52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3326 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_4031  hypothetical protein  47.32 
 
 
802 aa  785    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1085  hypothetical protein  41.08 
 
 
847 aa  642    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3326  hypothetical protein  100 
 
 
800 aa  1630    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000795061  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1311  hypothetical protein  40.75 
 
 
847 aa  630  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1346  hypothetical protein  39.5 
 
 
859 aa  609  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1236  hypothetical protein  38.91 
 
 
859 aa  601  1e-170  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0983  hypothetical protein  39.97 
 
 
762 aa  593  1e-168  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.137038  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1505  hypothetical protein  40.59 
 
 
753 aa  585  1e-166  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1696  hypothetical protein  39.67 
 
 
764 aa  579  1e-164  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000294033  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0239  hypothetical protein  37.36 
 
 
734 aa  479  1e-134  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.72436  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2242  hypothetical protein  32.4 
 
 
658 aa  223  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3193  hypothetical protein  31.1 
 
 
653 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3967  AAA ATPase  27.6 
 
 
1046 aa  107  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2606  hypothetical protein  26.46 
 
 
1050 aa  106  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320925  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1184  ATPase  26.48 
 
 
1071 aa  102  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3423  AAA ATPase  26.58 
 
 
1104 aa  99  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.598451  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5089  AAA ATPase  25.2 
 
 
1100 aa  97.4  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0231758  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5149  AAA ATPase  26.41 
 
 
1031 aa  96.3  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120671  normal  0.52051 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5114  AAA ATPase  25 
 
 
1076 aa  92  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078899 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1183  AAA ATPase  25.97 
 
 
1043 aa  88.6  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2709  ATPase-like  24.5 
 
 
1106 aa  83.2  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2632  ATPase  28.06 
 
 
319 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.57356 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1484  hypothetical protein  24.86 
 
 
1144 aa  80.1  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0469742  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1344  hypothetical protein  30.99 
 
 
451 aa  57.4  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06795  hypothetical protein  23.85 
 
 
516 aa  55.1  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.207511  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1340  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  22.41 
 
 
515 aa  53.9  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0047  hypothetical protein  32.23 
 
 
486 aa  51.6  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0941  AAA ATPase  31.09 
 
 
456 aa  51.2  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0685894 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0816  hypothetical protein  31.09 
 
 
452 aa  50.4  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.723695  normal  0.916322 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  26.87 
 
 
623 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  29.17 
 
 
679 aa  50.8  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  25.44 
 
 
544 aa  50.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1070  hypothetical protein  31.09 
 
 
452 aa  50.1  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0535  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  23.23 
 
 
501 aa  49.7  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.162196  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0738  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  48.89 
 
 
557 aa  48.9  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0444  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  23.53 
 
 
524 aa  49.3  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0693836  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  27.27 
 
 
523 aa  47.8  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1724  ATPase  25.64 
 
 
585 aa  47.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1204  hypothetical protein  25 
 
 
527 aa  46.6  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1273  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  28.16 
 
 
520 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.50823  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  29 
 
 
569 aa  47  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  33.33 
 
 
526 aa  46.2  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  24.71 
 
 
564 aa  45.4  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4680  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  48.89 
 
 
529 aa  45.4  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0218814  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  34.92 
 
 
557 aa  45.1  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0907  hypothetical protein  23.64 
 
 
571 aa  45.1  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0936  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  33.33 
 
 
521 aa  45.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222531  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25990  predicted ATPase  23.25 
 
 
540 aa  45.1  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1223  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  35.8 
 
 
514 aa  44.7  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00822087  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1716  ATPase-like protein  37.5 
 
 
1065 aa  44.3  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00601254 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  28.7 
 
 
709 aa  44.3  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1825  ATPase-like protein  37.5 
 
 
1065 aa  44.3  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.071271 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>