99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1337 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1337  hypothetical protein  100 
 
 
445 aa  912    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0795  ATPase-like protein  30.71 
 
 
396 aa  190  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.412059  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0340  ATPase-like protein  33.58 
 
 
359 aa  189  5.999999999999999e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0340  protein of unknown function DUF87  33.49 
 
 
379 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0311557 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0213  hypothetical protein  33.17 
 
 
363 aa  177  4e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0846575  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2628  hypothetical protein  33.99 
 
 
351 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.791354  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  30.11 
 
 
508 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3943  hypothetical protein  29.43 
 
 
466 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  23.85 
 
 
496 aa  102  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  24.8 
 
 
557 aa  99.4  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  26.53 
 
 
608 aa  84.3  0.000000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  25.79 
 
 
531 aa  82.4  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  29.95 
 
 
616 aa  81.3  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  28.95 
 
 
611 aa  80.1  0.00000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  26.24 
 
 
523 aa  75.9  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  24.22 
 
 
579 aa  75.9  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  29.47 
 
 
605 aa  74.7  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  24.88 
 
 
523 aa  67.4  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  27.39 
 
 
628 aa  66.6  0.0000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  25.68 
 
 
557 aa  63.5  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  23.51 
 
 
510 aa  63.2  0.000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  25 
 
 
559 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  25.12 
 
 
524 aa  63.2  0.000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  24.07 
 
 
524 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0355  ATPase-like protein  27.57 
 
 
250 aa  62  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  29.95 
 
 
674 aa  60.1  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  25.11 
 
 
524 aa  60.1  0.00000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  25.25 
 
 
560 aa  59.7  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  22.25 
 
 
564 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  29.6 
 
 
575 aa  59.3  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1389  hypothetical protein  32.39 
 
 
606 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.103576 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  33.33 
 
 
664 aa  58.2  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  32.09 
 
 
659 aa  57.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  24.4 
 
 
563 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  30.33 
 
 
623 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  28.02 
 
 
492 aa  57  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  22.75 
 
 
360 aa  56.6  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  26.56 
 
 
500 aa  56.6  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1374  protein of unknown function DUF87  25.53 
 
 
538 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.627609 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  22.45 
 
 
569 aa  56.2  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  27.66 
 
 
670 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  23.9 
 
 
520 aa  55.5  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  31.54 
 
 
579 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  25.87 
 
 
599 aa  55.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  30.22 
 
 
709 aa  55.1  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  31.54 
 
 
607 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  21.15 
 
 
569 aa  54.7  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2778  hypothetical protein  26.26 
 
 
580 aa  54.3  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145513  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  28.16 
 
 
587 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  33.04 
 
 
546 aa  53.9  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  29.37 
 
 
595 aa  53.9  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  23.73 
 
 
496 aa  53.1  0.000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1312  protein of unknown function DUF87  25.17 
 
 
911 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00374873  unclonable  0.0000000332559 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  28.47 
 
 
617 aa  52  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2369  hypothetical protein  25 
 
 
659 aa  52.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70292  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  26.17 
 
 
594 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  28.57 
 
 
497 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3041  protein of unknown function DUF87  28.38 
 
 
744 aa  51.2  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  26.34 
 
 
497 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5115  hypothetical protein  26.06 
 
 
595 aa  50.8  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1752  protein of unknown function DUF87  28.22 
 
 
643 aa  50.8  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  28.57 
 
 
497 aa  50.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1865  hypothetical protein  25.17 
 
 
655 aa  50.8  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0131162 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  27.27 
 
 
581 aa  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  28.57 
 
 
544 aa  50.1  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  30.28 
 
 
574 aa  49.3  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  27.69 
 
 
593 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  32.94 
 
 
714 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  28.33 
 
 
577 aa  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  23.23 
 
 
561 aa  47.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  27.42 
 
 
537 aa  47.8  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0635  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  22.78 
 
 
513 aa  47.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  27.03 
 
 
493 aa  47.8  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  33.33 
 
 
570 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2366  protein of unknown function DUF87  25.74 
 
 
592 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.250268  normal  0.14702 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2180  AAA ATPase  24.6 
 
 
777 aa  47.4  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.520189  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  38.67 
 
 
570 aa  47.4  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  31.33 
 
 
591 aa  47  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  30 
 
 
526 aa  47  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1585  protein of unknown function DUF87  24.24 
 
 
572 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.049395 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2030  hypothetical protein  30.34 
 
 
589 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309935 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  38.81 
 
 
662 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1138  hypothetical protein  28.26 
 
 
902 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  35.71 
 
 
550 aa  45.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0753  protein of unknown function DUF87  29.03 
 
 
506 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0799035  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1070  hypothetical protein  37.5 
 
 
452 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  36.25 
 
 
600 aa  45.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  28.09 
 
 
591 aa  45.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1296  AAA ATPase  23.98 
 
 
537 aa  45.1  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0819436 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1098  hypothetical protein  39.51 
 
 
521 aa  44.3  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  34.38 
 
 
583 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1551  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  25.54 
 
 
490 aa  44.3  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  27.05 
 
 
709 aa  44.3  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  35.16 
 
 
427 aa  43.9  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2792  protein of unknown function DUF87  28.81 
 
 
679 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.744858  normal  0.636348 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  32.29 
 
 
612 aa  43.9  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0926  protein of unknown function DUF87  25.68 
 
 
553 aa  43.5  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1250  ATPase  29.73 
 
 
1040 aa  43.1  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.515643 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0467  ATPase-like protein  28.22 
 
 
1034 aa  43.1  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.634618 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>