179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0983 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  79.87 
 
 
611 aa  1045    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  76.62 
 
 
605 aa  959    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  100 
 
 
616 aa  1250    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  80.36 
 
 
608 aa  1034    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  38.15 
 
 
628 aa  392  1e-107  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  34.24 
 
 
531 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  29.77 
 
 
557 aa  234  4.0000000000000004e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  31.03 
 
 
496 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  28.57 
 
 
497 aa  206  1e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  28.32 
 
 
497 aa  204  3e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  27.88 
 
 
497 aa  204  4e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  30.49 
 
 
500 aa  201  3e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  28.9 
 
 
493 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  32.1 
 
 
496 aa  199  1.0000000000000001e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  28.97 
 
 
492 aa  191  4e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  29.71 
 
 
508 aa  188  2e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  29.31 
 
 
557 aa  182  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  28.83 
 
 
520 aa  160  8e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  27.99 
 
 
559 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  41.21 
 
 
564 aa  147  4.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  28.54 
 
 
559 aa  140  6e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  38.46 
 
 
560 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  28.85 
 
 
524 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  27.17 
 
 
581 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  26.49 
 
 
523 aa  126  2e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  26.06 
 
 
524 aa  125  3e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  24.84 
 
 
523 aa  120  6e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  31.33 
 
 
563 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  29.31 
 
 
561 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  35.54 
 
 
524 aa  112  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  35.23 
 
 
579 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  27.13 
 
 
612 aa  111  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  26.58 
 
 
544 aa  110  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  36.56 
 
 
594 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  24.95 
 
 
546 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  25.59 
 
 
569 aa  106  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  26.64 
 
 
628 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2238  protein of unknown function DUF87  26.43 
 
 
583 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  23.41 
 
 
607 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  23.27 
 
 
510 aa  105  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  26.93 
 
 
617 aa  103  7e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  25.77 
 
 
583 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  28.34 
 
 
570 aa  103  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2094  hypothetical protein  26.97 
 
 
582 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  26.33 
 
 
584 aa  103  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  34.55 
 
 
587 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  25.38 
 
 
575 aa  100  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1803  hypothetical protein  26.74 
 
 
626 aa  98.6  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321314  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  37.04 
 
 
674 aa  97.4  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  36.59 
 
 
659 aa  96.3  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  35.08 
 
 
670 aa  95.1  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  30.3 
 
 
595 aa  95.5  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  24.59 
 
 
600 aa  94.4  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5744  hypothetical protein  35.62 
 
 
590 aa  94  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575418 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  34.27 
 
 
591 aa  92.4  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  30.61 
 
 
577 aa  90.9  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1752  protein of unknown function DUF87  24.87 
 
 
643 aa  90.1  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  32.99 
 
 
679 aa  89.7  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  33.12 
 
 
664 aa  90.1  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  38.05 
 
 
617 aa  89.7  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1701  hypothetical protein  23.23 
 
 
539 aa  89  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.016697  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  34.42 
 
 
569 aa  89  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  30.61 
 
 
591 aa  89  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  31.5 
 
 
593 aa  88.2  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  27.49 
 
 
360 aa  88.2  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3526  hypothetical protein  36.75 
 
 
583 aa  87.8  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543626  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  33.33 
 
 
579 aa  87  9e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3715  hypothetical protein  27.68 
 
 
601 aa  87  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  28.41 
 
 
603 aa  86.7  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  25.12 
 
 
693 aa  84.3  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1389  hypothetical protein  23.45 
 
 
606 aa  84.7  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.103576 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  33.76 
 
 
662 aa  83.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  31.53 
 
 
714 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  23.79 
 
 
427 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  30.2 
 
 
709 aa  82.8  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1337  hypothetical protein  29.95 
 
 
445 aa  81.3  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  32.14 
 
 
709 aa  81.6  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0306  hypothetical protein  25.89 
 
 
530 aa  80.9  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1140  protein of unknown function DUF87  24.38 
 
 
554 aa  80.1  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  31.55 
 
 
623 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3967  AAA ATPase  25.68 
 
 
1046 aa  79  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  32.87 
 
 
550 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1259  protein of unknown function DUF87  23.76 
 
 
540 aa  77.8  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2792  protein of unknown function DUF87  30.57 
 
 
679 aa  77.8  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.744858  normal  0.636348 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  33.63 
 
 
599 aa  77.4  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  30.57 
 
 
674 aa  77.4  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0018  protein of unknown function DUF87  24.03 
 
 
537 aa  76.6  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.989354  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1486  hypothetical protein  31.69 
 
 
560 aa  76.6  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0326  hypothetical protein  25.26 
 
 
530 aa  75.9  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0753  protein of unknown function DUF87  28.24 
 
 
506 aa  75.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0799035  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2366  protein of unknown function DUF87  25.52 
 
 
592 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.250268  normal  0.14702 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0926  protein of unknown function DUF87  24.6 
 
 
553 aa  73.9  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_268  hypothetical protein  24.19 
 
 
530 aa  73.2  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0941  AAA ATPase  24.95 
 
 
456 aa  71.6  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0685894 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2030  hypothetical protein  30.15 
 
 
589 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1585  protein of unknown function DUF87  33.9 
 
 
572 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.049395 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  32.5 
 
 
526 aa  69.7  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1450  protein of unknown function DUF87  22.39 
 
 
581 aa  68.9  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0452751  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2549  hypothetical protein  23.36 
 
 
542 aa  69.3  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.170922  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1515  protein of unknown function DUF87  22.9 
 
 
530 aa  68.6  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.649754  normal  0.132485 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>