43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0484 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0484  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  557  1e-158  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1723  hypothetical protein  46.79 
 
 
265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.544345  normal  0.0481225 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1374  protein of unknown function DUF87  29.46 
 
 
538 aa  56.6  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.627609 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2778  hypothetical protein  26.82 
 
 
580 aa  54.7  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145513  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  30.7 
 
 
579 aa  51.6  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2369  hypothetical protein  28.74 
 
 
659 aa  50.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70292  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  31.4 
 
 
557 aa  50.4  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1233  hypothetical protein  46.3 
 
 
199 aa  49.7  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.616715  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1865  hypothetical protein  28.25 
 
 
655 aa  49.7  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0131162 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0355  ATPase-like protein  26.14 
 
 
250 aa  49.3  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  32.47 
 
 
496 aa  47.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  30.43 
 
 
577 aa  47.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  35.48 
 
 
605 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2792  protein of unknown function DUF87  41.27 
 
 
679 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.744858  normal  0.636348 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  39.66 
 
 
526 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  43.33 
 
 
693 aa  47  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  35.38 
 
 
497 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  41.27 
 
 
674 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  35.38 
 
 
497 aa  47  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  33.85 
 
 
497 aa  46.2  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  44.07 
 
 
662 aa  46.2  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  29.84 
 
 
579 aa  45.8  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  30.65 
 
 
611 aa  45.4  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  38.18 
 
 
599 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  35 
 
 
581 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  32.43 
 
 
537 aa  45.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  32.26 
 
 
616 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  36.51 
 
 
570 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  30.95 
 
 
595 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  31.75 
 
 
493 aa  44.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  37.29 
 
 
591 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  29.03 
 
 
608 aa  44.3  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  27.56 
 
 
679 aa  43.9  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  31.75 
 
 
496 aa  43.1  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  31.75 
 
 
531 aa  43.1  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  30.68 
 
 
508 aa  43.1  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2238  protein of unknown function DUF87  40 
 
 
583 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  29.7 
 
 
593 aa  42.7  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  38.98 
 
 
628 aa  42.7  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3041  protein of unknown function DUF87  27.01 
 
 
744 aa  42.7  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  33.33 
 
 
623 aa  42.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  35.48 
 
 
607 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  31.82 
 
 
587 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>