93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0816 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1070  hypothetical protein  78.98 
 
 		 452 aa  760    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0941  AAA ATPase  83.59 
 
 		 456 aa  799    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0685894 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0816  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  912    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.723695  normal  0.916322 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1344  hypothetical protein  84.7 
 
 		 451 aa  804    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0047  hypothetical protein  53.46 
 
 		 486 aa  498  1e-140  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  33.77 
 
 		 524 aa  81.6  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  26.6 
 
 		 557 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1184  ATPase  31.54 
 
 		 1071 aa  73.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  24.79 
 
 		 492 aa  73.6  0.000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  22.71 
 
 		 496 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  24.47 
 
 		 493 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  23.01 
 
 		 611 aa  67  0.0000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  23.54 
 
 		 497 aa  65.1  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0018  protein of unknown function DUF87  30.19 
 
 		 537 aa  65.1  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.989354  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  23.81 
 
 		 497 aa  64.3  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  23.9 
 
 		 524 aa  64.3  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  36.54 
 
 		 496 aa  64.3  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  24.94 
 
 		 508 aa  62.8  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  23.81 
 
 		 497 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2164  hypothetical protein  31.88 
 
 		 582 aa  62  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000710411 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  22.17 
 
 		 608 aa  60.5  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  29.5 
 
 		 523 aa  60.1  0.00000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  26.25 
 
 		 510 aa  59.3  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  23.65 
 
 		 616 aa  59.7  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  30.14 
 
 		 559 aa  54.3  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1553  conserved hypothetical protein  23.14 
 
 		 998 aa  53.9  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  30.85 
 
 		 674 aa  53.1  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  26.21 
 
 		 500 aa  52.8  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  27.74 
 
 		 523 aa  52  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  25.48 
 
 		 594 aa  51.6  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5114  AAA ATPase  27.82 
 
 		 1076 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078899 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  33.63 
 
 		 623 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  22.27 
 
 		 520 aa  51.2  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3326  hypothetical protein  31.09 
 
 		 800 aa  50.4  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000795061  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  29.7 
 
 		 524 aa  50.4  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  27.22 
 
 		 560 aa  50.1  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  26.62 
 
 		 537 aa  49.3  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2632  ATPase  28.57 
 
 		 319 aa  49.7  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.57356 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5089  AAA ATPase  24.14 
 
 		 1100 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0231758  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1450  protein of unknown function DUF87  25.71 
 
 		 581 aa  49.7  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0452751  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1259  protein of unknown function DUF87  22.4 
 
 		 540 aa  48.5  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  23.46 
 
 		 583 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3279  hypothetical protein  25.15 
 
 		 590 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  32.46 
 
 		 607 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2263  ATPase-like protein  22.08 
 
 		 533 aa  48.5  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.539345 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  29.41 
 
 		 563 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  28.46 
 
 		 605 aa  48.1  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  22.86 
 
 		 612 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  35 
 
 		 662 aa  47.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  26.9 
 
 		 628 aa  47.8  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1484  hypothetical protein  28.95 
 
 		 1144 aa  47.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0469742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  22.64 
 
 		 531 aa  47.8  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  31.61 
 
 		 561 aa  47.4  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  32.98 
 
 		 557 aa  47.4  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3942  hypothetical protein  28.45 
 
 		 721 aa  47.4  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.222103  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2180  AAA ATPase  21.29 
 
 		 777 aa  47  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.520189  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3423  AAA ATPase  29.58 
 
 		 1104 aa  47  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.598451  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2954  hypothetical protein  24.36 
 
 		 589 aa  46.6  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000103337 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5149  AAA ATPase  31.63 
 
 		 1031 aa  47  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120671  normal  0.52051 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  33.33 
 
 		 709 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  30.68 
 
 		 595 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  30.08 
 
 		 600 aa  45.8  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  26.3 
 
 		 569 aa  46.2  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  35.62 
 
 		 579 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2490  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  32.81 
 
 		 629 aa  46.6  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  34.67 
 
 		 587 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  21.24 
 
 		 546 aa  45.8  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  30.36 
 
 		 550 aa  45.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1183  AAA ATPase  30.61 
 
 		 1043 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  35.9 
 
 		 427 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6729  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  26.61 
 
 		 830 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577691  normal  0.546954 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  26.87 
 
 		 564 aa  45.8  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  29.82 
 
 		 591 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  32.53 
 
 		 593 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  23.46 
 
 		 584 aa  45.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  22.19 
 
 		 575 aa  45.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2019  protein of unknown function DUF87  27.66 
 
 		 700 aa  44.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  23.18 
 
 		 617 aa  45.1  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  29.41 
 
 		 599 aa  44.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  23.46 
 
 		 628 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  27.97 
 
 		 559 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2366  protein of unknown function DUF87  31.03 
 
 		 592 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.250268  normal  0.14702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  32.18 
 
 		 570 aa  44.3  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  32.43 
 
 		 693 aa  44.3  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  27.61 
 
 		 659 aa  44.3  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3967  AAA ATPase  26.52 
 
 		 1046 aa  43.9  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1389  hypothetical protein  29.17 
 
 		 606 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.103576 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0349  protein of unknown function DUF87  22.42 
 
 		 540 aa  43.5  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2242  hypothetical protein  29.5 
 
 		 658 aa  43.5  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2094  hypothetical protein  22.78 
 
 		 582 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2238  protein of unknown function DUF87  22.91 
 
 		 583 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3193  hypothetical protein  27.34 
 
 		 653 aa  43.1  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0326  hypothetical protein  22.97 
 
 		 530 aa  43.1  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>