41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0983 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1505  hypothetical protein  58.79 
 
 
753 aa  894    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0983  hypothetical protein  100 
 
 
762 aa  1539    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.137038  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0239  hypothetical protein  49.07 
 
 
734 aa  673    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.72436  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1696  hypothetical protein  76.69 
 
 
764 aa  1204    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000294033  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4031  hypothetical protein  41.42 
 
 
802 aa  612  1e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3326  hypothetical protein  39.97 
 
 
800 aa  593  1e-168  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000795061  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1085  hypothetical protein  36.02 
 
 
847 aa  565  1e-160  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1311  hypothetical protein  37.97 
 
 
847 aa  549  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1346  hypothetical protein  39.55 
 
 
859 aa  535  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1236  hypothetical protein  35.43 
 
 
859 aa  519  1e-146  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3193  hypothetical protein  31.29 
 
 
653 aa  219  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2242  hypothetical protein  30.85 
 
 
658 aa  211  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2606  hypothetical protein  27.39 
 
 
1050 aa  115  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320925  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1184  ATPase  27.55 
 
 
1071 aa  99.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5149  AAA ATPase  24.89 
 
 
1031 aa  99  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120671  normal  0.52051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5089  AAA ATPase  24.62 
 
 
1100 aa  96.3  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0231758  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1183  AAA ATPase  24.01 
 
 
1043 aa  87.8  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3967  AAA ATPase  22.13 
 
 
1046 aa  85.1  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3423  AAA ATPase  25.44 
 
 
1104 aa  85.1  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.598451  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5114  AAA ATPase  23.13 
 
 
1076 aa  80.9  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078899 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1484  hypothetical protein  24.65 
 
 
1144 aa  77  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0469742  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2632  ATPase  27.17 
 
 
319 aa  66.6  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.57356 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2709  ATPase-like  23.35 
 
 
1106 aa  65.9  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0494  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  27.51 
 
 
505 aa  54.3  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  29.03 
 
 
679 aa  53.5  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0907  hypothetical protein  25.93 
 
 
571 aa  51.2  0.00008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2815  type IV conjugative transfer system protein TraD  48.21 
 
 
615 aa  47.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  26.53 
 
 
709 aa  47  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06795  hypothetical protein  26.88 
 
 
516 aa  45.8  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.207511  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  24.56 
 
 
497 aa  45.8  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1849  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  26.2 
 
 
511 aa  45.4  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.892343  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  24.56 
 
 
497 aa  45.4  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0321  hypothetical protein  36.67 
 
 
499 aa  45.4  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  24.78 
 
 
497 aa  45.4  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  27.78 
 
 
523 aa  45.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  27.72 
 
 
593 aa  44.7  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  23.89 
 
 
493 aa  44.7  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  26.85 
 
 
523 aa  44.3  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0122  putative type IV secretion system protein IcmO/DotL  34.33 
 
 
934 aa  44.3  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1344  hypothetical protein  27.87 
 
 
451 aa  44.3  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  26.76 
 
 
564 aa  44.3  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>