87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1070 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1344  hypothetical protein  82.48 
 
 		 451 aa  778    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0816  hypothetical protein  78.98 
 
 		 452 aa  760    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.723695  normal  0.916322 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1070  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  909    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0941  AAA ATPase  78.4 
 
 		 456 aa  764    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0685894 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0047  hypothetical protein  52 
 
 		 486 aa  494  9.999999999999999e-139  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  23.91 
 
 		 496 aa  80.5  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  33.11 
 
 		 524 aa  79  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  26.58 
 
 		 557 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  27.49 
 
 		 508 aa  75.9  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  24.14 
 
 		 497 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  24.14 
 
 		 497 aa  73.6  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  22.28 
 
 		 497 aa  69.7  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0018  protein of unknown function DUF87  33.54 
 
 		 537 aa  70.1  0.00000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.989354  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  23.4 
 
 		 493 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  22.93 
 
 		 611 aa  68.6  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  24.51 
 
 		 492 aa  68.2  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1184  ATPase  28.14 
 
 		 1071 aa  67.8  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  23.25 
 
 		 496 aa  64.3  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  24.73 
 
 		 559 aa  62.4  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  30.07 
 
 		 523 aa  60.1  0.00000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2164  hypothetical protein  30.43 
 
 		 582 aa  58.2  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000710411 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  25 
 
 		 531 aa  57  0.0000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5089  AAA ATPase  25.07 
 
 		 1100 aa  56.6  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0231758  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  22.16 
 
 		 560 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  22.22 
 
 		 581 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  32.35 
 
 		 523 aa  53.1  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  36.08 
 
 		 674 aa  53.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3279  hypothetical protein  25.61 
 
 		 590 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  27.94 
 
 		 563 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  26.95 
 
 		 524 aa  51.2  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  31.86 
 
 		 623 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  23.17 
 
 		 559 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  22.43 
 
 		 500 aa  51.2  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  26.76 
 
 		 569 aa  50.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5114  AAA ATPase  26.8 
 
 		 1076 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078899 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  24.3 
 
 		 564 aa  50.1  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3326  hypothetical protein  31.09 
 
 		 800 aa  50.1  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000795061  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  29.7 
 
 		 524 aa  49.7  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  24 
 
 		 510 aa  49.3  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  26.51 
 
 		 579 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0306  hypothetical protein  26.33 
 
 		 530 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2263  ATPase-like protein  23.27 
 
 		 533 aa  48.9  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.539345 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  33.06 
 
 		 607 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  27.27 
 
 		 608 aa  48.5  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  28.24 
 
 		 557 aa  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1450  protein of unknown function DUF87  26.67 
 
 		 581 aa  48.5  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0452751  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2954  hypothetical protein  23.78 
 
 		 589 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000103337 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1389  hypothetical protein  31.58 
 
 		 606 aa  47.4  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.103576 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  24.48 
 
 		 605 aa  47.4  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  26.67 
 
 		 593 aa  47  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2632  ATPase  26.28 
 
 		 319 aa  47  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.57356 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2528  AAA ATPase  18.91 
 
 		 621 aa  47  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  22.61 
 
 		 612 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  31.21 
 
 		 561 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  28.75 
 
 		 587 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  27.22 
 
 		 550 aa  46.2  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2315  hypothetical protein  21.82 
 
 		 1743 aa  45.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  31.25 
 
 		 526 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  34.62 
 
 		 427 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1337  hypothetical protein  37.5 
 
 		 445 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3942  hypothetical protein  25.47 
 
 		 721 aa  45.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.222103  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1849  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  36.49 
 
 		 511 aa  45.8  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.892343  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0195  TraG family protein  35.82 
 
 		 457 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5149  AAA ATPase  28.68 
 
 		 1031 aa  45.8  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120671  normal  0.52051 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2019  protein of unknown function DUF87  27.66 
 
 		 700 aa  44.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  33.78 
 
 		 662 aa  45.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  30.77 
 
 		 709 aa  45.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1374  protein of unknown function DUF87  23.48 
 
 		 538 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.627609 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  24.84 
 
 		 659 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  24.06 
 
 		 537 aa  44.3  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  23.36 
 
 		 520 aa  44.3  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  27.37 
 
 		 575 aa  44.3  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3423  AAA ATPase  26.62 
 
 		 1104 aa  44.3  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.598451  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2620  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein B  41.27 
 
 		 183 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0386049  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2366  protein of unknown function DUF87  31.4 
 
 		 592 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.250268  normal  0.14702 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0837  DNA transfer in the process of conjugation and F pilus assembly protein  32.19 
 
 		 455 aa  44.3  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00362529  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0250  TraG family protein  34.33 
 
 		 457 aa  44.3  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  33.33 
 
 		 664 aa  44.3  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2524  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein B  41.27 
 
 		 186 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.250541  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  27.94 
 
 		 616 aa  43.5  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  28.07 
 
 		 591 aa  43.5  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1131  AAA ATPase  20.58 
 
 		 600 aa  43.5  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1484  hypothetical protein  30.91 
 
 		 1144 aa  43.1  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0469742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0349  protein of unknown function DUF87  20.5 
 
 		 540 aa  43.5  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  29.09 
 
 		 600 aa  43.1  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2122  TraG family protein  41.07 
 
 		 464 aa  43.5  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1553  conserved hypothetical protein  36.36 
 
 		 998 aa  43.1  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>