128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1865 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1865  hypothetical protein  100 
 
 
655 aa  1315    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0131162 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2778  hypothetical protein  54.51 
 
 
580 aa  580  1e-164  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145513  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2369  hypothetical protein  51.42 
 
 
659 aa  578  1.0000000000000001e-163  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70292  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3041  protein of unknown function DUF87  68.45 
 
 
744 aa  479  1e-134  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5115  hypothetical protein  67.86 
 
 
595 aa  476  1e-133  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  33.2 
 
 
537 aa  137  5e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0355  ATPase-like protein  34.9 
 
 
250 aa  97.1  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5533  hypothetical protein  24.56 
 
 
608 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.423742  normal  0.336707 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5935  hypothetical protein  24.56 
 
 
608 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0918921  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  31.91 
 
 
550 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  35.24 
 
 
595 aa  74.7  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  44.83 
 
 
496 aa  71.2  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  32.8 
 
 
674 aa  66.6  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  28.99 
 
 
508 aa  65.9  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  30.34 
 
 
591 aa  65.5  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  32.43 
 
 
579 aa  64.3  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  33.33 
 
 
587 aa  63.9  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  29.08 
 
 
577 aa  63.9  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  29.31 
 
 
693 aa  63.5  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  31.43 
 
 
664 aa  62.4  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  31.65 
 
 
557 aa  62  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6263  hypothetical protein  27.73 
 
 
504 aa  62.4  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.311693 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3638  hypothetical protein  25.65 
 
 
500 aa  62  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.689622  normal  0.0322237 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  36.36 
 
 
570 aa  61.2  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1720  ATPase  26.86 
 
 
504 aa  61.2  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  32.33 
 
 
574 aa  60.8  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  27.64 
 
 
360 aa  60.8  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2283  AAA ATPase  25.11 
 
 
511 aa  60.8  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3442  hypothetical protein  25.78 
 
 
499 aa  60.5  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.41425  normal  0.022696 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1948  AAA ATPase  25.31 
 
 
503 aa  60.5  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.315114  normal  0.618024 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  30.83 
 
 
579 aa  59.7  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2157  AAA ATPase  25.41 
 
 
504 aa  60.1  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.969754  normal  0.641302 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  28.69 
 
 
591 aa  60.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3751  hypothetical protein  25.78 
 
 
499 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0972722  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1920  hypothetical protein  25.2 
 
 
526 aa  60.1  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  27.49 
 
 
569 aa  59.7  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  30.7 
 
 
714 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  31.4 
 
 
546 aa  58.9  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3657  ATPase-like protein  26.56 
 
 
490 aa  58.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16812  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5744  hypothetical protein  32.17 
 
 
590 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575418 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  29.58 
 
 
427 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  34.75 
 
 
569 aa  58.2  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2167  AAA ATPase  26.27 
 
 
507 aa  58.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.283139  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7061  AAA ATPase  25.22 
 
 
500 aa  57.8  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0332905  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2792  protein of unknown function DUF87  29.31 
 
 
679 aa  57.4  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.744858  normal  0.636348 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  28.57 
 
 
600 aa  57.4  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3413  ATPase  25.75 
 
 
516 aa  57.4  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.747505 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0795  ATPase-like protein  31.25 
 
 
396 aa  57.4  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.412059  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  29.31 
 
 
674 aa  57.4  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  31.63 
 
 
709 aa  56.6  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  30.53 
 
 
570 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  36.49 
 
 
526 aa  57  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2035  ATPase  26.75 
 
 
506 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  32.41 
 
 
659 aa  55.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  28.68 
 
 
581 aa  56.6  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  30.34 
 
 
607 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  29.2 
 
 
523 aa  55.5  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  29.13 
 
 
594 aa  55.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  28.03 
 
 
628 aa  55.5  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2732  hypothetical protein  23.95 
 
 
510 aa  55.1  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393853  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  26.61 
 
 
524 aa  55.1  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  29.31 
 
 
563 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  24.64 
 
 
531 aa  54.7  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  36.47 
 
 
593 aa  54.7  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1579  ATPase-like protein  27.12 
 
 
498 aa  55.1  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0994986  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  30.17 
 
 
544 aa  54.7  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  28.28 
 
 
709 aa  54.7  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  26.62 
 
 
617 aa  54.7  0.000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1632  hypothetical protein  25.91 
 
 
514 aa  54.3  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  39.02 
 
 
559 aa  54.3  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1515  AAA ATPase  24.28 
 
 
504 aa  54.3  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1534  hypothetical protein  25.33 
 
 
513 aa  53.1  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.74675  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  31.68 
 
 
617 aa  53.5  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2094  hypothetical protein  35.06 
 
 
582 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  35.06 
 
 
584 aa  53.9  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  30.97 
 
 
524 aa  53.1  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1483  hypothetical protein  25.33 
 
 
511 aa  53.9  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  30 
 
 
679 aa  53.5  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0592  hypothetical protein  23.18 
 
 
498 aa  53.9  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000492944 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  28.87 
 
 
623 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4482  ATPase  25.33 
 
 
502 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.197027 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  27.35 
 
 
599 aa  52.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  29 
 
 
612 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6246  AAA ATPase  24.55 
 
 
520 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2238  protein of unknown function DUF87  33.77 
 
 
583 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  28.7 
 
 
628 aa  52.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3526  hypothetical protein  35.06 
 
 
583 aa  52.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543626  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  31.58 
 
 
662 aa  52.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5552  hypothetical protein  23.58 
 
 
498 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.508667  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0461  ATPase  25.61 
 
 
492 aa  52  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  26.89 
 
 
493 aa  51.2  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1803  hypothetical protein  31.43 
 
 
626 aa  51.6  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321314  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  33.77 
 
 
583 aa  51.2  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  21.74 
 
 
557 aa  51.2  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1337  hypothetical protein  25.17 
 
 
445 aa  50.8  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  31.43 
 
 
567 aa  50.8  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  26.55 
 
 
523 aa  50.8  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  30.61 
 
 
670 aa  50.4  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0349  protein of unknown function DUF87  30.25 
 
 
540 aa  50.1  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  27.78 
 
 
616 aa  50.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>