More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2460 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00894  DNA-binding membrane protein required for chromosome resolution and partitioning  68.61 
 
 		 1342 aa  677    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2753  cell divisionFtsK/SpoIIIE  68.61 
 
 		 1329 aa  677    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000229654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2596  DNA translocase FtsK  69.82 
 
 		 1310 aa  702    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.0000000000551266  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4004  cell divisionFtsK/SpoIIIE  49.47 
 
 		 834 aa  751    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500623 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1772  cell division protein FtsK, putative  72.48 
 
 		 928 aa  799    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00023204  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1613  DNA translocase FtsK  69.62 
 
 		 1299 aa  702    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00457522  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1695  cell division protein FtsK, putative  68.01 
 
 		 844 aa  658    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1285  cell divisionFtsK/SpoIIIE  45.96 
 
 		 799 aa  661    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139445  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2089  cell division FtsK/SpoIIIE  59.93 
 
 		 1369 aa  643    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3609  cell divisionFtsK/SpoIIIE  50.54 
 
 		 807 aa  757    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2323  cell divisionFtsK/SpoIIIE  66.83 
 
 		 917 aa  782    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000157277  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2759  cell division protein FtsK  59.45 
 
 		 879 aa  1005    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06128  DNA translocase FtsK  66.67 
 
 		 786 aa  659    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185359  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0965  DNA translocase FtsK  68.61 
 
 		 1368 aa  678    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000342338  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1493  putative cell division protein FtsK  70.16 
 
 		 960 aa  723    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121086  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2306  cell division protein FtsK, putative  76.45 
 
 		 911 aa  782    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3349  cell division protein FtsK  50.54 
 
 		 801 aa  755    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.293432  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2004  DNA translocase FtsK  63.83 
 
 		 769 aa  636    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1032  putative cell division protein FtsK  64.26 
 
 		 1725 aa  639    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0718321  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0704  cell divisionFtsK/SpoIIIE  68.14 
 
 		 784 aa  662    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1987  cell divisionFtsK/SpoIIIE  68.35 
 
 		 1145 aa  682    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.252325  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1924  cell division protein FtsK, putative  64.26 
 
 		 1725 aa  639    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0994  DNA translocase FtsK  68.41 
 
 		 1360 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.208263  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1730  hypothetical protein  48.58 
 
 		 794 aa  749    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1730  hypothetical protein  48.11 
 
 		 794 aa  748    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3179  cell divisionFtsK/SpoIIIE protein  50.36 
 
 		 801 aa  752    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3408  cell divisionFtsK/SpoIIIE  49.88 
 
 		 819 aa  748    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.336852 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0793  cell division protein  67.74 
 
 		 784 aa  658    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003879  cell division protein FtsK  71.94 
 
 		 1014 aa  735    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000123897  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1025  DNA translocase FtsK  68.41 
 
 		 1321 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.68582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2438  DNA translocase FtsK  68.61 
 
 		 1310 aa  677    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000385986  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1193  DNA translocase FtsK  64.26 
 
 		 1851 aa  641    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1344  hypothetical protein  64.26 
 
 		 1851 aa  641    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0347  cell division FtsK/SpoIIIE  66 
 
 		 814 aa  647    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3586  DNA translocase FtsK  49.4 
 
 		 802 aa  720    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345612  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0965  DNA translocase FtsK  68.41 
 
 		 1360 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00251572  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2260  cell divisionFtsK/SpoIIIE  68.69 
 
 		 1174 aa  684    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.535537  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5663  DNA translocase FtsK  64.78 
 
 		 1673 aa  635    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.793927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01797  cell division protein FtsK  71.74 
 
 		 1120 aa  734    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1185  DNA translocase FtsK  64.26 
 
 		 1834 aa  640    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0764  cell divisionFtsK/SpoIIIE  48.03 
 
 		 821 aa  716    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1074  DNA translocase FtsK  68.41 
 
 		 1358 aa  673    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.282682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28220  Cell division protein FtsK  69.35 
 
 		 973 aa  670    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41946  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2483  cell divisionFtsK/SpoIIIE  58.6 
 
 		 850 aa  976    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000281786  hitchhiker  0.000000825037 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2215  cell divisionFtsK/SpoIIIE  66.67 
 
 		 917 aa  780    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000327747  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2233  cell divisionFtsK/SpoIIIE  58.07 
 
 		 849 aa  947    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00175436  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0976  cell division protein FtsK  64.79 
 
 		 1784 aa  640    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1059  DNA translocase FtsK  68.41 
 
 		 1379 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0315  putative cell division protein FtsK  64.26 
 
 		 1725 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10146  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1414  DNA translocase FtsK  68.61 
 
 		 1244 aa  684    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0287873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2127  cell division protein FtsK/SpoIIIE  58.89 
 
 		 837 aa  946    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000271124  normal  0.0651093 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2685  cell divisionFtsK/SpoIIIE  69.62 
 
 		 1310 aa  702    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00501186  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02116  cell division protein FtsK  63.11 
 
 		 831 aa  962    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00337191  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1693  DNA translocase FtsK  67.86 
 
 		 782 aa  687    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.782698  normal  0.477366 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2011  cell divisionFtsK/SpoIIIE  57.11 
 
 		 896 aa  976    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000146975  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01038  DNA translocase FtsK  66.67 
 
 		 786 aa  659    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.37301  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1827  cell divisionFtsK/SpoIIIE  66.73 
 
 		 789 aa  661    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.346925  hitchhiker  0.00000783388 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1743  cell divisionFtsK/SpoIIIE  77.09 
 
 		 932 aa  791    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000155833  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2191  cell divisionFtsK/SpoIIIE  76.34 
 
 		 917 aa  779    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000178712  normal  0.118465 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2436  DNA translocase FtsK  66.4 
 
 		 1085 aa  674    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.277561  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2024  cell divisionFtsK/SpoIIIE  58.96 
 
 		 841 aa  953    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000111229  unclonable  0.00000274809 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2230  DNA translocase FtsK  68.61 
 
 		 1369 aa  677    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000123505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1841  DNA translocase FtsK  69.22 
 
 		 1091 aa  710    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1596  DNA translocase FtsK  64.98 
 
 		 1123 aa  639    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262939  normal  0.732523 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2388  DNA translocase FtsK  69.82 
 
 		 802 aa  679    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0162583 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2156  cell divisionFtsK/SpoIIIE  76.34 
 
 		 917 aa  779    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000852872  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2360  cell divisionFtsK/SpoIIIE  69.42 
 
 		 1202 aa  708    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.647961  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1683  cell division protein FtsK/SpoIIIE  68.15 
 
 		 1187 aa  671    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.175033 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1519  cell divisionFtsK/SpoIIIE  49.15 
 
 		 786 aa  711    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1709  cell divisionFtsK/SpoIIIE  61.98 
 
 		 1527 aa  636    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1719  cell divisionFtsK/SpoIIIE  61.02 
 
 		 1157 aa  706    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2460  cell divisionFtsK/SpoIIIE  100 
 
 		 837 aa  1705    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000438856  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1829  cell divisionFtsK/SpoIIIE  50.24 
 
 		 831 aa  754    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0290854 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3256  cell divisionFtsK/SpoIIIE  68.45 
 
 		 917 aa  645    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00372122  unclonable  0.00000000000948051 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1550  cell divisionFtsK/SpoIIIE  69.11 
 
 		 866 aa  690    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1662  DNA segregation ATPase FtsK  54.79 
 
 		 855 aa  897    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0615412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1186  DNA translocase FtsK  42.86 
 
 		 903 aa  650    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00816417  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1963  DNA translocase FtsK  56.38 
 
 		 914 aa  976    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000218677  normal  0.918259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2013  DNA translocase FtsK  56.17 
 
 		 913 aa  973    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00817822  normal  0.0372318 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1712  DNA translocase FtsK  65.81 
 
 		 789 aa  655    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475518  normal  0.695556 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2593  cell division protein FtsK  51.31 
 
 		 804 aa  733    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00901  hypothetical protein  68.61 
 
 		 1342 aa  677    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30290  cell division protein FtsK  50.83 
 
 		 811 aa  733    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1933  cell divisionFtsK/SpoIIIE  68.53 
 
 		 786 aa  649    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.440835  normal  0.487385 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1052  DNA translocase FtsK  68.41 
 
 		 1342 aa  676    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000465717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2321  cell divisionFtsK/SpoIIIE  61.98 
 
 		 1527 aa  635    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.800211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0995  DNA translocase FtsK  68.61 
 
 		 1329 aa  677    Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  0.00000000000212407  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2706  DNA translocase FtsK  68.61 
 
 		 1329 aa  677    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00221849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2050  DNA translocase FtsK  56.09 
 
 		 917 aa  974    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000503772  hitchhiker  0.00152361 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0835  putative cell division protein FtsK  64.26 
 
 		 1725 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.816405  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01655  hypothetical protein  64.77 
 
 		 959 aa  634  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.273957  normal  0.0637892 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1759  cell division FtsK/SpoIIIE  45.85 
 
 		 777 aa  635  1e-180  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2240  cell divisionFtsK/SpoIIIE  64.78 
 
 		 1610 aa  634  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.751818 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4578  cell divisionFtsK/SpoIIIE  63.93 
 
 		 908 aa  633  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211608  normal  0.637963 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1243  cell divisionFtsK/SpoIIIE  64.52 
 
 		 1485 aa  632  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0956  cell divisionFtsK/SpoIIIE  64.37 
 
 		 1707 aa  635  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.810802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4444  cell divisionFtsK/SpoIIIE  63.93 
 
 		 908 aa  633  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2344  cell divisionFtsK/SpoIIIE  61.98 
 
 		 1527 aa  635  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0427458 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2360  cell divisionFtsK/SpoIIIE  64.78 
 
 		 1640 aa  635  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1396  cell divisionFtsK/SpoIIIE  65.48 
 
 		 837 aa  626  1e-178  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.840983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>