26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1498 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4029  ATPase-like protein  73.52 
 
 
580 aa  805    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.878422 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1913  ATPase-like protein  64.68 
 
 
578 aa  727    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0219994  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1553  hypothetical protein  97.08 
 
 
582 aa  1140    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.623642 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2386  ATPase-like protein  65.06 
 
 
589 aa  693    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000327253  hitchhiker  0.000621551 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1498  hypothetical protein  100 
 
 
582 aa  1165    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3775  hypothetical protein  67.77 
 
 
613 aa  694    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464348  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1417  hypothetical protein  48.66 
 
 
606 aa  493  9.999999999999999e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0731587  normal  0.0956406 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1662  hypothetical protein  46.92 
 
 
577 aa  459  9.999999999999999e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1724  ATPase  45.6 
 
 
585 aa  451  1e-125  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0907  hypothetical protein  41.2 
 
 
571 aa  399  9.999999999999999e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6133  ATPase-like protein  40.62 
 
 
630 aa  361  2e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.869987  normal  0.698643 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1563  ATPase-like protein  33.11 
 
 
611 aa  261  2e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1514  ATPase-like protein  33.11 
 
 
611 aa  261  2e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0452  hypothetical protein  28.91 
 
 
682 aa  143  8e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3423  AAA ATPase  33.63 
 
 
1104 aa  55.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.598451  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  25 
 
 
496 aa  51.2  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  26.32 
 
 
679 aa  49.3  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1184  ATPase  27.27 
 
 
1071 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2709  ATPase-like  26.79 
 
 
1106 aa  46.6  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  29.52 
 
 
570 aa  46.2  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  26.06 
 
 
544 aa  45.8  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  26.24 
 
 
579 aa  46.2  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1183  AAA ATPase  28.57 
 
 
1043 aa  45.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3642  ATPase-like  25.47 
 
 
558 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.361749  normal  0.410506 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  25.47 
 
 
557 aa  44.3  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3967  AAA ATPase  29.91 
 
 
1046 aa  44.3  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>