26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1724 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1662  hypothetical protein  70.96 
 
 
577 aa  809    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1724  ATPase  100 
 
 
585 aa  1188    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1417  hypothetical protein  49.17 
 
 
606 aa  532  1e-150  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0731587  normal  0.0956406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1913  ATPase-like protein  48.78 
 
 
578 aa  477  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0219994  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2386  ATPase-like protein  45.74 
 
 
589 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000327253  hitchhiker  0.000621551 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1553  hypothetical protein  45.6 
 
 
582 aa  451  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.623642 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1498  hypothetical protein  45.6 
 
 
582 aa  451  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4029  ATPase-like protein  46.68 
 
 
580 aa  440  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.878422 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3775  hypothetical protein  45.16 
 
 
613 aa  422  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464348  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0907  hypothetical protein  38.84 
 
 
571 aa  383  1e-105  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6133  ATPase-like protein  40.45 
 
 
630 aa  346  7e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.869987  normal  0.698643 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1514  ATPase-like protein  32.9 
 
 
611 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1563  ATPase-like protein  32.9 
 
 
611 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0452  hypothetical protein  35.03 
 
 
682 aa  96.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4031  hypothetical protein  27.35 
 
 
802 aa  52  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  26.42 
 
 
531 aa  50.4  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2632  ATPase  32.46 
 
 
319 aa  49.7  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.57356 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3423  AAA ATPase  31.25 
 
 
1104 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.598451  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1184  ATPase  26.85 
 
 
1071 aa  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3326  hypothetical protein  25.64 
 
 
800 aa  47.4  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000795061  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  28.35 
 
 
559 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3967  AAA ATPase  26.61 
 
 
1046 aa  46.2  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0239  hypothetical protein  24.53 
 
 
734 aa  45.8  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.72436  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  23.27 
 
 
496 aa  45.4  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  24.11 
 
 
557 aa  45.1  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5089  AAA ATPase  29.27 
 
 
1100 aa  43.9  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0231758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>