49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1505 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1505  hypothetical protein  100 
 
 
753 aa  1524    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0239  hypothetical protein  50.87 
 
 
734 aa  704    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.72436  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0983  hypothetical protein  58.92 
 
 
762 aa  904    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.137038  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1696  hypothetical protein  58.9 
 
 
764 aa  905    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000294033  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3326  hypothetical protein  40.72 
 
 
800 aa  597  1e-169  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000795061  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4031  hypothetical protein  42.29 
 
 
802 aa  592  1e-168  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1311  hypothetical protein  36.29 
 
 
847 aa  509  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1085  hypothetical protein  34.33 
 
 
847 aa  500  1e-140  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1346  hypothetical protein  37.53 
 
 
859 aa  487  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1236  hypothetical protein  47.3 
 
 
859 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3193  hypothetical protein  31.77 
 
 
653 aa  230  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2242  hypothetical protein  31.54 
 
 
658 aa  221  3.9999999999999997e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1184  ATPase  27.27 
 
 
1071 aa  105  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2606  hypothetical protein  26.39 
 
 
1050 aa  103  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320925  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1484  hypothetical protein  25.93 
 
 
1144 aa  93.6  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0469742  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3967  AAA ATPase  24.18 
 
 
1046 aa  92.4  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5149  AAA ATPase  23.45 
 
 
1031 aa  90.9  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120671  normal  0.52051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5089  AAA ATPase  24.86 
 
 
1100 aa  80.5  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0231758  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5114  AAA ATPase  23.78 
 
 
1076 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078899 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1183  AAA ATPase  23.5 
 
 
1043 aa  74.3  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3423  AAA ATPase  25.31 
 
 
1104 aa  74.3  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.598451  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2632  ATPase  27.91 
 
 
319 aa  70.1  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.57356 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0494  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  27.98 
 
 
505 aa  53.9  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2709  ATPase-like  23.06 
 
 
1106 aa  53.5  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  20.49 
 
 
524 aa  53.1  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1344  hypothetical protein  30.58 
 
 
451 aa  49.7  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  27.84 
 
 
679 aa  49.3  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  23.19 
 
 
564 aa  48.5  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0907  hypothetical protein  24.53 
 
 
571 aa  47.4  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06795  hypothetical protein  23.73 
 
 
516 aa  47  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.207511  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0512  hypothetical protein  39.39 
 
 
783 aa  47  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0488  hypothetical protein  39.39 
 
 
783 aa  47  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  25.93 
 
 
623 aa  47.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4068  hypothetical protein  23.88 
 
 
541 aa  47  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0122  putative type IV secretion system protein IcmO/DotL  38.81 
 
 
934 aa  46.6  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0321  hypothetical protein  42.86 
 
 
499 aa  46.2  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  27.55 
 
 
709 aa  46.6  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  29.63 
 
 
557 aa  45.4  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2815  type IV conjugative transfer system protein TraD  48.33 
 
 
615 aa  45.8  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2074  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  26.72 
 
 
526 aa  45.4  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.504817  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1849  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  25.88 
 
 
511 aa  45.1  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.892343  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0343  hypothetical protein  40.82 
 
 
499 aa  44.7  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1636  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  31.15 
 
 
526 aa  44.7  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.985803  normal  0.278037 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  23.89 
 
 
493 aa  44.7  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0635  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  25.13 
 
 
513 aa  44.3  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2022  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  30.91 
 
 
557 aa  44.3  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.27586  normal  0.0150658 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  21.47 
 
 
605 aa  44.3  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1089  hypothetical protein  39.66 
 
 
930 aa  44.3  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0247852  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1283  hypothetical protein  42 
 
 
517 aa  43.9  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608046  normal  0.929249 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>