113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1184 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2709  ATPase-like  38.45 
 
 		 1106 aa  717    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1184  ATPase  100 
 
 		 1071 aa  2170    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5114  AAA ATPase  45.69 
 
 		 1076 aa  840    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078899 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1183  AAA ATPase  38.01 
 
 		 1043 aa  609  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5089  AAA ATPase  34.87 
 
 		 1100 aa  530  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0231758  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3967  AAA ATPase  32.15 
 
 		 1046 aa  437  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1484  hypothetical protein  42.72 
 
 		 1144 aa  416  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0469742  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3423  AAA ATPase  36.91 
 
 		 1104 aa  350  7e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.598451  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5149  AAA ATPase  48.05 
 
 		 1031 aa  341  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120671  normal  0.52051 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2632  ATPase  50.8 
 
 		 319 aa  279  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.57356 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2631  hypothetical protein  33.07 
 
 		 886 aa  269  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.703653 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2606  hypothetical protein  30.92 
 
 		 1050 aa  155  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320925  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3193  hypothetical protein  29.2 
 
 		 653 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2242  hypothetical protein  29.91 
 
 		 658 aa  113  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4031  hypothetical protein  28.98 
 
 		 802 aa  113  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1346  hypothetical protein  28.57 
 
 		 859 aa  111  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1505  hypothetical protein  28.24 
 
 		 753 aa  109  2e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1696  hypothetical protein  28.45 
 
 		 764 aa  109  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000294033  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0983  hypothetical protein  27.82 
 
 		 762 aa  103  2e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.137038  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3326  hypothetical protein  26.17 
 
 		 800 aa  100  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000795061  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1236  hypothetical protein  27.19 
 
 		 859 aa  100  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1085  hypothetical protein  27.58 
 
 		 847 aa  94.7  8e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  24.59 
 
 		 496 aa  92.4  4e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0239  hypothetical protein  28.01 
 
 		 734 aa  90.9  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.72436  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1311  hypothetical protein  27.18 
 
 		 847 aa  90.9  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  25.97 
 
 		 523 aa  87  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  25.57 
 
 		 523 aa  84.3  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  25.56 
 
 		 524 aa  84.3  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  23.92 
 
 		 557 aa  79.7  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  24.68 
 
 		 508 aa  75.1  0.000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0816  hypothetical protein  31.54 
 
 		 452 aa  73.6  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.723695  normal  0.916322 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  25.79 
 
 		 546 aa  72.4  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  27.03 
 
 		 524 aa  72  0.00000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  25.37 
 
 		 524 aa  69.7  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  24.63 
 
 		 564 aa  69.3  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0941  AAA ATPase  30.56 
 
 		 456 aa  68.6  0.0000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0685894 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1070  hypothetical protein  28.14 
 
 		 452 aa  67.8  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  27.57 
 
 		 360 aa  67.8  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1344  hypothetical protein  29.14 
 
 		 451 aa  67  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  24.23 
 
 		 561 aa  66.2  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  23.82 
 
 		 608 aa  64.3  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  23.88 
 
 		 605 aa  63.2  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  25.86 
 
 		 559 aa  62.4  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  22.6 
 
 		 563 aa  62.4  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  23.6 
 
 		 616 aa  60.8  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  28.24 
 
 		 559 aa  60.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1803  hypothetical protein  25.23 
 
 		 626 aa  59.7  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321314  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0018  protein of unknown function DUF87  29.11 
 
 		 537 aa  58.9  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.989354  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0047  hypothetical protein  27.7 
 
 		 486 aa  58.9  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  23.19 
 
 		 611 aa  58.2  0.0000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1913  ATPase-like protein  24.19 
 
 		 578 aa  58.2  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0219994  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  21.52 
 
 		 550 aa  58.2  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  20.43 
 
 		 496 aa  57.4  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  29.82 
 
 		 557 aa  57.4  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  29.36 
 
 		 531 aa  57  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  26.51 
 
 		 575 aa  57  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0355  ATPase-like protein  28.04 
 
 		 250 aa  56.2  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  29.41 
 
 		 544 aa  56.6  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  27.84 
 
 		 612 aa  56.2  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  26.49 
 
 		 674 aa  55.8  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  24.5 
 
 		 492 aa  55.1  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  29.31 
 
 		 628 aa  53.9  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6133  ATPase-like protein  28.44 
 
 		 630 aa  53.9  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.869987  normal  0.698643 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  30.97 
 
 		 709 aa  53.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2386  ATPase-like protein  24.89 
 
 		 589 aa  53.5  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000327253  hitchhiker  0.000621551 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  19.79 
 
 		 497 aa  53.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5744  hypothetical protein  23.6 
 
 		 590 aa  52.8  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575418 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  25.74 
 
 		 537 aa  52.8  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  19.84 
 
 		 497 aa  52.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1662  hypothetical protein  26.83 
 
 		 577 aa  52  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  22.7 
 
 		 579 aa  51.6  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3775  hypothetical protein  24.34 
 
 		 613 aa  51.2  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  30.77 
 
 		 623 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1417  hypothetical protein  28.85 
 
 		 606 aa  51.2  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0731587  normal  0.0956406 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  19.79 
 
 		 497 aa  50.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  29.36 
 
 		 599 aa  50.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  28 
 
 		 595 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  36.92 
 
 		 526 aa  50.1  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  24.87 
 
 		 587 aa  49.7  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  35.29 
 
 		 628 aa  49.7  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  27.61 
 
 		 569 aa  49.7  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1553  hypothetical protein  26.85 
 
 		 582 aa  49.7  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.623642 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  29.36 
 
 		 570 aa  49.7  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  25.28 
 
 		 679 aa  49.7  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  27.83 
 
 		 664 aa  49.3  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1498  hypothetical protein  27.27 
 
 		 582 aa  49.3  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  35.29 
 
 		 617 aa  48.9  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  35.29 
 
 		 584 aa  48.9  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3526  hypothetical protein  27.97 
 
 		 583 aa  48.9  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  35.29 
 
 		 583 aa  48.5  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2238  protein of unknown function DUF87  24.34 
 
 		 583 aa  48.5  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  29.36 
 
 		 591 aa  48.9  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  33.82 
 
 		 674 aa  48.5  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1724  ATPase  26.76 
 
 		 585 aa  48.9  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  27.68 
 
 		 693 aa  48.5  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  20.16 
 
 		 493 aa  48.5  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3715  hypothetical protein  24.49 
 
 		 601 aa  48.5  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0907  hypothetical protein  22.94 
 
 		 571 aa  48.5  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  27.27 
 
 		 569 aa  48.1  0.0009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1906  hypothetical protein  20.83 
 
 		 579 aa  47.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000004225  normal  0.0184215 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>