105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3413 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3413  ATPase  100 
 
 		 516 aa  1034    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.747505 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4482  ATPase  85.19 
 
 		 502 aa  816    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.197027 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2035  ATPase  93.24 
 
 		 506 aa  950    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1579  ATPase-like protein  77.15 
 
 		 498 aa  740    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0994986  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6263  hypothetical protein  82.11 
 
 		 504 aa  844    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311693 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2167  AAA ATPase  87.62 
 
 		 507 aa  881    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.283139  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0592  hypothetical protein  63.65 
 
 		 498 aa  587  1e-166  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000492944 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1483  hypothetical protein  63.33 
 
 		 511 aa  581  1e-164  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1534  hypothetical protein  62.83 
 
 		 513 aa  577  1.0000000000000001e-163  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.74675  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2732  hypothetical protein  62.4 
 
 		 510 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393853  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2283  AAA ATPase  62.4 
 
 		 511 aa  575  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7061  AAA ATPase  63.51 
 
 		 500 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0332905  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1632  hypothetical protein  62.81 
 
 		 514 aa  571  1e-161  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1948  AAA ATPase  60.91 
 
 		 503 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.315114  normal  0.618024 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1920  hypothetical protein  58.69 
 
 		 526 aa  557  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2157  AAA ATPase  61.31 
 
 		 504 aa  557  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.969754  normal  0.641302 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1515  AAA ATPase  60.32 
 
 		 504 aa  547  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5552  hypothetical protein  59.35 
 
 		 498 aa  526  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.508667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6246  AAA ATPase  62 
 
 		 520 aa  528  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3638  hypothetical protein  59.43 
 
 		 500 aa  523  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.689622  normal  0.0322237 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3657  ATPase-like protein  56.63 
 
 		 490 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3442  hypothetical protein  58.82 
 
 		 499 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.41425  normal  0.022696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3751  hypothetical protein  58.82 
 
 		 499 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0972722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1720  ATPase  55.12 
 
 		 504 aa  482  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0461  ATPase  54.47 
 
 		 492 aa  483  1e-135  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  28.91 
 
 		 537 aa  99.4  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3041  protein of unknown function DUF87  27.46 
 
 		 744 aa  60.8  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1865  hypothetical protein  26.38 
 
 		 655 aa  57.4  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0131162 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0355  ATPase-like protein  23.15 
 
 		 250 aa  56.6  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5115  hypothetical protein  28.02 
 
 		 595 aa  56.6  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2778  hypothetical protein  25.86 
 
 		 580 aa  54.7  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145513  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  26.51 
 
 		 523 aa  52.4  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2260  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.62 
 
 		 1174 aa  51.6  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.535537  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2164  hypothetical protein  31.78 
 
 		 582 aa  50.8  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000710411 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  28.21 
 
 		 628 aa  50.8  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4444  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.51 
 
 		 908 aa  51.2  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4578  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.51 
 
 		 908 aa  51.2  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211608  normal  0.637963 
 
 
-
 
NC_003296  RS01655  hypothetical protein  27.47 
 
 		 959 aa  50.8  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.273957  normal  0.0637892 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1445  DNA translocase FtsK  28.09 
 
 		 1107 aa  49.7  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.64751  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1596  DNA translocase FtsK  27.66 
 
 		 1123 aa  50.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262939  normal  0.732523 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5114  AAA ATPase  29.71 
 
 		 1076 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078899 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1924  cell division protein FtsK, putative  28.09 
 
 		 1725 aa  49.3  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1032  putative cell division protein FtsK  28.09 
 
 		 1725 aa  49.3  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0718321  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0835  putative cell division protein FtsK  28.09 
 
 		 1725 aa  49.3  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.816405  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  26.67 
 
 		 524 aa  49.3  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0315  putative cell division protein FtsK  28.09 
 
 		 1725 aa  49.3  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10146  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2369  hypothetical protein  25.44 
 
 		 659 aa  48.9  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1344  hypothetical protein  28.09 
 
 		 1851 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0976  cell division protein FtsK  27.66 
 
 		 1784 aa  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1185  DNA translocase FtsK  28.09 
 
 		 1834 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1193  DNA translocase FtsK  28.09 
 
 		 1851 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2089  cell division FtsK/SpoIIIE  27.54 
 
 		 1369 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123454 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2360  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.2 
 
 		 1202 aa  47.8  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.647961  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  25.95 
 
 		 577 aa  47.8  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1719  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.1 
 
 		 1157 aa  47.4  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5533  hypothetical protein  27.95 
 
 		 608 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.423742  normal  0.336707 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5935  hypothetical protein  27.95 
 
 		 608 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0918921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0756  hypothetical protein  30.54 
 
 		 645 aa  47  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00608077 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1987  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.1 
 
 		 1145 aa  47.4  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.252325  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5663  DNA translocase FtsK  27.53 
 
 		 1673 aa  47  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.793927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0956  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.23 
 
 		 1707 aa  47  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.810802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2344  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.53 
 
 		 1527 aa  47  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0427458 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1709  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.53 
 
 		 1527 aa  47  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2321  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.53 
 
 		 1527 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.800211  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  30.08 
 
 		 574 aa  46.6  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2360  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.81 
 
 		 1640 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  26.67 
 
 		 611 aa  45.8  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  27.03 
 
 		 579 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2596  DNA translocase FtsK  24.71 
 
 		 1310 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.0000000000551266  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1613  DNA translocase FtsK  24.71 
 
 		 1299 aa  45.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00457522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2685  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.71 
 
 		 1310 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00501186  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2240  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.81 
 
 		 1610 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.751818 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0994  DNA translocase FtsK  25.59 
 
 		 1360 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.208263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1059  DNA translocase FtsK  25.59 
 
 		 1379 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1074  DNA translocase FtsK  25.59 
 
 		 1358 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.282682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0965  DNA translocase FtsK  25.59 
 
 		 1360 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00251572  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1025  DNA translocase FtsK  25.59 
 
 		 1321 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.68582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1423  HAD family hydrolase  29.25 
 
 		 550 aa  45.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  28.32 
 
 		 664 aa  45.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1683  cell division protein FtsK/SpoIIIE  24.9 
 
 		 1187 aa  45.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.175033 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3423  AAA ATPase  30.32 
 
 		 1104 aa  44.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.598451  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2460  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.56 
 
 		 837 aa  45.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000438856  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3390  cell division FtsK/SpoIIIE  31.02 
 
 		 1477 aa  44.7  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000563545 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1100  HAD family hydrolase  28.38 
 
 		 554 aa  44.7  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.261757  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  24.35 
 
 		 508 aa  44.7  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1117  HAD family hydrolase  28.38 
 
 		 554 aa  44.7  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.293003  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1414  DNA translocase FtsK  25 
 
 		 1244 aa  44.3  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0287873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2230  DNA translocase FtsK  25.59 
 
 		 1369 aa  44.3  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000123505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  26.51 
 
 		 524 aa  44.3  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2438  DNA translocase FtsK  25.59 
 
 		 1310 aa  44.3  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000385986  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00894  DNA-binding membrane protein required for chromosome resolution and partitioning  25.59 
 
 		 1342 aa  43.9  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2753  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.59 
 
 		 1329 aa  44.3  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000229654  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1795  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.5 
 
 		 884 aa  43.9  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00936905  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0995  DNA translocase FtsK  25.59 
 
 		 1329 aa  44.3  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  0.00000000000212407  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0965  DNA translocase FtsK  25.59 
 
 		 1368 aa  44.3  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000342338  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  25.42 
 
 		 524 aa  44.3  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2706  DNA translocase FtsK  25.59 
 
 		 1329 aa  44.3  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00221849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1052  DNA translocase FtsK  25.59 
 
 		 1342 aa  44.3  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000465717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00901  hypothetical protein  25.59 
 
 		 1342 aa  43.9  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3303  DNA translocase FtsK  26.38 
 
 		 1430 aa  43.9  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190344  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>