More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4578 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2152  cell divisionFtsK/SpoIIIE  67.59 
 
 
781 aa  659    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.356378  normal  0.85601 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0756  cell divisionFtsK/SpoIIIE  67.54 
 
 
803 aa  650    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0143018 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2990  DNA translocase FtsK  68.08 
 
 
822 aa  674    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2089  cell division FtsK/SpoIIIE  81.73 
 
 
1369 aa  808    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.123454 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2341  cell division ftsk transmembrane protein  67.4 
 
 
781 aa  661    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.86356  normal  0.195593 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2240  cell divisionFtsK/SpoIIIE  79.92 
 
 
1610 aa  806    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.751818 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0835  putative cell division protein FtsK  81.78 
 
 
1725 aa  816    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.816405  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0956  cell divisionFtsK/SpoIIIE  80.72 
 
 
1707 aa  818    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.810802  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3211  cell divisionFtsK/SpoIIIE  66.22 
 
 
818 aa  680    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.129812  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1032  putative cell division protein FtsK  81.78 
 
 
1725 aa  816    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0718321  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3426  DNA translocase FtsK  66.27 
 
 
779 aa  646    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.643705  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1120  DNA translocase FtsK  67.61 
 
 
777 aa  672    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.149955 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1759  cell division FtsK/SpoIIIE  64.89 
 
 
777 aa  652    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2622  cell division protein FtsK  68.08 
 
 
768 aa  675    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.436072  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1924  cell division protein FtsK, putative  81.78 
 
 
1725 aa  816    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2122  cell division protein FtsK  68.08 
 
 
822 aa  674    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204581  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0635  cell division FtsK/SpoIIIE  68.5 
 
 
755 aa  666    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1295  DNA translocase FtsK  69.39 
 
 
768 aa  667    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.65138  normal  0.354851 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1445  DNA translocase FtsK  86.65 
 
 
1107 aa  889    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.64751  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2600  DNA translocase FtsK  67.26 
 
 
774 aa  657    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1002  DNA translocase FtsK  72.03 
 
 
757 aa  690    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0837246  normal  0.0587694 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1344  hypothetical protein  81.78 
 
 
1851 aa  818    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3077  cell division ftsk transmembrane protein  68.08 
 
 
822 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.737589  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1243  cell divisionFtsK/SpoIIIE  81.67 
 
 
1485 aa  799    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1038  cell divisionFtsK/SpoIIIE  68.28 
 
 
770 aa  662    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.648604 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4078  DNA translocase FtsK  67.27 
 
 
769 aa  660    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5663  DNA translocase FtsK  80.32 
 
 
1673 aa  809    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.793927  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5363  cell divisionFtsK/SpoIIIE  65.64 
 
 
787 aa  670    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.52695 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1185  DNA translocase FtsK  81.78 
 
 
1834 aa  817    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0847  cell divisionFtsK/SpoIIIE  67.55 
 
 
769 aa  662    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1161  cell divisionFtsK/SpoIIIE  66.06 
 
 
770 aa  656    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.112052 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0315  putative cell division protein FtsK  81.78 
 
 
1725 aa  816    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10146  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0176  cell division FtsK/SpoIIIE  65 
 
 
776 aa  677    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1193  DNA translocase FtsK  81.78 
 
 
1851 aa  818    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2720  cell divisionFtsK/SpoIIIE  64.86 
 
 
776 aa  678    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0976  cell division protein FtsK  81.98 
 
 
1784 aa  817    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1561  cell division protein FtsK  67.88 
 
 
819 aa  672    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1990  cell division protein FtsK  68.08 
 
 
768 aa  675    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3043  DNA translocase FtsK  68.08 
 
 
768 aa  675    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.517068  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3178  cell divisionFtsK/SpoIIIE  67.82 
 
 
784 aa  655    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1124  DNA translocase FtsK  69.92 
 
 
765 aa  671    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.530393 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3799  DNA translocase FtsK  65.47 
 
 
781 aa  654    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3303  DNA translocase FtsK  81.47 
 
 
1430 aa  797    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190344  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3441  DNA translocase FtsK  68.28 
 
 
771 aa  662    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.639772 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0685  DNA translocase FtsK  66.73 
 
 
775 aa  660    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.579249  normal  0.40602 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1596  DNA translocase FtsK  86.97 
 
 
1123 aa  920    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262939  normal  0.732523 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2344  cell divisionFtsK/SpoIIIE  79.92 
 
 
1527 aa  806    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0427458 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2423  cell divisionFtsK/SpoIIIE  67.35 
 
 
779 aa  660    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0496  cell divisionFtsK/SpoIIIE  67.35 
 
 
769 aa  659    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1709  cell divisionFtsK/SpoIIIE  80.12 
 
 
1527 aa  809    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0936  cell divisionFtsK/SpoIIIE  67.55 
 
 
769 aa  661    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.470674  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2460  cell divisionFtsK/SpoIIIE  63.93 
 
 
837 aa  635    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000438856  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4444  cell divisionFtsK/SpoIIIE  100 
 
 
908 aa  1793    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434451  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2556  cell divisionFtsK/SpoIIIE  68.35 
 
 
781 aa  662    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0790  cell division protein FtsK  68.08 
 
 
822 aa  674    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1764  cell divisionFtsK/SpoIIIE  68.3 
 
 
763 aa  655    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.947558  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4578  cell divisionFtsK/SpoIIIE  100 
 
 
908 aa  1793    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211608  normal  0.637963 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0690  cell division FtsK/SpoIIIE  64.27 
 
 
770 aa  660    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0835  cell divisionFtsK/SpoIIIE  67.68 
 
 
769 aa  668    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2360  cell divisionFtsK/SpoIIIE  80.12 
 
 
1640 aa  808    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1285  cell divisionFtsK/SpoIIIE  66.1 
 
 
799 aa  682    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139445  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3382  DNA translocase FtsK  67.86 
 
 
776 aa  677    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.265787 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0975  cell divisionFtsK/SpoIIIE  67.35 
 
 
769 aa  659    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2321  cell divisionFtsK/SpoIIIE  80.12 
 
 
1527 aa  809    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.800211  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1719  cell divisionFtsK/SpoIIIE  65.05 
 
 
1157 aa  626  1e-178  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2360  cell divisionFtsK/SpoIIIE  64.15 
 
 
1202 aa  623  1e-177  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.647961  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06128  DNA translocase FtsK  65.32 
 
 
786 aa  624  1e-177  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185359  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0704  cell divisionFtsK/SpoIIIE  63.37 
 
 
784 aa  622  1e-177  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01038  DNA translocase FtsK  65.32 
 
 
786 aa  624  1e-177  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.37301  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1519  cell divisionFtsK/SpoIIIE  65.19 
 
 
786 aa  620  1e-176  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0546  cell divisionFtsK/SpoIIIE  64.21 
 
 
733 aa  621  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.803279  hitchhiker  0.0000950013 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0793  cell division protein  62.97 
 
 
784 aa  619  1e-176  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1933  cell divisionFtsK/SpoIIIE  64.31 
 
 
786 aa  618  1e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.440835  normal  0.487385 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2388  DNA translocase FtsK  56.36 
 
 
802 aa  618  1e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0162583 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2004  DNA translocase FtsK  59.03 
 
 
769 aa  617  1e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2593  cell division protein FtsK  64.43 
 
 
804 aa  615  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30290  cell division protein FtsK  64.43 
 
 
811 aa  616  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1827  cell divisionFtsK/SpoIIIE  63.01 
 
 
789 aa  615  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.346925  hitchhiker  0.00000783388 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3349  cell division protein FtsK  60 
 
 
801 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.293432  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1829  cell divisionFtsK/SpoIIIE  56.24 
 
 
831 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0290854 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1772  cell division protein FtsK, putative  61.6 
 
 
928 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00023204  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2685  cell divisionFtsK/SpoIIIE  57.71 
 
 
1310 aa  615  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00501186  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3609  cell divisionFtsK/SpoIIIE  55.68 
 
 
807 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1613  DNA translocase FtsK  64.15 
 
 
1299 aa  613  9.999999999999999e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00457522  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2596  DNA translocase FtsK  57.71 
 
 
1310 aa  615  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.0000000000551266  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4004  cell divisionFtsK/SpoIIIE  56.02 
 
 
834 aa  611  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500623 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2191  cell divisionFtsK/SpoIIIE  62.42 
 
 
917 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000178712  normal  0.118465 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3179  cell divisionFtsK/SpoIIIE protein  62.55 
 
 
801 aa  611  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2156  cell divisionFtsK/SpoIIIE  62.42 
 
 
917 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000852872  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2323  cell divisionFtsK/SpoIIIE  62.42 
 
 
917 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000157277  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2483  cell divisionFtsK/SpoIIIE  61 
 
 
850 aa  610  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000281786  hitchhiker  0.000000825037 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2436  DNA translocase FtsK  62.75 
 
 
1085 aa  609  1e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.277561  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1963  DNA translocase FtsK  58.81 
 
 
914 aa  609  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000218677  normal  0.918259 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2050  DNA translocase FtsK  58.81 
 
 
917 aa  609  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000503772  hitchhiker  0.00152361 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2215  cell divisionFtsK/SpoIIIE  62.42 
 
 
917 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000327747  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3408  cell divisionFtsK/SpoIIIE  55.81 
 
 
819 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.336852 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1693  DNA translocase FtsK  61.51 
 
 
782 aa  608  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.782698  normal  0.477366 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2260  cell divisionFtsK/SpoIIIE  62.87 
 
 
1174 aa  608  9.999999999999999e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.535537  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2013  DNA translocase FtsK  58.44 
 
 
913 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00817822  normal  0.0372318 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1795  cell divisionFtsK/SpoIIIE  62.1 
 
 
884 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00936905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>