19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3775 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4029  ATPase-like protein  66.6 
 
 
580 aa  689    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.878422 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1553  hypothetical protein  68.09 
 
 
582 aa  711    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.623642 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1913  ATPase-like protein  65.39 
 
 
578 aa  729    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0219994  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2386  ATPase-like protein  74.15 
 
 
589 aa  834    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000327253  hitchhiker  0.000621551 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3775  hypothetical protein  100 
 
 
613 aa  1217    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464348  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1498  hypothetical protein  68.83 
 
 
582 aa  714    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1417  hypothetical protein  47.76 
 
 
606 aa  453  1.0000000000000001e-126  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0731587  normal  0.0956406 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1724  ATPase  45.3 
 
 
585 aa  447  1.0000000000000001e-124  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1662  hypothetical protein  47.8 
 
 
577 aa  441  9.999999999999999e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0907  hypothetical protein  39.89 
 
 
571 aa  394  1e-108  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6133  ATPase-like protein  39.32 
 
 
630 aa  349  7e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.869987  normal  0.698643 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1563  ATPase-like protein  32.2 
 
 
611 aa  253  8.000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1514  ATPase-like protein  32.2 
 
 
611 aa  253  8.000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0452  hypothetical protein  30.8 
 
 
682 aa  146  9e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1184  ATPase  24.34 
 
 
1071 aa  51.6  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3423  AAA ATPase  30 
 
 
1104 aa  46.2  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.598451  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  25.66 
 
 
496 aa  45.8  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  26.38 
 
 
579 aa  44.3  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  28.76 
 
 
570 aa  43.5  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.997931 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>