More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1100 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_1117  HAD family hydrolase  100 
 
 
554 aa  1107    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.293003  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1423  HAD family hydrolase  70.31 
 
 
550 aa  752    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1100  HAD family hydrolase  100 
 
 
554 aa  1107    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.261757  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8838  hypothetical protein  35.29 
 
 
572 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1727  HAD family hydrolase  40.85 
 
 
227 aa  125  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1945  HAD family hydrolase  38.86 
 
 
250 aa  124  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.238634 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0730  SPP-like hydrolase  34.08 
 
 
222 aa  94  7e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.842566  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2884  SPP-like hydrolase  30.67 
 
 
233 aa  72.4  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4241  hydrolase, Cof family  25.85 
 
 
244 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3183  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.15 
 
 
265 aa  68.6  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0375981 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0362  HAD superfamily hydrolase  25.83 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.133771  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4220  putative hydrolase  25.53 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4398  Cof family hydrolase  25.73 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2460  HAD superfamily hydrolase  23.9 
 
 
257 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00284871  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  25 
 
 
270 aa  66.6  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2525  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.3 
 
 
257 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000564566  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1446  Cof-like hydrolase  25.38 
 
 
265 aa  65.5  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1919  SPP-like hydrolase  29.78 
 
 
234 aa  65.1  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2100  SPP-like hydrolase  29.22 
 
 
232 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1119  SPP-like hydrolase  32.42 
 
 
227 aa  64.3  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.660919  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3241  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.07 
 
 
274 aa  63.9  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6168  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  47.37 
 
 
268 aa  63.9  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0177  HAD family hydrolase  29.69 
 
 
264 aa  63.5  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0958993  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2261  HAD superfamily hydrolase  24.19 
 
 
257 aa  63.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.839309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2444  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.19 
 
 
257 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.385743 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2426  HAD superfamily hydrolase  24.19 
 
 
257 aa  63.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.560116  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0870  HAD superfamily hydrolase  25.62 
 
 
281 aa  63.5  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000525914  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0884  SPP-like hydrolase  32.24 
 
 
222 aa  62.8  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0257  hydrolase  30.77 
 
 
240 aa  63.2  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.509124  hitchhiker  0.000575913 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3699  Cof-like hydrolase  28.46 
 
 
265 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1561  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  26.64 
 
 
278 aa  61.6  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.100499  normal  0.0550731 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  26.15 
 
 
273 aa  61.2  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1377  HAD superfamily hydrolase  22.99 
 
 
270 aa  61.6  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.110042  hitchhiker  0.00000000000523684 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1422  phosphotransferase  26.28 
 
 
273 aa  61.2  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1097  HAD superfamily hydrolase  42.86 
 
 
273 aa  61.2  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000207763  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1166  SPP-like hydrolase  33.19 
 
 
240 aa  60.8  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2337  phosphoglycolate phosphatase  27.43 
 
 
226 aa  60.5  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.488898  normal  0.0135027 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2847  phosphotransferase  26.28 
 
 
273 aa  60.5  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00960  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.18 
 
 
282 aa  60.5  0.00000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  28.3 
 
 
265 aa  59.7  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0726  HAD superfamily hydrolase  25.91 
 
 
274 aa  60.1  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1081  Cof-like hydrolase  38.14 
 
 
284 aa  59.7  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00468672  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2939  SPP-like hydrolase  29.33 
 
 
232 aa  60.1  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000389482  normal  0.976262 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2934  phosphotransferase  25.91 
 
 
273 aa  59.3  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0685  SPP-like hydrolase  27.83 
 
 
231 aa  59.3  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  26.32 
 
 
267 aa  59.3  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.34 
 
 
278 aa  59.3  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.384246  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0788  SPP-like hydrolase  30.53 
 
 
228 aa  59.3  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00672208 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3917  Cof-like hydrolase  40.51 
 
 
273 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9904  predicted protein  36.27 
 
 
276 aa  58.5  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0646  HAD superfamily hydrolase  25.97 
 
 
267 aa  58.2  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  37.93 
 
 
267 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3948  Cof-like hydrolase  47.95 
 
 
274 aa  57.8  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2176  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.49 
 
 
258 aa  57.4  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.685473  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13847  hypothetical protein  28.63 
 
 
273 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.320421 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  37.93 
 
 
277 aa  57.4  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0638  hypothetical protein  28.7 
 
 
226 aa  57.4  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2000  HAD superfamily hydrolase  23.86 
 
 
273 aa  57.4  0.0000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0120  Cof-like hydrolase  47.22 
 
 
274 aa  57  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0559  putative HAD superfamily hydrolase  27.31 
 
 
281 aa  57  0.0000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0605487  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1830  Cof-like hydrolase  26.98 
 
 
260 aa  57  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3945  Cof-like hydrolase  33.33 
 
 
268 aa  57  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.411023 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0062  HAD superfamily hydrolase  38.03 
 
 
270 aa  57  0.0000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34680  glucosylglycerol-phosphate synthase  25.11 
 
 
750 aa  56.6  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.966141  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  23.55 
 
 
269 aa  56.6  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1881  Cof-like hydrolase  24.56 
 
 
284 aa  56.2  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.130463  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  37.93 
 
 
277 aa  56.6  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  41.89 
 
 
279 aa  55.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5432  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  38.46 
 
 
273 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.9 
 
 
266 aa  55.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452319  hitchhiker  0.00105022 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  26.87 
 
 
272 aa  55.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  39.76 
 
 
270 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0414  Cof-like hydrolase  25.48 
 
 
268 aa  56.2  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0522924  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5519  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  38.46 
 
 
273 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  25.76 
 
 
268 aa  55.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1953  HAD superfamily hydrolase  25.27 
 
 
270 aa  55.8  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0299  Cof-like hydrolase  30.19 
 
 
259 aa  55.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5525  HAD superfamily hydrolase  38.46 
 
 
273 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1965  SPP-like hydrolase  30.81 
 
 
230 aa  55.1  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0481119  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5248  HAD superfamily hydrolase  38.46 
 
 
273 aa  55.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.50022  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf242  COF family HAD hydrolase protein  32.18 
 
 
318 aa  55.1  0.000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00196152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5077  HAD superfamily hydrolase  38.46 
 
 
273 aa  55.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000418838  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5094  HAD superfamily hydrolase  38.46 
 
 
273 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970006  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5575  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  38.46 
 
 
273 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5646  HAD superfamily hydrolase  38.46 
 
 
273 aa  55.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  39.76 
 
 
270 aa  55.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2034  phosphoglycolate phosphatase  37.5 
 
 
226 aa  55.1  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.376803  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5491  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  38.46 
 
 
273 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  32.14 
 
 
276 aa  55.5  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  30.95 
 
 
276 aa  55.1  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  43.06 
 
 
285 aa  54.7  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4408  putative conserved hypothetical protein  31.82 
 
 
287 aa  54.7  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0949977 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2032  Cof-like hydrolase  24.26 
 
 
278 aa  54.7  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.201826 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1058  putative Cof-like hydrolase  23.27 
 
 
261 aa  55.1  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00385652  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02386  hypothetical protein  27.08 
 
 
268 aa  54.7  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4533  hypothetical protein  42.42 
 
 
287 aa  54.7  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.125216  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1083  Cof-like hydrolase  40 
 
 
257 aa  54.7  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1400  HAD superfamily hydrolase  27.31 
 
 
272 aa  54.7  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000750549  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1225  HAD superfamily hydrolase  22.74 
 
 
266 aa  54.7  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01700  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  42.47 
 
 
275 aa  54.3  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.616457 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>