193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8838 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8838  hypothetical protein  100 
 
 
572 aa  1132    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1945  HAD family hydrolase  52.23 
 
 
250 aa  243  5e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.238634 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1727  HAD family hydrolase  57.52 
 
 
227 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1100  HAD family hydrolase  32.52 
 
 
554 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.261757  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1117  HAD family hydrolase  32.52 
 
 
554 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.293003  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1423  HAD family hydrolase  31.42 
 
 
550 aa  177  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0730  SPP-like hydrolase  32.44 
 
 
222 aa  85.5  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.842566  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2884  SPP-like hydrolase  30.22 
 
 
233 aa  74.7  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1101  HAD family hydrolase  26.58 
 
 
228 aa  63.2  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.744434  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0126  Cof-like hydrolase  28.57 
 
 
285 aa  59.7  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0257  hydrolase  27.73 
 
 
240 aa  59.7  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.509124  hitchhiker  0.000575913 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0774  HAD superfamily hydrolase  24.26 
 
 
273 aa  59.3  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0959252  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0388  HAD superfamily hydrolase  23.46 
 
 
270 aa  57.8  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3699  Cof-like hydrolase  39.29 
 
 
265 aa  57  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3183  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.01 
 
 
265 aa  56.6  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0375981 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2103  Cof-like hydrolase  26.56 
 
 
281 aa  57  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.519808 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1070  SPP-like hydrolase  26.89 
 
 
228 aa  56.2  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0195406  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1534  hypothetical protein  38.58 
 
 
513 aa  56.2  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.74675  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7012  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.75 
 
 
261 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00675343  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1483  hypothetical protein  38.58 
 
 
511 aa  56.2  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1632  hypothetical protein  38.58 
 
 
514 aa  55.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0569  Cof-like hydrolase  22.26 
 
 
271 aa  55.1  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122616  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2337  phosphoglycolate phosphatase  22.97 
 
 
226 aa  54.7  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.488898  normal  0.0135027 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0834  HAD superfamily hydrolase  25 
 
 
280 aa  55.1  0.000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4220  putative hydrolase  22.27 
 
 
244 aa  54.7  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4241  hydrolase, Cof family  22.27 
 
 
244 aa  54.3  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  22.64 
 
 
266 aa  54.7  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0883  Cof-like hydrolase  23.26 
 
 
269 aa  54.3  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1377  HAD superfamily hydrolase  22.85 
 
 
270 aa  53.9  0.000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.110042  hitchhiker  0.00000000000523684 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0746  Cof-like hydrolase  23.13 
 
 
273 aa  53.9  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6168  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  36.14 
 
 
268 aa  53.5  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  24.54 
 
 
270 aa  53.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4398  Cof family hydrolase  22.13 
 
 
244 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  23.77 
 
 
266 aa  52.4  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3874  HAD family hydrolase  24.48 
 
 
260 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0597322 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  26.62 
 
 
271 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3751  hypothetical protein  39.84 
 
 
499 aa  52  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0972722  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0362  HAD superfamily hydrolase  23.42 
 
 
270 aa  52  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.133771  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3442  hypothetical protein  39.84 
 
 
499 aa  52  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.41425  normal  0.022696 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3638  hypothetical protein  39.06 
 
 
500 aa  52  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.689622  normal  0.0322237 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1616  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  23.62 
 
 
237 aa  52  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1724  HAD superfamily hydrolase  21.76 
 
 
265 aa  52  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000483617  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0175  HAD family hydrolase  26.22 
 
 
282 aa  52  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  27.48 
 
 
267 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0971  Cof-like hydrolase  20.54 
 
 
274 aa  52  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.254704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0990  Cof-like hydrolase  20.54 
 
 
274 aa  52  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00398  thiamin pyrimidine pyrophosphate hydrolase  25 
 
 
272 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0489  hydrolase Cof  25 
 
 
272 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30895  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0369  hydrolase Cof  25 
 
 
272 aa  50.8  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00402  hypothetical protein  25 
 
 
272 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0482  hydrolase Cof  25 
 
 
272 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0523  hydrolase Cof  25 
 
 
272 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3163  Cof-like hydrolase  25 
 
 
272 aa  50.8  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1845  HAD superfamily hydrolase  39.06 
 
 
269 aa  50.8  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.38 
 
 
278 aa  50.4  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.384246  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  36.36 
 
 
273 aa  50.4  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1220  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  22.64 
 
 
269 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1184  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.57 
 
 
297 aa  49.7  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.24726  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2130  SPP-like hydrolase  25.7 
 
 
222 aa  50.1  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000000113582  hitchhiker  0.0000579549 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0414  Cof-like hydrolase  24.55 
 
 
268 aa  50.4  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0522924  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0534  hydrolase Cof  24.57 
 
 
272 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1091  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.57 
 
 
297 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.024164  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0279  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  41.38 
 
 
308 aa  49.3  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.333001  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0685  SPP-like hydrolase  23.83 
 
 
231 aa  49.7  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0141  Cof-like hydrolase  28.57 
 
 
284 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1278  phosphotransferase  21.9 
 
 
273 aa  49.7  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1965  SPP-like hydrolase  27.68 
 
 
230 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0481119  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1119  SPP-like hydrolase  28.9 
 
 
227 aa  48.5  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.660919  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3056  phosphotransferase  22.26 
 
 
273 aa  48.5  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0293  Cof-like hydrolase  26.95 
 
 
268 aa  48.9  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1267  Alpha-amylase  30.23 
 
 
490 aa  48.9  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.365279  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3948  Cof-like hydrolase  23.22 
 
 
274 aa  48.1  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  43.86 
 
 
285 aa  48.1  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3241  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.81 
 
 
274 aa  48.1  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0461  ATPase  34.84 
 
 
492 aa  48.1  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  37.35 
 
 
271 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  31.65 
 
 
281 aa  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  37.35 
 
 
271 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1919  SPP-like hydrolase  34.74 
 
 
234 aa  48.1  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  31.65 
 
 
281 aa  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4525  Cof-like hydrolase  40.48 
 
 
273 aa  48.5  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.992091 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0278  Cof-like hydrolase  24.1 
 
 
268 aa  48.1  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153774  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5035  HAD family hydrolase  38.1 
 
 
273 aa  48.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  31.65 
 
 
281 aa  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0870  HAD superfamily hydrolase  34.25 
 
 
281 aa  47.8  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000525914  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1515  AAA ATPase  34.68 
 
 
504 aa  47.8  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0732  Cof-like hydrolase  22.63 
 
 
287 aa  47.8  0.0006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4318  Cof protein  26.92 
 
 
264 aa  47.8  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.873657 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1545  Cof-like hydrolase  22.69 
 
 
268 aa  47.4  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2283  AAA ATPase  37.33 
 
 
511 aa  47.4  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1720  ATPase  35.43 
 
 
504 aa  47.4  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0559  putative HAD superfamily hydrolase  29.76 
 
 
281 aa  47.4  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0605487  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3081  Cof-like hydrolase  28.74 
 
 
283 aa  47.4  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313968  hitchhiker  0.00000030315 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0840  Cof-like hydrolase  22.96 
 
 
273 aa  47.4  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.381548 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1075  Cof-like hydrolase  22.26 
 
 
269 aa  47.4  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1653  hypothetical protein  30.77 
 
 
407 aa  47  0.0009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  28.92 
 
 
276 aa  47  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  31.65 
 
 
270 aa  46.6  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  32.47 
 
 
270 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1105  HAD superfamily hydrolase  32.53 
 
 
273 aa  46.6  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>