
 
 
674 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  25 
 
 
496 aa  51.6  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  29.01 
 
 
709 aa  51.2  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1720  ATPase  25.75 
 
 
504 aa  51.2  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4482  ATPase  25.22 
 
 
502 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.197027 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  28.36 
 
 
611 aa  51.2  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0715  HerA helicase  28.77 
 
 
409 aa  50.8  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  27.7 
 
 
497 aa  50.8  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2732  hypothetical protein  24.32 
 
 
510 aa  50.4  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393853  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  32.11 
 
 
616 aa  50.4  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0340  protein of unknown function DUF87  31.2 
 
 
379 aa  50.4  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0311557 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  32.61 
 
 
617 aa  50.1  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  32.61 
 
 
584 aa  50.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  27.84 
 
 
560 aa  50.4  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  27.61 
 
 
605 aa  49.7  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3526  hypothetical protein  33.7 
 
 
583 aa  50.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543626  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  27.03 
 
 
497 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1803  hypothetical protein  26.32 
 
 
626 aa  50.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>