98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2242 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2242  hypothetical protein  100 
 
 
658 aa  1352    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3193  hypothetical protein  88.89 
 
 
653 aa  1196    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4031  hypothetical protein  34.14 
 
 
802 aa  227  4e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3326  hypothetical protein  32.4 
 
 
800 aa  223  9e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000795061  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1505  hypothetical protein  31.54 
 
 
753 aa  221  3.9999999999999997e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1236  hypothetical protein  32.97 
 
 
859 aa  218  2e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1311  hypothetical protein  31.88 
 
 
847 aa  218  4e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1085  hypothetical protein  35.28 
 
 
847 aa  216  7e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1696  hypothetical protein  32.84 
 
 
764 aa  214  4.9999999999999996e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000294033  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1346  hypothetical protein  35.53 
 
 
859 aa  213  7e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0983  hypothetical protein  30.85 
 
 
762 aa  211  3e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.137038  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0239  hypothetical protein  29.57 
 
 
734 aa  187  4e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.72436  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5149  AAA ATPase  27.29 
 
 
1031 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120671  normal  0.52051 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1184  ATPase  29.69 
 
 
1071 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1183  AAA ATPase  27.11 
 
 
1043 aa  104  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1484  hypothetical protein  27.23 
 
 
1144 aa  104  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0469742  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2606  hypothetical protein  25.35 
 
 
1050 aa  103  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320925  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5114  AAA ATPase  27.67 
 
 
1076 aa  101  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3967  AAA ATPase  27.83 
 
 
1046 aa  95.1  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3423  AAA ATPase  26.78 
 
 
1104 aa  86.3  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.598451  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2709  ATPase-like  26.3 
 
 
1106 aa  86.7  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5089  AAA ATPase  26.1 
 
 
1100 aa  79.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0231758  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2632  ATPase  27.03 
 
 
319 aa  65.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.57356 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  22.72 
 
 
577 aa  56.2  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  25 
 
 
623 aa  54.3  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  29.1 
 
 
593 aa  53.9  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  25.83 
 
 
599 aa  53.9  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2631  hypothetical protein  55.1 
 
 
886 aa  52.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.703653 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  28.95 
 
 
570 aa  51.6  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  24.35 
 
 
679 aa  50.8  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  29.55 
 
 
709 aa  49.3  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  29.37 
 
 
628 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  32.14 
 
 
564 aa  49.3  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  33.78 
 
 
693 aa  49.3  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0321  hypothetical protein  45.45 
 
 
499 aa  49.3  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0340  protein of unknown function DUF87  28.33 
 
 
379 aa  48.9  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0311557 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  28.57 
 
 
617 aa  49.3  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1223  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  37.78 
 
 
514 aa  48.9  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00822087  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1283  hypothetical protein  39.44 
 
 
517 aa  48.9  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608046  normal  0.929249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2238  protein of unknown function DUF87  29.37 
 
 
583 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0343  hypothetical protein  45.45 
 
 
499 aa  48.5  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  28.57 
 
 
557 aa  48.5  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  28.57 
 
 
584 aa  48.5  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  30.59 
 
 
493 aa  48.5  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  34.29 
 
 
674 aa  48.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0444  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  35.62 
 
 
524 aa  48.1  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0693836  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  31.25 
 
 
567 aa  48.1  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2094  hypothetical protein  28.57 
 
 
582 aa  47.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2792  protein of unknown function DUF87  34.29 
 
 
679 aa  47.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.744858  normal  0.636348 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  24.68 
 
 
605 aa  47.8  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  29.41 
 
 
497 aa  47.4  0.0009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  30.91 
 
 
591 aa  46.6  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  25.32 
 
 
608 aa  46.6  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  24 
 
 
587 aa  47  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  28.85 
 
 
559 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06795  hypothetical protein  38.46 
 
 
516 aa  47  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.207511  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  25.31 
 
 
546 aa  47.4  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  29.41 
 
 
497 aa  47  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  28.45 
 
 
583 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3542  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  36.11 
 
 
543 aa  47.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416289  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  24.68 
 
 
611 aa  46.2  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1486  hypothetical protein  34.85 
 
 
560 aa  46.6  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  34.21 
 
 
575 aa  46.2  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25990  predicted ATPase  39.39 
 
 
540 aa  46.2  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1849  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  44.26 
 
 
511 aa  45.8  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.892343  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2056  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  42.31 
 
 
552 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  31.58 
 
 
496 aa  46.6  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  36.92 
 
 
662 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  34.38 
 
 
550 aa  45.8  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2217  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  38.1 
 
 
560 aa  45.8  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3713  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  39.68 
 
 
580 aa  45.4  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2544  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  38.6 
 
 
526 aa  45.8  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  28.24 
 
 
497 aa  45.4  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1783  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  35.38 
 
 
555 aa  45.8  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000734669  normal  0.0773892 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3912  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  39.68 
 
 
579 aa  45.4  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3526  hypothetical protein  28.23 
 
 
583 aa  45.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543626  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2768  hypothetical protein  38.6 
 
 
508 aa  45.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1340  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  35.21 
 
 
515 aa  45.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  31.65 
 
 
531 aa  45.1  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  29.2 
 
 
544 aa  44.7  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22220  predicted ATPase  37.93 
 
 
544 aa  44.7  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.198348 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3899  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  46.67 
 
 
504 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4022  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  46.67 
 
 
504 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3826  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  40 
 
 
498 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  26.28 
 
 
628 aa  44.7  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  32.5 
 
 
427 aa  44.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4068  hypothetical protein  38.96 
 
 
541 aa  44.7  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0435  hypothetical protein  46.67 
 
 
504 aa  44.7  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2150  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  45.83 
 
 
520 aa  44.3  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.56752  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4924  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  36.25 
 
 
515 aa  44.3  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.311979 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  20.68 
 
 
603 aa  43.9  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  27.2 
 
 
612 aa  44.3  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  31.25 
 
 
570 aa  43.9  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  28.33 
 
 
714 aa  43.9  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0767  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  45.45 
 
 
482 aa  43.9  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3379  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  47.73 
 
 
496 aa  43.9  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0089  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  40.54 
 
 
491 aa  43.9  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2387  protein of unknown function DUF87  31.87 
 
 
708 aa  43.9  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.10181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>