64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1183 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1183  AAA ATPase  100 
 
 
1043 aa  2092    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5149  AAA ATPase  83.99 
 
 
1031 aa  1728    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120671  normal  0.52051 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1484  hypothetical protein  44.29 
 
 
1144 aa  832    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0469742  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3423  AAA ATPase  45.94 
 
 
1104 aa  846    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.598451  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1184  ATPase  37.7 
 
 
1071 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3967  AAA ATPase  37.59 
 
 
1046 aa  590  1e-167  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2709  ATPase-like  34.03 
 
 
1106 aa  570  1e-161  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5114  AAA ATPase  34.13 
 
 
1076 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078899 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2631  hypothetical protein  45.42 
 
 
886 aa  485  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.703653 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5089  AAA ATPase  56.08 
 
 
1100 aa  439  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0231758  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2632  ATPase  63.23 
 
 
319 aa  383  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.57356 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2242  hypothetical protein  27.11 
 
 
658 aa  104  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2606  hypothetical protein  24.81 
 
 
1050 aa  97.1  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320925  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3193  hypothetical protein  26.22 
 
 
653 aa  96.3  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  25.73 
 
 
496 aa  92.4  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1696  hypothetical protein  24.72 
 
 
764 aa  90.5  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000294033  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3326  hypothetical protein  26.2 
 
 
800 aa  89  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000795061  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0983  hypothetical protein  24.01 
 
 
762 aa  87.8  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.137038  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1346  hypothetical protein  28 
 
 
859 aa  84.7  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1085  hypothetical protein  25.56 
 
 
847 aa  80.5  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1236  hypothetical protein  25.25 
 
 
859 aa  77.8  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1311  hypothetical protein  25.12 
 
 
847 aa  77  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4031  hypothetical protein  26.14 
 
 
802 aa  76.6  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1505  hypothetical protein  23.5 
 
 
753 aa  73.9  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  23.74 
 
 
508 aa  72.4  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  26.01 
 
 
524 aa  71.6  0.00000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  25.41 
 
 
523 aa  71.2  0.00000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  24.53 
 
 
531 aa  70.5  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  23.99 
 
 
523 aa  69.7  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0239  hypothetical protein  22.03 
 
 
734 aa  68.6  0.0000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.72436  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  24.43 
 
 
608 aa  66.2  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  30.83 
 
 
557 aa  64.7  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  23.89 
 
 
628 aa  63.5  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  25.92 
 
 
524 aa  63.9  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  23.62 
 
 
557 aa  62  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  22.57 
 
 
524 aa  61.6  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  23.73 
 
 
611 aa  61.6  0.00000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  24.65 
 
 
616 aa  58.5  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  23.41 
 
 
605 aa  58.2  0.0000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0467  ATPase-like protein  23.5 
 
 
1034 aa  55.1  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  22.74 
 
 
564 aa  53.5  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3642  ATPase-like  27.45 
 
 
558 aa  53.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.361749  normal  0.410506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0911  ATPase-like protein  23.56 
 
 
989 aa  51.6  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  27.89 
 
 
709 aa  50.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  22.08 
 
 
559 aa  51.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1259  protein of unknown function DUF87  28.57 
 
 
540 aa  48.9  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  22.75 
 
 
546 aa  48.9  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  22.55 
 
 
563 aa  48.5  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  29.01 
 
 
569 aa  48.1  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  30.84 
 
 
360 aa  47.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6133  ATPase-like protein  32.71 
 
 
630 aa  47.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.869987  normal  0.698643 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  25.52 
 
 
537 aa  47  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1251  hypothetical protein  22.88 
 
 
657 aa  47.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  28.57 
 
 
559 aa  46.6  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0047  hypothetical protein  21.47 
 
 
486 aa  46.6  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  22.73 
 
 
579 aa  46.2  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0679  cell division FtsK/SpoIIIE  38.2 
 
 
1335 aa  45.8  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0517102 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0321  hypothetical protein  23.08 
 
 
499 aa  45.8  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1498  hypothetical protein  28.57 
 
 
582 aa  45.4  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0816  hypothetical protein  30.61 
 
 
452 aa  45.4  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.723695  normal  0.916322 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0753  protein of unknown function DUF87  30.65 
 
 
506 aa  45.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0799035  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  30.97 
 
 
570 aa  45.1  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1870  hypothetical protein  23.68 
 
 
691 aa  45.1  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1344  hypothetical protein  30.61 
 
 
451 aa  44.7  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>