151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0355 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0355  ATPase-like protein  100 
 
 
250 aa  504  9.999999999999999e-143  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3041  protein of unknown function DUF87  31.22 
 
 
744 aa  103  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5115  hypothetical protein  31.2 
 
 
595 aa  102  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2369  hypothetical protein  32.86 
 
 
659 aa  99.4  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70292  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1865  hypothetical protein  30.93 
 
 
655 aa  97.1  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0131162 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2778  hypothetical protein  34.92 
 
 
580 aa  96.3  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145513  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  35.33 
 
 
508 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5533  hypothetical protein  30.31 
 
 
608 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.423742  normal  0.336707 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5935  hypothetical protein  30.31 
 
 
608 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0918921  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  29.17 
 
 
560 aa  72.4  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  30.41 
 
 
557 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  27.15 
 
 
537 aa  70.5  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  38.14 
 
 
559 aa  68.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  33.98 
 
 
628 aa  68.6  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  31.47 
 
 
577 aa  67  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  31.01 
 
 
579 aa  67  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  35.05 
 
 
564 aa  67  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  25.9 
 
 
493 aa  67  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  35.29 
 
 
510 aa  66.2  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  31.88 
 
 
524 aa  65.9  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  28.95 
 
 
531 aa  65.9  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  25.36 
 
 
497 aa  65.5  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  25.36 
 
 
497 aa  65.5  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2109  protein of unknown function DUF87  25.78 
 
 
688 aa  65.1  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000368581  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  25.36 
 
 
497 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  32.33 
 
 
496 aa  63.9  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  26.42 
 
 
670 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  27.67 
 
 
496 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  26.39 
 
 
563 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  33.33 
 
 
608 aa  62.8  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1720  ATPase  26.09 
 
 
504 aa  62.4  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4482  ATPase  25 
 
 
502 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.197027 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  25.16 
 
 
659 aa  62.4  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1337  hypothetical protein  27.57 
 
 
445 aa  62  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  32.32 
 
 
611 aa  62  0.000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2035  ATPase  23.29 
 
 
506 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3657  ATPase-like protein  24.75 
 
 
490 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16812  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0461  ATPase  24.64 
 
 
492 aa  60.5  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  26.97 
 
 
709 aa  60.8  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2167  AAA ATPase  23.74 
 
 
507 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.283139  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  34.41 
 
 
524 aa  60.5  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  26.55 
 
 
664 aa  60.1  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1920  hypothetical protein  23.53 
 
 
526 aa  59.7  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  28 
 
 
523 aa  59.7  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  29.5 
 
 
561 aa  60.1  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  25.85 
 
 
616 aa  59.7  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2157  AAA ATPase  23.47 
 
 
504 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.969754  normal  0.641302 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1948  AAA ATPase  23.47 
 
 
503 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.315114  normal  0.618024 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  26.77 
 
 
693 aa  59.3  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  26.17 
 
 
674 aa  59.3  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  28.81 
 
 
709 aa  59.3  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  29.52 
 
 
714 aa  59.3  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0592  hypothetical protein  22.94 
 
 
498 aa  58.9  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000492944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6263  hypothetical protein  23.72 
 
 
504 aa  58.9  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.311693 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1483  hypothetical protein  24.29 
 
 
511 aa  58.5  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1534  hypothetical protein  24.76 
 
 
513 aa  58.2  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.74675  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2732  hypothetical protein  24.02 
 
 
510 aa  58.5  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393853  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  31.52 
 
 
523 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  30.47 
 
 
546 aa  57.4  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1486  hypothetical protein  30.08 
 
 
560 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  26.09 
 
 
360 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  27.68 
 
 
679 aa  57.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  26.62 
 
 
591 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  27.48 
 
 
607 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1515  AAA ATPase  22.81 
 
 
504 aa  57  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1632  hypothetical protein  23.81 
 
 
514 aa  56.6  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3413  ATPase  23.15 
 
 
516 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.747505 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1184  ATPase  28.04 
 
 
1071 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  28.57 
 
 
575 aa  56.6  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1579  ATPase-like protein  24.53 
 
 
498 aa  56.6  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0994986  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0804  protein of unknown function DUF87  31.47 
 
 
629 aa  56.2  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  27.27 
 
 
605 aa  56.2  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5552  hypothetical protein  24.51 
 
 
498 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.508667  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3638  hypothetical protein  23.81 
 
 
500 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.689622  normal  0.0322237 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6246  AAA ATPase  21.5 
 
 
520 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7061  AAA ATPase  21.6 
 
 
500 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0332905  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  29.57 
 
 
559 aa  55.8  0.0000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  26.88 
 
 
569 aa  55.5  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  26.03 
 
 
557 aa  55.5  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  27.97 
 
 
593 aa  55.5  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1476  hypothetical protein  25 
 
 
670 aa  55.5  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.217881  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2283  AAA ATPase  22.79 
 
 
511 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.635866 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  29.9 
 
 
500 aa  54.7  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  25.98 
 
 
599 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  26.45 
 
 
579 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  33.33 
 
 
581 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  24 
 
 
594 aa  53.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  23.72 
 
 
544 aa  53.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  25.81 
 
 
674 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  35.44 
 
 
550 aa  53.5  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2792  protein of unknown function DUF87  25.81 
 
 
679 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.744858  normal  0.636348 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0018  protein of unknown function DUF87  40.51 
 
 
537 aa  53.1  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.989354  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  27.43 
 
 
623 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0795  ATPase-like protein  28.95 
 
 
396 aa  53.1  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.412059  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5114  AAA ATPase  23.96 
 
 
1076 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078899 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  27.72 
 
 
617 aa  52.8  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3751  hypothetical protein  23.38 
 
 
499 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0972722  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  27.34 
 
 
569 aa  52.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3442  hypothetical protein  23.38 
 
 
499 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.41425  normal  0.022696 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5744  hypothetical protein  25.93 
 
 
590 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575418 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>