78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4482 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6263  hypothetical protein  85.54 
 
 		 504 aa  833    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311693 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2167  AAA ATPase  82.21 
 
 		 507 aa  826    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.283139  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1579  ATPase-like protein  76.97 
 
 		 498 aa  732    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0994986  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2035  ATPase  85.38 
 
 		 506 aa  857    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3413  ATPase  85.4 
 
 		 516 aa  841    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.747505 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4482  ATPase  100 
 
 		 502 aa  1001    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.197027 
 
 
-
 
NC_004310  BR1534  hypothetical protein  59.61 
 
 		 513 aa  569  1e-161  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.74675  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2283  AAA ATPase  62.5 
 
 		 511 aa  568  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1483  hypothetical protein  59.1 
 
 		 511 aa  570  1e-161  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0592  hypothetical protein  60.56 
 
 		 498 aa  569  1e-161  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000492944 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1632  hypothetical protein  61.83 
 
 		 514 aa  567  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2732  hypothetical protein  61.08 
 
 		 510 aa  554  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393853  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1920  hypothetical protein  58.35 
 
 		 526 aa  551  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7061  AAA ATPase  61.32 
 
 		 500 aa  553  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0332905  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1948  AAA ATPase  58.63 
 
 		 503 aa  554  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.315114  normal  0.618024 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2157  AAA ATPase  59.96 
 
 		 504 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.969754  normal  0.641302 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1515  AAA ATPase  58.67 
 
 		 504 aa  547  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6246  AAA ATPase  60.64 
 
 		 520 aa  524  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3638  hypothetical protein  58.66 
 
 		 500 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.689622  normal  0.0322237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5552  hypothetical protein  59.5 
 
 		 498 aa  513  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.508667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3751  hypothetical protein  58.04 
 
 		 499 aa  508  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0972722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3442  hypothetical protein  58.04 
 
 		 499 aa  508  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.41425  normal  0.022696 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3657  ATPase-like protein  55.85 
 
 		 490 aa  501  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0461  ATPase  54.22 
 
 		 492 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1720  ATPase  53.25 
 
 		 504 aa  456  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  28.87 
 
 		 537 aa  98.6  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3041  protein of unknown function DUF87  28.28 
 
 		 744 aa  63.9  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0355  ATPase-like protein  23.91 
 
 		 250 aa  62  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5115  hypothetical protein  28.45 
 
 		 595 aa  58.2  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1865  hypothetical protein  26.16 
 
 		 655 aa  55.1  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0131162 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  28.21 
 
 		 628 aa  52.8  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2778  hypothetical protein  25.21 
 
 		 580 aa  52.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145513  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2369  hypothetical protein  25.79 
 
 		 659 aa  51.6  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2164  hypothetical protein  31.78 
 
 		 582 aa  51.2  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000710411 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  30.77 
 
 		 524 aa  50.1  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5935  hypothetical protein  28.78 
 
 		 608 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0918921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5533  hypothetical protein  28.78 
 
 		 608 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.423742  normal  0.336707 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  27.35 
 
 		 523 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5114  AAA ATPase  30.99 
 
 		 1076 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078899 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  29.63 
 
 		 581 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1032  putative cell division protein FtsK  28.33 
 
 		 1725 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0718321  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0756  hypothetical protein  31 
 
 		 645 aa  46.6  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00608077 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  26.06 
 
 		 611 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0315  putative cell division protein FtsK  28.33 
 
 		 1725 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10146  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  28.1 
 
 		 360 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5744  hypothetical protein  32.48 
 
 		 590 aa  46.6  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575418 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0835  putative cell division protein FtsK  28.33 
 
 		 1725 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.816405  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1924  cell division protein FtsK, putative  28.33 
 
 		 1725 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  30.09 
 
 		 664 aa  46.6  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3423  AAA ATPase  30.72 
 
 		 1104 aa  45.8  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.598451  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1344  hypothetical protein  28.33 
 
 		 1851 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0976  cell division protein FtsK  27.66 
 
 		 1784 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1193  DNA translocase FtsK  28.33 
 
 		 1851 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1185  DNA translocase FtsK  28.33 
 
 		 1834 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1100  HAD family hydrolase  30.71 
 
 		 554 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.261757  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1117  HAD family hydrolase  30.71 
 
 		 554 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.293003  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4578  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.66 
 
 		 908 aa  44.7  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211608  normal  0.637963 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  26.92 
 
 		 567 aa  44.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4444  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.66 
 
 		 908 aa  44.7  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  27.22 
 
 		 574 aa  44.7  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1445  DNA translocase FtsK  27.66 
 
 		 1107 aa  44.3  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.64751  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2089  cell division FtsK/SpoIIIE  27.12 
 
 		 1369 aa  44.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123454 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  27.82 
 
 		 531 aa  44.3  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0956  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.47 
 
 		 1707 aa  44.3  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.810802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5663  DNA translocase FtsK  27.53 
 
 		 1673 aa  43.9  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.793927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  24.68 
 
 		 605 aa  43.9  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  25.48 
 
 		 616 aa  43.9  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2344  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.53 
 
 		 1527 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0427458 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2321  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.76 
 
 		 1527 aa  43.9  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.800211  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1709  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.76 
 
 		 1527 aa  43.9  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  36.11 
 
 		 579 aa  43.5  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  27.63 
 
 		 674 aa  43.5  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  35.21 
 
 		 570 aa  43.5  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  24.58 
 
 		 524 aa  43.5  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01655  hypothetical protein  27.04 
 
 		 959 aa  43.5  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.273957  normal  0.0637892 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1450  protein of unknown function DUF87  28.3 
 
 		 581 aa  43.9  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0452751  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1596  DNA translocase FtsK  27.23 
 
 		 1123 aa  43.5  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262939  normal  0.732523 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  25.32 
 
 		 608 aa  43.5  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>