67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3423 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3423  AAA ATPase  100 
 
 
1104 aa  2188    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.598451  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1484  hypothetical protein  39.37 
 
 
1144 aa  645    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0469742  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1183  AAA ATPase  46.21 
 
 
1043 aa  846    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3967  AAA ATPase  35.34 
 
 
1046 aa  533  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1184  ATPase  34.43 
 
 
1071 aa  499  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2709  ATPase-like  30.91 
 
 
1106 aa  480  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5149  AAA ATPase  55.61 
 
 
1031 aa  436  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120671  normal  0.52051 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2631  hypothetical protein  38.83 
 
 
886 aa  348  3e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.703653 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5114  AAA ATPase  38.5 
 
 
1076 aa  335  3e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078899 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2632  ATPase  51.55 
 
 
319 aa  298  5e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.57356 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5089  AAA ATPase  36.51 
 
 
1100 aa  290  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0231758  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2606  hypothetical protein  28.1 
 
 
1050 aa  110  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320925  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3326  hypothetical protein  26.58 
 
 
800 aa  99.4  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000795061  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4031  hypothetical protein  29.01 
 
 
802 aa  95.5  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1696  hypothetical protein  26 
 
 
764 aa  89.7  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000294033  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2242  hypothetical protein  26.78 
 
 
658 aa  87  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1346  hypothetical protein  26.71 
 
 
859 aa  85.9  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0983  hypothetical protein  25.5 
 
 
762 aa  85.5  0.000000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.137038  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1085  hypothetical protein  24.82 
 
 
847 aa  85.1  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3193  hypothetical protein  26.04 
 
 
653 aa  81.6  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1236  hypothetical protein  26.76 
 
 
859 aa  74.7  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1505  hypothetical protein  25.31 
 
 
753 aa  74.3  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1311  hypothetical protein  26.68 
 
 
847 aa  73.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0239  hypothetical protein  24.88 
 
 
734 aa  72.4  0.00000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.72436  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  24.54 
 
 
557 aa  69.7  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  24.44 
 
 
524 aa  65.9  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  23.39 
 
 
531 aa  62.4  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  22.8 
 
 
611 aa  59.7  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  32.48 
 
 
496 aa  59.7  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  22.73 
 
 
523 aa  59.3  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  22.51 
 
 
508 aa  58.5  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  24.59 
 
 
563 aa  55.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1498  hypothetical protein  33.63 
 
 
582 aa  55.5  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  22.95 
 
 
628 aa  55.5  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  26.42 
 
 
524 aa  55.5  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4029  ATPase-like protein  33.64 
 
 
580 aa  55.1  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.878422 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  22.03 
 
 
523 aa  53.9  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1553  hypothetical protein  32.74 
 
 
582 aa  53.5  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.623642 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  31.01 
 
 
360 aa  52  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  23.85 
 
 
524 aa  52  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0753  protein of unknown function DUF87  32.14 
 
 
506 aa  50.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0799035  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1259  protein of unknown function DUF87  30.56 
 
 
540 aa  49.7  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  23.95 
 
 
537 aa  49.3  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1724  ATPase  31.25 
 
 
585 aa  48.9  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  23.73 
 
 
559 aa  48.9  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  24.35 
 
 
579 aa  48.5  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2699  AAA ATPase  31.63 
 
 
603 aa  48.9  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.480316  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  22.53 
 
 
581 aa  48.1  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  43.75 
 
 
557 aa  48.1  0.0009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6133  ATPase-like protein  31.78 
 
 
630 aa  48.1  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.869987  normal  0.698643 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5141  hypothetical protein  25.42 
 
 
685 aa  47.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3197100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  25.95 
 
 
605 aa  47  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0816  hypothetical protein  29.58 
 
 
452 aa  47  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.723695  normal  0.916322 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  40 
 
 
616 aa  47  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0452  hypothetical protein  34.38 
 
 
682 aa  46.2  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1340  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  23.76 
 
 
515 aa  46.6  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  31.53 
 
 
570 aa  46.2  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4482  ATPase  30.72 
 
 
502 aa  46.2  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.197027 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3775  hypothetical protein  30 
 
 
613 aa  46.2  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464348  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2035  ATPase  30.52 
 
 
506 aa  46.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  25.54 
 
 
679 aa  45.8  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2167  AAA ATPase  29.87 
 
 
507 aa  45.8  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.283139  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  24.28 
 
 
546 aa  45.8  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  24.43 
 
 
608 aa  45.8  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0645  TraG-family protein  30.68 
 
 
703 aa  45.4  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0355  ATPase-like protein  22.94 
 
 
250 aa  45.1  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3413  ATPase  30.32 
 
 
516 aa  44.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.747505 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>