33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1085 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3326  hypothetical protein  41.08 
 
 
800 aa  653    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000795061  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1236  hypothetical protein  60.47 
 
 
859 aa  1048    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1346  hypothetical protein  62.57 
 
 
859 aa  1077    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1085  hypothetical protein  100 
 
 
847 aa  1741    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1311  hypothetical protein  58.53 
 
 
847 aa  1014    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4031  hypothetical protein  43.36 
 
 
802 aa  673    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0983  hypothetical protein  36.02 
 
 
762 aa  569  1e-161  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.137038  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1696  hypothetical protein  35.86 
 
 
764 aa  536  1e-151  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000294033  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1505  hypothetical protein  34.25 
 
 
753 aa  499  1e-139  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0239  hypothetical protein  42.86 
 
 
734 aa  389  1e-107  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.72436  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3193  hypothetical protein  34.54 
 
 
653 aa  219  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2242  hypothetical protein  35.28 
 
 
658 aa  216  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2606  hypothetical protein  28.24 
 
 
1050 aa  107  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320925  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1184  ATPase  27.84 
 
 
1071 aa  94  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3423  AAA ATPase  24.82 
 
 
1104 aa  84.7  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.598451  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5089  AAA ATPase  25 
 
 
1100 aa  84.3  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0231758  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3967  AAA ATPase  25.47 
 
 
1046 aa  81.3  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1183  AAA ATPase  25.56 
 
 
1043 aa  80.5  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1484  hypothetical protein  26.79 
 
 
1144 aa  79.3  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0469742  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5114  AAA ATPase  25.39 
 
 
1076 aa  77.8  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078899 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5149  AAA ATPase  25.69 
 
 
1031 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120671  normal  0.52051 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2709  ATPase-like  24.3 
 
 
1106 aa  67.8  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2632  ATPase  26.52 
 
 
319 aa  65.5  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.57356 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  30.77 
 
 
599 aa  49.3  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4680  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  24.42 
 
 
529 aa  48.9  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0218814  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0321  hypothetical protein  33.78 
 
 
499 aa  48.1  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0343  hypothetical protein  32.43 
 
 
499 aa  47  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  23.35 
 
 
523 aa  46.2  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  25.36 
 
 
623 aa  45.8  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0122  putative type IV secretion system protein IcmO/DotL  41.18 
 
 
934 aa  44.7  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  25.78 
 
 
679 aa  44.7  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  29.76 
 
 
557 aa  44.7  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  22.33 
 
 
570 aa  44.3  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>