78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0213 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0213  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  727    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0846575  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0340  ATPase-like protein  66.85 
 
 
359 aa  469  1.0000000000000001e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2628  hypothetical protein  57.23 
 
 
351 aa  392  1e-108  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.791354  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0340  protein of unknown function DUF87  51.93 
 
 
379 aa  312  6.999999999999999e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0311557 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1337  hypothetical protein  33.17 
 
 
445 aa  177  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0795  ATPase-like protein  29.79 
 
 
396 aa  113  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.412059  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  25.33 
 
 
496 aa  82  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  27.75 
 
 
531 aa  76.6  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  26.61 
 
 
508 aa  75.1  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  33.12 
 
 
587 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  28.12 
 
 
674 aa  65.1  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  29.8 
 
 
616 aa  63.2  0.000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  32.89 
 
 
579 aa  62.8  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  28.71 
 
 
608 aa  62.8  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  27.73 
 
 
605 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  28.43 
 
 
611 aa  60.8  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  29.93 
 
 
664 aa  60.8  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  22.61 
 
 
557 aa  59.7  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  24.75 
 
 
564 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  29.63 
 
 
550 aa  58.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5115  hypothetical protein  30.18 
 
 
595 aa  57.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  26.95 
 
 
563 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  23.76 
 
 
559 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  33.08 
 
 
577 aa  57  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3041  protein of unknown function DUF87  29.59 
 
 
744 aa  56.6  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  22.83 
 
 
524 aa  55.5  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2778  hypothetical protein  29.26 
 
 
580 aa  55.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145513  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  30.41 
 
 
623 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  30.34 
 
 
617 aa  54.3  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  25.97 
 
 
670 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  29.41 
 
 
595 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  23.56 
 
 
557 aa  53.9  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  28.65 
 
 
524 aa  53.1  0.000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  26.67 
 
 
709 aa  52.8  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  31.54 
 
 
594 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  27.46 
 
 
607 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  29.78 
 
 
523 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  24.65 
 
 
659 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  29.79 
 
 
679 aa  51.2  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  22.66 
 
 
496 aa  50.4  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2369  hypothetical protein  26.79 
 
 
659 aa  50.4  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70292  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  31.78 
 
 
579 aa  49.7  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0635  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  29.17 
 
 
513 aa  50.1  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  23.16 
 
 
560 aa  50.1  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  26.79 
 
 
526 aa  49.7  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  28.57 
 
 
599 aa  49.3  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  27.43 
 
 
714 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  31.37 
 
 
574 aa  48.5  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  27.01 
 
 
570 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  29.41 
 
 
603 aa  48.1  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1865  hypothetical protein  26.55 
 
 
655 aa  48.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0131162 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  25.29 
 
 
523 aa  48.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  29.61 
 
 
628 aa  47.8  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  24.49 
 
 
591 aa  47  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  36.27 
 
 
600 aa  47  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  28.77 
 
 
591 aa  47  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  27.4 
 
 
709 aa  46.6  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  31.5 
 
 
544 aa  46.2  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1849  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  37.7 
 
 
511 aa  45.4  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.892343  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1389  hypothetical protein  32.58 
 
 
606 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.103576 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  26.72 
 
 
427 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  25.07 
 
 
360 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0343  hypothetical protein  36.07 
 
 
499 aa  45.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  28.12 
 
 
537 aa  45.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  23.8 
 
 
524 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  27.5 
 
 
581 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  26.55 
 
 
593 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0050  hypothetical protein  27.78 
 
 
450 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.620647  normal  0.225924 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3943  hypothetical protein  39.6 
 
 
466 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0321  hypothetical protein  36.07 
 
 
499 aa  43.9  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0010  AAA family ATPase  27.78 
 
 
450 aa  43.5  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.211649  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1485  hypothetical protein  28 
 
 
450 aa  43.5  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.900748  hitchhiker  0.00472282 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2256  hypothetical protein  24.67 
 
 
651 aa  43.1  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.562267  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22220  predicted ATPase  25 
 
 
544 aa  42.7  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.198348 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3313  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  24.2 
 
 
565 aa  42.7  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3715  hypothetical protein  29.32 
 
 
601 aa  42.7  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  25.3 
 
 
561 aa  42.7  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0355  ATPase-like protein  21.69 
 
 
250 aa  42.7  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>