81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3967 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3967  AAA ATPase  100 
 
 
1046 aa  2112    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5149  AAA ATPase  38.15 
 
 
1031 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120671  normal  0.52051 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1183  AAA ATPase  37.59 
 
 
1043 aa  599  1e-170  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3423  AAA ATPase  35.4 
 
 
1104 aa  533  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.598451  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1484  hypothetical protein  44.43 
 
 
1144 aa  434  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0469742  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1184  ATPase  31.35 
 
 
1071 aa  426  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2709  ATPase-like  28.83 
 
 
1106 aa  422  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5114  AAA ATPase  31.88 
 
 
1076 aa  388  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078899 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5089  AAA ATPase  51.09 
 
 
1100 aa  379  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0231758  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2632  ATPase  50.33 
 
 
319 aa  283  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.57356 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2631  hypothetical protein  32.11 
 
 
886 aa  237  8e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.703653 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4031  hypothetical protein  27.44 
 
 
802 aa  110  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3326  hypothetical protein  27.6 
 
 
800 aa  107  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000795061  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2606  hypothetical protein  27.86 
 
 
1050 aa  105  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320925  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1346  hypothetical protein  28 
 
 
859 aa  95.5  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2242  hypothetical protein  27.83 
 
 
658 aa  95.1  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1505  hypothetical protein  24.18 
 
 
753 aa  92.4  4e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3193  hypothetical protein  27.95 
 
 
653 aa  89  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  27.4 
 
 
605 aa  87  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  26.67 
 
 
608 aa  86.7  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1696  hypothetical protein  23.31 
 
 
764 aa  85.9  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000294033  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0983  hypothetical protein  22.13 
 
 
762 aa  85.1  0.000000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.137038  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  25.69 
 
 
611 aa  84.7  0.000000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0239  hypothetical protein  23.5 
 
 
734 aa  84  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.72436  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  25.71 
 
 
496 aa  83.2  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1085  hypothetical protein  25.2 
 
 
847 aa  80.9  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  26.29 
 
 
508 aa  80.5  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  25.06 
 
 
557 aa  78.6  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  25.68 
 
 
616 aa  78.6  0.0000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1236  hypothetical protein  26.51 
 
 
859 aa  77.8  0.0000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1311  hypothetical protein  25.91 
 
 
847 aa  77.4  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  27.76 
 
 
628 aa  77.4  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  22.47 
 
 
523 aa  62.4  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  23.51 
 
 
524 aa  61.6  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  23.12 
 
 
524 aa  61.2  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  28.12 
 
 
360 aa  58.5  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  25.93 
 
 
523 aa  57.4  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  22.69 
 
 
524 aa  54.3  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  21.85 
 
 
492 aa  53.9  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  24.15 
 
 
564 aa  54.3  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  26.83 
 
 
709 aa  53.9  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0321  hypothetical protein  23.86 
 
 
499 aa  53.5  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0343  hypothetical protein  23.87 
 
 
499 aa  53.1  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  25.83 
 
 
546 aa  52.4  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  25 
 
 
559 aa  52.8  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1283  hypothetical protein  21.96 
 
 
517 aa  50.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608046  normal  0.929249 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  24.44 
 
 
557 aa  50.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  25.34 
 
 
607 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  26.12 
 
 
569 aa  49.7  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  20.48 
 
 
563 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  27.54 
 
 
679 aa  49.3  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  28.7 
 
 
575 aa  48.9  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  24.48 
 
 
531 aa  48.5  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3713  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  24.27 
 
 
580 aa  48.5  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  22.67 
 
 
526 aa  48.5  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  23.28 
 
 
579 aa  48.1  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0444  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  24.42 
 
 
524 aa  47.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0693836  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6133  ATPase-like protein  28.85 
 
 
630 aa  48.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.869987  normal  0.698643 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  22.95 
 
 
599 aa  47.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1111  type IV secretion system protein VirD4  28.34 
 
 
509 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1259  protein of unknown function DUF87  20.86 
 
 
540 aa  47  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0047  hypothetical protein  28.44 
 
 
486 aa  47  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0915  hypothetical protein  23.24 
 
 
463 aa  46.6  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  28 
 
 
623 aa  46.2  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  20 
 
 
500 aa  45.8  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  27.08 
 
 
537 aa  45.8  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4029  ATPase-like protein  28.3 
 
 
580 aa  45.8  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.878422 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1724  ATPase  26.61 
 
 
585 aa  45.8  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  26.79 
 
 
550 aa  46.2  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1018  ATPase  23.24 
 
 
463 aa  45.4  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1515  protein of unknown function DUF87  37.5 
 
 
530 aa  45.4  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.649754  normal  0.132485 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  25.19 
 
 
591 aa  45.4  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  24.11 
 
 
593 aa  45.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1553  hypothetical protein  30.84 
 
 
582 aa  45.1  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.623642 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  26.98 
 
 
569 aa  45.1  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  22.94 
 
 
709 aa  45.1  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  18.35 
 
 
496 aa  45.1  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0461  ATPase  40.85 
 
 
492 aa  45.1  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  20.92 
 
 
595 aa  45.1  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  21.99 
 
 
579 aa  44.7  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3642  ATPase-like  22.36 
 
 
558 aa  44.7  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.361749  normal  0.410506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>