28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1553 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2386  ATPase-like protein  64.7 
 
 		 589 aa  691    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000327253  hitchhiker  0.000621551 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1913  ATPase-like protein  63.93 
 
 		 578 aa  725    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0219994  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1498  hypothetical protein  97.08 
 
 		 582 aa  1140    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4029  ATPase-like protein  73.35 
 
 		 580 aa  805    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.878422 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1553  hypothetical protein  100 
 
 		 582 aa  1167    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.623642 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3775  hypothetical protein  67.85 
 
 		 613 aa  690    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1417  hypothetical protein  48.66 
 
 		 606 aa  492  9.999999999999999e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0731587  normal  0.0956406 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1662  hypothetical protein  47.1 
 
 		 577 aa  461  9.999999999999999e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1724  ATPase  45.6 
 
 		 585 aa  451  1e-125  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0907  hypothetical protein  41.2 
 
 		 571 aa  399  9.999999999999999e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6133  ATPase-like protein  40.79 
 
 		 630 aa  364  2e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.869987  normal  0.698643 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1514  ATPase-like protein  33 
 
 		 611 aa  263  6.999999999999999e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1563  ATPase-like protein  33 
 
 		 611 aa  263  6.999999999999999e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0452  hypothetical protein  28.6 
 
 		 682 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3423  AAA ATPase  32.74 
 
 		 1104 aa  53.5  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.598451  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  25 
 
 		 496 aa  51.6  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1184  ATPase  26.85 
 
 		 1071 aa  49.7  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  26.32 
 
 		 679 aa  48.5  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  30.48 
 
 		 570 aa  47.8  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  26.06 
 
 		 544 aa  46.6  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2709  ATPase-like  25.23 
 
 		 1106 aa  46.6  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  29.46 
 
 		 579 aa  46.2  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3967  AAA ATPase  30.84 
 
 		 1046 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5744  hypothetical protein  30.48 
 
 		 590 aa  45.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575418 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  29.09 
 
 		 607 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  25.47 
 
 		 557 aa  43.9  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  26.05 
 
 		 560 aa  43.9  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1183  AAA ATPase  27.95 
 
 		 1043 aa  43.9  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>