116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5114 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1184  ATPase  46.44 
 
 		 1071 aa  847    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5114  AAA ATPase  100 
 
 		 1076 aa  2117    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078899 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2709  ATPase-like  34.95 
 
 		 1106 aa  622  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5089  AAA ATPase  36.58 
 
 		 1100 aa  529  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0231758  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1183  AAA ATPase  34.65 
 
 		 1043 aa  525  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3423  AAA ATPase  33.39 
 
 		 1104 aa  442  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.598451  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3967  AAA ATPase  32.35 
 
 		 1046 aa  385  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1484  hypothetical protein  41.28 
 
 		 1144 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0469742  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2632  ATPase  47.59 
 
 		 319 aa  267  7e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.57356 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2631  hypothetical protein  31.2 
 
 		 886 aa  230  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.703653 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5149  AAA ATPase  30.73 
 
 		 1031 aa  213  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120671  normal  0.52051 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2606  hypothetical protein  28.72 
 
 		 1050 aa  121  6e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320925  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2242  hypothetical protein  27.67 
 
 		 658 aa  102  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3193  hypothetical protein  27.98 
 
 		 653 aa  99.8  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3326  hypothetical protein  24.36 
 
 		 800 aa  91.7  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000795061  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4031  hypothetical protein  27.96 
 
 		 802 aa  91.3  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1696  hypothetical protein  23.32 
 
 		 764 aa  88.6  6e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000294033  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1346  hypothetical protein  26.04 
 
 		 859 aa  82.8  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0239  hypothetical protein  26.11 
 
 		 734 aa  80.9  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.72436  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0983  hypothetical protein  23.13 
 
 		 762 aa  80.9  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.137038  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1505  hypothetical protein  23.78 
 
 		 753 aa  79.3  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1236  hypothetical protein  27.06 
 
 		 859 aa  79  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1085  hypothetical protein  24.94 
 
 		 847 aa  77.8  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1311  hypothetical protein  24.14 
 
 		 847 aa  75.9  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  24.66 
 
 		 496 aa  75.9  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  24.81 
 
 		 531 aa  69.3  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  23.58 
 
 		 557 aa  68.6  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  26.05 
 
 		 628 aa  68.2  0.0000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  25.66 
 
 		 523 aa  67.4  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  26.58 
 
 		 524 aa  67.8  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  25.75 
 
 		 561 aa  66.6  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  23.8 
 
 		 524 aa  65.5  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  22.94 
 
 		 611 aa  64.7  0.000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  24.73 
 
 		 563 aa  64.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  23.92 
 
 		 616 aa  63.5  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  23.26 
 
 		 608 aa  63.9  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  28.4 
 
 		 537 aa  61.6  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  23.23 
 
 		 508 aa  59.7  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  23.8 
 
 		 605 aa  59.7  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  25.21 
 
 		 559 aa  57.4  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  26.2 
 
 		 524 aa  57.8  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  26.71 
 
 		 575 aa  57  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  23.77 
 
 		 523 aa  55.8  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  21.08 
 
 		 550 aa  56.2  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  40.4 
 
 		 360 aa  55.1  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  24.44 
 
 		 546 aa  54.3  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0355  ATPase-like protein  23.96 
 
 		 250 aa  53.5  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  23.22 
 
 		 577 aa  53.5  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4079  hypothetical protein  39.02 
 
 		 876 aa  53.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00459285  normal  0.104503 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  29.31 
 
 		 557 aa  52.8  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0753  protein of unknown function DUF87  31.4 
 
 		 506 aa  52  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0799035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0816  hypothetical protein  27.82 
 
 		 452 aa  51.6  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.723695  normal  0.916322 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  26.32 
 
 		 579 aa  50.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3413  ATPase  29.71 
 
 		 516 aa  50.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.747505 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1070  hypothetical protein  26.8 
 
 		 452 aa  50.4  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6263  hypothetical protein  30.07 
 
 		 504 aa  50.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311693 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2167  AAA ATPase  29.31 
 
 		 507 aa  50.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.283139  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  29.36 
 
 		 709 aa  50.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4482  ATPase  30.99 
 
 		 502 aa  49.7  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.197027 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  29.46 
 
 		 679 aa  49.7  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  25.71 
 
 		 579 aa  49.3  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2035  ATPase  29.31 
 
 		 506 aa  49.3  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0152  hypothetical protein  23.33 
 
 		 664 aa  49.3  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.038472 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  39.19 
 
 		 599 aa  49.3  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  30.77 
 
 		 492 aa  49.3  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5744  hypothetical protein  25.07 
 
 		 590 aa  49.3  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575418 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2369  hypothetical protein  24.73 
 
 		 659 aa  49.3  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  30.6 
 
 		 564 aa  48.9  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0444  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  26.28 
 
 		 524 aa  48.9  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0693836  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  23.96 
 
 		 569 aa  48.9  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2732  hypothetical protein  29.78 
 
 		 510 aa  48.5  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393853  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1579  ATPase-like protein  31.17 
 
 		 498 aa  48.9  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0994986  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  28.57 
 
 		 693 aa  48.5  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  29.31 
 
 		 584 aa  48.5  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  18.8 
 
 		 493 aa  48.5  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0018  protein of unknown function DUF87  30.68 
 
 		 537 aa  47.8  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.989354  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  32.79 
 
 		 617 aa  48.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3526  hypothetical protein  32.76 
 
 		 583 aa  47.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  25.33 
 
 		 496 aa  47.8  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5417  hypothetical protein  25.39 
 
 		 1698 aa  48.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.265481  normal  0.989313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0635  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  24.32 
 
 		 513 aa  48.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  30 
 
 		 583 aa  47.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1551  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  26.63 
 
 		 490 aa  47  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0941  AAA ATPase  27.07 
 
 		 456 aa  47  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0685894 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2164  hypothetical protein  30.51 
 
 		 582 aa  47.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000710411 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  31.43 
 
 		 560 aa  47.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  35.48 
 
 		 526 aa  46.6  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  25.6 
 
 		 600 aa  47  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7061  AAA ATPase  30.77 
 
 		 500 aa  47  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0332905  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3949  hypothetical protein  34.43 
 
 		 513 aa  46.2  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  27.5 
 
 		 591 aa  46.2  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6246  AAA ATPase  30.77 
 
 		 520 aa  46.6  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  32.39 
 
 		 581 aa  46.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  28.7 
 
 		 607 aa  46.6  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  31.9 
 
 		 628 aa  45.8  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2387  protein of unknown function DUF87  34.02 
 
 		 708 aa  45.8  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.10181  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1632  hypothetical protein  30.99 
 
 		 514 aa  46.2  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  26.67 
 
 		 612 aa  45.8  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  30.28 
 
 		 623 aa  45.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1483  hypothetical protein  30.99 
 
 		 511 aa  45.4  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>