42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1514 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1563  ATPase-like protein  100 
 
 
611 aa  1244    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1514  ATPase-like protein  100 
 
 
611 aa  1244    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1662  hypothetical protein  35.21 
 
 
577 aa  278  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0907  hypothetical protein  32.53 
 
 
571 aa  277  4e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1913  ATPase-like protein  34 
 
 
578 aa  276  6e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0219994  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1724  ATPase  32.9 
 
 
585 aa  275  2.0000000000000002e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2386  ATPase-like protein  33 
 
 
589 aa  273  6e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000327253  hitchhiker  0.000621551 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1553  hypothetical protein  33 
 
 
582 aa  263  8e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.623642 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1498  hypothetical protein  33.11 
 
 
582 aa  261  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1417  hypothetical protein  33.71 
 
 
606 aa  255  2.0000000000000002e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0731587  normal  0.0956406 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4029  ATPase-like protein  36.44 
 
 
580 aa  250  5e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.878422 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3775  hypothetical protein  32.86 
 
 
613 aa  239  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464348  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6133  ATPase-like protein  30 
 
 
630 aa  221  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.869987  normal  0.698643 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0452  hypothetical protein  25.49 
 
 
682 aa  130  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  22.43 
 
 
608 aa  66.2  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  26.51 
 
 
557 aa  61.2  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  29.41 
 
 
531 aa  57.4  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  24.22 
 
 
560 aa  57  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  28.65 
 
 
674 aa  55.5  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  25.15 
 
 
563 aa  54.7  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  22.86 
 
 
679 aa  53.5  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1515  protein of unknown function DUF87  22.98 
 
 
530 aa  52.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.649754  normal  0.132485 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  25.88 
 
 
561 aa  51.6  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0937  hypothetical protein  25 
 
 
540 aa  50.8  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0147133  normal  0.254287 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  23.57 
 
 
611 aa  50.4  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  23.95 
 
 
559 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  19.75 
 
 
493 aa  49.3  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  23.42 
 
 
616 aa  49.7  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  25.24 
 
 
496 aa  48.9  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0751  protein of unknown function DUF87  25.61 
 
 
499 aa  48.9  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.14388  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  25.74 
 
 
591 aa  47.8  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  25.88 
 
 
664 aa  47.4  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3642  ATPase-like  30.28 
 
 
558 aa  47.8  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.361749  normal  0.410506 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  25.52 
 
 
605 aa  47.4  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  24.36 
 
 
617 aa  47.4  0.0007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  25.32 
 
 
599 aa  47.4  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1482  hypothetical protein  27.67 
 
 
546 aa  47  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.431628  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0074  hypothetical protein  23.46 
 
 
495 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0871233  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2787  hypothetical protein  26.67 
 
 
624 aa  46.2  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  23.9 
 
 
569 aa  45.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  20.89 
 
 
496 aa  44.7  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1619  hypothetical protein  27.78 
 
 
532 aa  44.7  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>