70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2035 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2167  AAA ATPase  88.36 
 
 		 507 aa  895    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.283139  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2035  ATPase  100 
 
 		 506 aa  1013    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1579  ATPase-like protein  75.95 
 
 		 498 aa  727    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0994986  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4482  ATPase  84.98 
 
 		 502 aa  827    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.197027 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3413  ATPase  93.24 
 
 		 516 aa  950    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.747505 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6263  hypothetical protein  84.74 
 
 		 504 aa  849    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311693 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0592  hypothetical protein  63.05 
 
 		 498 aa  580  1e-164  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000492944 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1483  hypothetical protein  60.62 
 
 		 511 aa  575  1.0000000000000001e-163  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2283  AAA ATPase  62.48 
 
 		 511 aa  573  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_004310  BR1534  hypothetical protein  60.43 
 
 		 513 aa  572  1.0000000000000001e-162  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.74675  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2732  hypothetical protein  61.88 
 
 		 510 aa  568  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393853  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1632  hypothetical protein  62.27 
 
 		 514 aa  567  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7061  AAA ATPase  62.72 
 
 		 500 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0332905  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1948  AAA ATPase  60.16 
 
 		 503 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.315114  normal  0.618024 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1920  hypothetical protein  59.6 
 
 		 526 aa  553  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2157  AAA ATPase  60.52 
 
 		 504 aa  548  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.969754  normal  0.641302 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1515  AAA ATPase  59.92 
 
 		 504 aa  544  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6246  AAA ATPase  61.43 
 
 		 520 aa  521  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5552  hypothetical protein  59.88 
 
 		 498 aa  520  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.508667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3638  hypothetical protein  60.59 
 
 		 500 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.689622  normal  0.0322237 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3657  ATPase-like protein  56.51 
 
 		 490 aa  512  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3442  hypothetical protein  60.08 
 
 		 499 aa  510  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.41425  normal  0.022696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3751  hypothetical protein  60.08 
 
 		 499 aa  509  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0972722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0461  ATPase  54.22 
 
 		 492 aa  483  1e-135  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1720  ATPase  54.36 
 
 		 504 aa  477  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  28.62 
 
 		 537 aa  96.7  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3041  protein of unknown function DUF87  27.24 
 
 		 744 aa  62.4  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0355  ATPase-like protein  23.29 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5115  hypothetical protein  27.78 
 
 		 595 aa  58.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1865  hypothetical protein  26.75 
 
 		 655 aa  57  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0131162 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2778  hypothetical protein  26.36 
 
 		 580 aa  56.2  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145513  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2369  hypothetical protein  27.05 
 
 		 659 aa  55.5  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  26.51 
 
 		 523 aa  52.8  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5935  hypothetical protein  27.95 
 
 		 608 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0918921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  29.66 
 
 		 628 aa  52  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5533  hypothetical protein  27.95 
 
 		 608 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.423742  normal  0.336707 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2164  hypothetical protein  31.78 
 
 		 582 aa  51.2  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000710411 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  27.71 
 
 		 524 aa  50.4  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5114  AAA ATPase  29.31 
 
 		 1076 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078899 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0756  hypothetical protein  31.63 
 
 		 645 aa  48.5  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00608077 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  26.67 
 
 		 611 aa  46.6  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  26.28 
 
 		 577 aa  46.6  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  27.78 
 
 		 581 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  26.22 
 
 		 524 aa  45.8  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3423  AAA ATPase  30.52 
 
 		 1104 aa  45.8  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.598451  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  26.27 
 
 		 524 aa  45.8  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  27.63 
 
 		 664 aa  45.8  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  30.08 
 
 		 574 aa  45.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4444  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.66 
 
 		 908 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  27.03 
 
 		 579 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4578  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.66 
 
 		 908 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211608  normal  0.637963 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  25.15 
 
 		 508 aa  44.7  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1032  putative cell division protein FtsK  28.33 
 
 		 1725 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0718321  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0835  putative cell division protein FtsK  28.33 
 
 		 1725 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.816405  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  25.83 
 
 		 360 aa  44.3  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1924  cell division protein FtsK, putative  28.33 
 
 		 1725 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0315  putative cell division protein FtsK  28.33 
 
 		 1725 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10146  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1233  hypothetical protein  23.53 
 
 		 199 aa  44.3  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.616715  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1450  protein of unknown function DUF87  28.3 
 
 		 581 aa  43.9  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0452751  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1596  DNA translocase FtsK  27.23 
 
 		 1123 aa  43.9  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262939  normal  0.732523 
 
 
-
 
NC_003296  RS01655  hypothetical protein  27.04 
 
 		 959 aa  44.3  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.273957  normal  0.0637892 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  22.84 
 
 		 557 aa  43.9  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  35.21 
 
 		 570 aa  43.9  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1193  DNA translocase FtsK  28.33 
 
 		 1851 aa  43.9  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1185  DNA translocase FtsK  28.33 
 
 		 1834 aa  43.9  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1344  hypothetical protein  28.33 
 
 		 1851 aa  43.9  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  24.65 
 
 		 608 aa  43.9  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0976  cell division protein FtsK  27.9 
 
 		 1784 aa  43.5  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8838  hypothetical protein  34.71 
 
 		 572 aa  43.5  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  25.95 
 
 		 567 aa  43.5  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>