More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1596 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0690  cell division FtsK/SpoIIIE  66.6 
 
 		 770 aa  659    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2341  cell division ftsk transmembrane protein  67.67 
 
 		 781 aa  662    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.86356  normal  0.195593 
 
 
-
 
NC_003296  RS01655  hypothetical protein  85.79 
 
 		 959 aa  899    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.273957  normal  0.0637892 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1038  cell divisionFtsK/SpoIIIE  69.72 
 
 		 770 aa  672    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.648604 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0835  putative cell division protein FtsK  80.87 
 
 		 1725 aa  835    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.816405  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1764  cell divisionFtsK/SpoIIIE  68.93 
 
 		 763 aa  662    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.947558  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2990  DNA translocase FtsK  69.25 
 
 		 822 aa  684    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0847  cell divisionFtsK/SpoIIIE  68.98 
 
 		 769 aa  671    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4444  cell divisionFtsK/SpoIIIE  86.42 
 
 		 908 aa  919    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434451  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3349  cell division protein FtsK  62.15 
 
 		 801 aa  636    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.293432  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5363  cell divisionFtsK/SpoIIIE  69.39 
 
 		 787 aa  687    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.52695 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3382  DNA translocase FtsK  69.84 
 
 		 776 aa  691    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.265787 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0790  cell division protein FtsK  69.25 
 
 		 822 aa  684    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1032  putative cell division protein FtsK  80.87 
 
 		 1725 aa  835    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0718321  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1924  cell division protein FtsK, putative  80.87 
 
 		 1725 aa  835    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2122  cell division protein FtsK  69.25 
 
 		 822 aa  684    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204581  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2089  cell division FtsK/SpoIIIE  81.76 
 
 		 1369 aa  822    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123454 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1243  cell divisionFtsK/SpoIIIE  82.28 
 
 		 1485 aa  819    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3179  cell divisionFtsK/SpoIIIE protein  62.34 
 
 		 801 aa  638    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1295  DNA translocase FtsK  69.45 
 
 		 768 aa  669    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.65138  normal  0.354851 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2600  DNA translocase FtsK  66.41 
 
 		 774 aa  664    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3211  cell divisionFtsK/SpoIIIE  68.61 
 
 		 818 aa  688    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.129812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1002  DNA translocase FtsK  71.91 
 
 		 757 aa  692    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0837246  normal  0.0587694 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1344  hypothetical protein  80.87 
 
 		 1851 aa  837    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3077  cell division ftsk transmembrane protein  69.25 
 
 		 822 aa  684    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.737589  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4578  cell divisionFtsK/SpoIIIE  86.42 
 
 		 908 aa  919    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211608  normal  0.637963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2720  cell divisionFtsK/SpoIIIE  69.84 
 
 		 776 aa  691    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4078  DNA translocase FtsK  69.04 
 
 		 769 aa  676    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5663  DNA translocase FtsK  80.23 
 
 		 1673 aa  828    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.793927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0956  cell divisionFtsK/SpoIIIE  81.12 
 
 		 1707 aa  832    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.810802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1161  cell divisionFtsK/SpoIIIE  66.39 
 
 		 770 aa  657    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.112052 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2240  cell divisionFtsK/SpoIIIE  81.12 
 
 		 1610 aa  825    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.751818 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1759  cell division FtsK/SpoIIIE  69.29 
 
 		 777 aa  667    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1120  DNA translocase FtsK  66.48 
 
 		 777 aa  685    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.149955 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1990  cell division protein FtsK  69.25 
 
 		 768 aa  685    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0176  cell division FtsK/SpoIIIE  68.54 
 
 		 776 aa  682    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0976  cell division protein FtsK  82.39 
 
 		 1784 aa  830    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1561  cell division protein FtsK  69.45 
 
 		 819 aa  686    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0635  cell division FtsK/SpoIIIE  68.7 
 
 		 755 aa  674    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1193  DNA translocase FtsK  80.87 
 
 		 1851 aa  837    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2344  cell divisionFtsK/SpoIIIE  79.65 
 
 		 1527 aa  825    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0427458 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3178  cell divisionFtsK/SpoIIIE  68.56 
 
 		 784 aa  670    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1124  DNA translocase FtsK  71.02 
 
 		 765 aa  670    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.530393 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3799  DNA translocase FtsK  64.56 
 
 		 781 aa  665    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3303  DNA translocase FtsK  81.87 
 
 		 1430 aa  813    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3441  DNA translocase FtsK  69.31 
 
 		 771 aa  666    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.639772 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2556  cell divisionFtsK/SpoIIIE  68.15 
 
 		 781 aa  666    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3043  DNA translocase FtsK  69.25 
 
 		 768 aa  685    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.517068  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0315  putative cell division protein FtsK  80.87 
 
 		 1725 aa  835    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10146  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1285  cell divisionFtsK/SpoIIIE  64.85 
 
 		 799 aa  695    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139445  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0685  DNA translocase FtsK  67.33 
 
 		 775 aa  667    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.579249  normal  0.40602 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1596  DNA translocase FtsK  100 
 
 		 1123 aa  2208    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262939  normal  0.732523 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3426  DNA translocase FtsK  66.28 
 
 		 779 aa  662    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.643705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0496  cell divisionFtsK/SpoIIIE  68.98 
 
 		 769 aa  669    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1709  cell divisionFtsK/SpoIIIE  79.84 
 
 		 1527 aa  827    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2152  cell divisionFtsK/SpoIIIE  67.87 
 
 		 781 aa  662    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.356378  normal  0.85601 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2460  cell divisionFtsK/SpoIIIE  64.29 
 
 		 837 aa  643    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000438856  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0756  cell divisionFtsK/SpoIIIE  68.7 
 
 		 803 aa  657    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0143018 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2622  cell division protein FtsK  69.25 
 
 		 768 aa  685    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.436072  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0835  cell divisionFtsK/SpoIIIE  69.45 
 
 		 769 aa  683    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2360  cell divisionFtsK/SpoIIIE  80.92 
 
 		 1640 aa  822    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1185  DNA translocase FtsK  80.87 
 
 		 1834 aa  837    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2423  cell divisionFtsK/SpoIIIE  68.75 
 
 		 779 aa  674    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0936  cell divisionFtsK/SpoIIIE  69.18 
 
 		 769 aa  671    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.470674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0975  cell divisionFtsK/SpoIIIE  68.98 
 
 		 769 aa  669    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2321  cell divisionFtsK/SpoIIIE  79.84 
 
 		 1527 aa  827    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.800211  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4004  cell divisionFtsK/SpoIIIE  61.73 
 
 		 834 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500623 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1613  DNA translocase FtsK  49.67 
 
 		 1299 aa  629  1e-179  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00457522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1829  cell divisionFtsK/SpoIIIE  62.03 
 
 		 831 aa  632  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0290854 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3609  cell divisionFtsK/SpoIIIE  62.24 
 
 		 807 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1827  cell divisionFtsK/SpoIIIE  60.44 
 
 		 789 aa  629  1e-179  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.346925  hitchhiker  0.00000783388 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2685  cell divisionFtsK/SpoIIIE  49.67 
 
 		 1310 aa  627  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00501186  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2388  DNA translocase FtsK  63.64 
 
 		 802 aa  626  1e-178  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0162583 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2596  DNA translocase FtsK  49.67 
 
 		 1310 aa  627  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.0000000000551266  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2593  cell division protein FtsK  64.62 
 
 		 804 aa  627  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30290  cell division protein FtsK  64.62 
 
 		 811 aa  627  1e-178  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1719  cell divisionFtsK/SpoIIIE  64.97 
 
 		 1157 aa  625  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3408  cell divisionFtsK/SpoIIIE  61.68 
 
 		 819 aa  625  1e-177  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.336852 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06128  DNA translocase FtsK  65.26 
 
 		 786 aa  625  1e-177  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185359  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01038  DNA translocase FtsK  65.26 
 
 		 786 aa  625  1e-177  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.37301  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1772  cell division protein FtsK, putative  60.97 
 
 		 928 aa  621  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00023204  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2436  DNA translocase FtsK  62.85 
 
 		 1085 aa  621  1e-176  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.277561  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2360  cell divisionFtsK/SpoIIIE  63.14 
 
 		 1202 aa  620  1e-176  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.647961  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2004  DNA translocase FtsK  65.53 
 
 		 769 aa  622  1e-176  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0546  cell divisionFtsK/SpoIIIE  63.8 
 
 		 733 aa  622  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.803279  hitchhiker  0.0000950013 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0704  cell divisionFtsK/SpoIIIE  62.7 
 
 		 784 aa  616  1e-175  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1933  cell divisionFtsK/SpoIIIE  63.58 
 
 		 786 aa  617  1e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.440835  normal  0.487385 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2011  cell divisionFtsK/SpoIIIE  55.29 
 
 		 896 aa  616  1e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000146975  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1693  DNA translocase FtsK  61.35 
 
 		 782 aa  618  1e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.782698  normal  0.477366 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1519  cell divisionFtsK/SpoIIIE  64.44 
 
 		 786 aa  615  9.999999999999999e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0793  cell division protein  62.3 
 
 		 784 aa  613  9.999999999999999e-175  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28220  Cell division protein FtsK  64.23 
 
 		 973 aa  615  9.999999999999999e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41946  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2215  cell divisionFtsK/SpoIIIE  61.78 
 
 		 917 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000327747  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2306  cell division protein FtsK, putative  53.9 
 
 		 911 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2156  cell divisionFtsK/SpoIIIE  61.78 
 
 		 917 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000852872  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2323  cell divisionFtsK/SpoIIIE  61.78 
 
 		 917 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000157277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2191  cell divisionFtsK/SpoIIIE  61.78 
 
 		 917 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000178712  normal  0.118465 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1795  cell divisionFtsK/SpoIIIE  61.94 
 
 		 884 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00936905  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2753  cell divisionFtsK/SpoIIIE  63.69 
 
 		 1329 aa  610  1e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000229654  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2230  DNA translocase FtsK  63.69 
 
 		 1369 aa  610  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000123505  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>