53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0461 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0461  ATPase  100 
 
 		 492 aa  971    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1720  ATPase  66.12 
 
 		 504 aa  614  9.999999999999999e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3657  ATPase-like protein  59.67 
 
 		 490 aa  558  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7061  AAA ATPase  58.18 
 
 		 500 aa  521  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0332905  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1515  AAA ATPase  55.56 
 
 		 504 aa  508  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1920  hypothetical protein  54.16 
 
 		 526 aa  503  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1534  hypothetical protein  56.13 
 
 		 513 aa  500  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.74675  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1483  hypothetical protein  56.34 
 
 		 511 aa  501  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3413  ATPase  55.15 
 
 		 516 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.747505 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1948  AAA ATPase  54.34 
 
 		 503 aa  498  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.315114  normal  0.618024 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1632  hypothetical protein  56.3 
 
 		 514 aa  496  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2167  AAA ATPase  54.82 
 
 		 507 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.283139  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6263  hypothetical protein  55.98 
 
 		 504 aa  492  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311693 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2157  AAA ATPase  54.75 
 
 		 504 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.969754  normal  0.641302 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6246  AAA ATPase  58.13 
 
 		 520 aa  491  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1579  ATPase-like protein  55.58 
 
 		 498 aa  488  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0994986  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2035  ATPase  54.75 
 
 		 506 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2732  hypothetical protein  55.22 
 
 		 510 aa  489  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393853  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5552  hypothetical protein  54.73 
 
 		 498 aa  484  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.508667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2283  AAA ATPase  54.89 
 
 		 511 aa  482  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3638  hypothetical protein  54.42 
 
 		 500 aa  477  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.689622  normal  0.0322237 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3442  hypothetical protein  54.82 
 
 		 499 aa  476  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.41425  normal  0.022696 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4482  ATPase  54.18 
 
 		 502 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.197027 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3751  hypothetical protein  54.82 
 
 		 499 aa  474  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0972722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0592  hypothetical protein  54.95 
 
 		 498 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000492944 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  29.89 
 
 		 537 aa  96.7  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0355  ATPase-like protein  24.29 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2369  hypothetical protein  25.42 
 
 		 659 aa  59.7  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3041  protein of unknown function DUF87  26.16 
 
 		 744 aa  57.8  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5115  hypothetical protein  26.25 
 
 		 595 aa  55.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  30.99 
 
 		 360 aa  53.9  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2778  hypothetical protein  24.79 
 
 		 580 aa  53.5  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145513  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1865  hypothetical protein  25.61 
 
 		 655 aa  52.8  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0131162 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  26.5 
 
 		 524 aa  50.4  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  27.81 
 
 		 581 aa  50.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  28.09 
 
 		 508 aa  50.1  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  32.48 
 
 		 524 aa  50.1  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1423  HAD family hydrolase  33.88 
 
 		 550 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8838  hypothetical protein  34.84 
 
 		 572 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  26.67 
 
 		 611 aa  47.4  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2164  hypothetical protein  32.41 
 
 		 582 aa  47  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000710411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1100  HAD family hydrolase  29.73 
 
 		 554 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.261757  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1117  HAD family hydrolase  29.73 
 
 		 554 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.293003  normal  0.951396 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1450  protein of unknown function DUF87  25.74 
 
 		 581 aa  45.8  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0452751  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0804  protein of unknown function DUF87  24.34 
 
 		 629 aa  45.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1233  hypothetical protein  25.67 
 
 		 199 aa  45.8  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.616715  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  26.5 
 
 		 523 aa  45.8  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1389  hypothetical protein  31.21 
 
 		 606 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.103576 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0756  hypothetical protein  28.99 
 
 		 645 aa  45.4  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00608077 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3967  AAA ATPase  40.85 
 
 		 1046 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1138  hypothetical protein  25.85 
 
 		 902 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  29.82 
 
 		 579 aa  43.5  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  24.24 
 
 		 608 aa  43.1  0.01  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>