54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5089 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5089  AAA ATPase  100 
 
 		 1100 aa  2147    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0231758  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1484  hypothetical protein  42.56 
 
 		 1144 aa  722    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0469742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1183  AAA ATPase  42.97 
 
 		 1043 aa  753    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1184  ATPase  34.69 
 
 		 1071 aa  513  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3967  AAA ATPase  33.9 
 
 		 1046 aa  493  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2709  ATPase-like  31.36 
 
 		 1106 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5149  AAA ATPase  53.54 
 
 		 1031 aa  413  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120671  normal  0.52051 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2631  hypothetical protein  40.83 
 
 		 886 aa  386  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.703653 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5114  AAA ATPase  47.32 
 
 		 1076 aa  347  7e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078899 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2632  ATPase  55.81 
 
 		 319 aa  334  4e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.57356 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3423  AAA ATPase  36.33 
 
 		 1104 aa  286  2.0000000000000002e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.598451  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2606  hypothetical protein  27.86 
 
 		 1050 aa  110  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320925  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1696  hypothetical protein  25.27 
 
 		 764 aa  98.2  8e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000294033  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3326  hypothetical protein  24.62 
 
 		 800 aa  97.1  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000795061  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0983  hypothetical protein  24.62 
 
 		 762 aa  95.5  5e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.137038  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4031  hypothetical protein  28.3 
 
 		 802 aa  93.2  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1236  hypothetical protein  27.9 
 
 		 859 aa  89.4  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1311  hypothetical protein  26.26 
 
 		 847 aa  89.4  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1346  hypothetical protein  25.19 
 
 		 859 aa  84  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1085  hypothetical protein  25.06 
 
 		 847 aa  83.6  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  27.61 
 
 		 508 aa  82  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1505  hypothetical protein  24.86 
 
 		 753 aa  79  0.0000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2242  hypothetical protein  26.1 
 
 		 658 aa  79  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3193  hypothetical protein  25.58 
 
 		 653 aa  75.5  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0239  hypothetical protein  22.63 
 
 		 734 aa  71.6  0.00000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.72436  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  25.39 
 
 		 557 aa  66.2  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  30 
 
 		 496 aa  61.2  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1018  ATPase  25.56 
 
 		 463 aa  59.7  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0915  hypothetical protein  25.56 
 
 		 463 aa  58.9  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3713  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  26.74 
 
 		 580 aa  58.5  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1070  hypothetical protein  25.07 
 
 		 452 aa  57  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  25.56 
 
 		 524 aa  56.2  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  24.55 
 
 		 523 aa  55.5  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3912  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  26.24 
 
 		 579 aa  55.5  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  22.19 
 
 		 611 aa  55.5  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  28.17 
 
 		 523 aa  54.3  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  25.78 
 
 		 524 aa  53.9  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  26.57 
 
 		 560 aa  53.5  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  27.34 
 
 		 524 aa  52  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  28.21 
 
 		 537 aa  49.7  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  24.18 
 
 		 559 aa  49.7  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0816  hypothetical protein  24.14 
 
 		 452 aa  49.7  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.723695  normal  0.916322 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  24.79 
 
 		 709 aa  47.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25990  predicted ATPase  27.03 
 
 		 540 aa  47.8  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1344  hypothetical protein  32.41 
 
 		 451 aa  47.4  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2180  AAA ATPase  22.51 
 
 		 777 aa  47  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.520189  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0645  ATPase-like protein  27.1 
 
 		 989 aa  46.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  26.85 
 
 		 599 aa  46.2  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  26.18 
 
 		 559 aa  46.2  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1250  ATPase  25.77 
 
 		 1040 aa  45.8  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.515643 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  26.96 
 
 		 623 aa  45.8  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  33.03 
 
 		 674 aa  45.8  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  32.31 
 
 		 569 aa  45.1  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  26.62 
 
 		 557 aa  44.7  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>