70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0340 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0340  ATPase-like protein  100 
 
 
359 aa  712    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0213  hypothetical protein  66.85 
 
 
363 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0846575  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2628  hypothetical protein  59.71 
 
 
351 aa  404  1e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.791354  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0340  protein of unknown function DUF87  54.47 
 
 
379 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0311557 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1337  hypothetical protein  33.58 
 
 
445 aa  189  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0795  ATPase-like protein  32.18 
 
 
396 aa  122  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.412059  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  27.12 
 
 
564 aa  84  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  23.61 
 
 
496 aa  78.2  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  24.86 
 
 
508 aa  77  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  31.12 
 
 
674 aa  76.3  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  23.53 
 
 
531 aa  74.7  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  31.95 
 
 
664 aa  70.1  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  25.28 
 
 
559 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  22.16 
 
 
557 aa  64.3  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  25.64 
 
 
605 aa  62.4  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  24.27 
 
 
616 aa  62.8  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  22.96 
 
 
608 aa  62.4  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  28.05 
 
 
623 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  22.69 
 
 
611 aa  60.1  0.00000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  31.37 
 
 
579 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  29.24 
 
 
679 aa  58.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  28.48 
 
 
595 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  28.39 
 
 
550 aa  54.3  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  24.43 
 
 
560 aa  52.8  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  35.51 
 
 
577 aa  51.6  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  26.03 
 
 
709 aa  51.6  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  30.56 
 
 
567 aa  50.8  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3041  protein of unknown function DUF87  30.59 
 
 
744 aa  51.2  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  24.54 
 
 
524 aa  51.2  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  25.35 
 
 
659 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3943  hypothetical protein  25.29 
 
 
466 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  27.92 
 
 
587 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  27.97 
 
 
574 aa  49.7  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  25.48 
 
 
670 aa  49.7  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  27.04 
 
 
593 aa  49.7  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5115  hypothetical protein  29.41 
 
 
595 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  26.53 
 
 
591 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  28.57 
 
 
599 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  30 
 
 
603 aa  48.5  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  27.45 
 
 
714 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1865  hypothetical protein  28.31 
 
 
655 aa  47.8  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0131162 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  32.43 
 
 
427 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  24.29 
 
 
591 aa  47.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  30.51 
 
 
537 aa  47.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  26.72 
 
 
544 aa  47.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2778  hypothetical protein  29.34 
 
 
580 aa  47  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145513  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  30.84 
 
 
579 aa  47  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  25.66 
 
 
594 aa  47  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  20.75 
 
 
557 aa  47  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  29.01 
 
 
569 aa  46.6  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  27.27 
 
 
523 aa  46.6  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  32.81 
 
 
570 aa  46.2  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  23.6 
 
 
709 aa  46.2  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  24.72 
 
 
524 aa  46.2  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  25.61 
 
 
360 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  22.08 
 
 
493 aa  45.4  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  19.19 
 
 
496 aa  45.8  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2369  hypothetical protein  26.51 
 
 
659 aa  45.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70292  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  23.7 
 
 
617 aa  45.4  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1486  hypothetical protein  30.08 
 
 
560 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3715  hypothetical protein  28.93 
 
 
601 aa  44.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  25.14 
 
 
524 aa  43.9  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3193  hypothetical protein  23.21 
 
 
653 aa  43.5  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  29.32 
 
 
600 aa  43.1  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  21.85 
 
 
526 aa  43.1  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  23.6 
 
 
563 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  22.3 
 
 
607 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0941  AAA ATPase  22.73 
 
 
456 aa  42.7  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0685894 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  26.35 
 
 
575 aa  42.7  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0816  hypothetical protein  24.63 
 
 
452 aa  42.7  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.723695  normal  0.916322 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>