46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6246 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7061  AAA ATPase  93.09 
 
 		 500 aa  854    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0332905  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6246  AAA ATPase  100 
 
 		 520 aa  1004    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2283  AAA ATPase  69.57 
 
 		 511 aa  632  1e-180  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1483  hypothetical protein  67.47 
 
 		 511 aa  621  1e-176  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1534  hypothetical protein  66.54 
 
 		 513 aa  615  1e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.74675  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1632  hypothetical protein  67.55 
 
 		 514 aa  607  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1920  hypothetical protein  63.71 
 
 		 526 aa  592  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1948  AAA ATPase  64.04 
 
 		 503 aa  594  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.315114  normal  0.618024 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5552  hypothetical protein  67.54 
 
 		 498 aa  591  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.508667  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2157  AAA ATPase  63.17 
 
 		 504 aa  587  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.969754  normal  0.641302 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3442  hypothetical protein  66.26 
 
 		 499 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.41425  normal  0.022696 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3638  hypothetical protein  66.46 
 
 		 500 aa  581  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.689622  normal  0.0322237 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3751  hypothetical protein  66.05 
 
 		 499 aa  580  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0972722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1579  ATPase-like protein  66.13 
 
 		 498 aa  578  1.0000000000000001e-163  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0994986  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2167  AAA ATPase  62.98 
 
 		 507 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.283139  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3413  ATPase  63.4 
 
 		 516 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.747505 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6263  hypothetical protein  63.73 
 
 		 504 aa  569  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311693 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1515  AAA ATPase  61.74 
 
 		 504 aa  567  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2035  ATPase  62.9 
 
 		 506 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2732  hypothetical protein  64.14 
 
 		 510 aa  555  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393853  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3657  ATPase-like protein  62.4 
 
 		 490 aa  546  1e-154  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4482  ATPase  60.84 
 
 		 502 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.197027 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0592  hypothetical protein  62.28 
 
 		 498 aa  529  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000492944 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0461  ATPase  58.13 
 
 		 492 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1720  ATPase  59.62 
 
 		 504 aa  497  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  29.14 
 
 		 537 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3041  protein of unknown function DUF87  27.73 
 
 		 744 aa  57.4  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0355  ATPase-like protein  21.5 
 
 		 250 aa  54.3  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1865  hypothetical protein  24.55 
 
 		 655 aa  53.5  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0131162 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2369  hypothetical protein  25.11 
 
 		 659 aa  52.8  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5115  hypothetical protein  28.08 
 
 		 595 aa  53.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5935  hypothetical protein  33.52 
 
 		 608 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0918921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5533  hypothetical protein  33.52 
 
 		 608 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.423742  normal  0.336707 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2778  hypothetical protein  25.6 
 
 		 580 aa  51.6  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145513  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1423  HAD family hydrolase  34.04 
 
 		 550 aa  50.4  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0804  protein of unknown function DUF87  25.76 
 
 		 629 aa  48.5  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  27.43 
 
 		 628 aa  47.8  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2164  hypothetical protein  29.91 
 
 		 582 aa  46.6  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000710411 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5114  AAA ATPase  30.77 
 
 		 1076 aa  45.8  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078899 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  25.95 
 
 		 574 aa  45.8  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  24.82 
 
 		 524 aa  44.7  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1450  protein of unknown function DUF87  33.33 
 
 		 581 aa  44.7  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0452751  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  37.5 
 
 		 579 aa  44.3  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  28.49 
 
 		 524 aa  44.3  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  25.81 
 
 		 508 aa  43.9  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  25.77 
 
 		 611 aa  43.9  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>