62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1484 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3423  AAA ATPase  39.33 
 
 		 1104 aa  655    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.598451  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1183  AAA ATPase  44.29 
 
 		 1043 aa  839    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1484  hypothetical protein  100 
 
 		 1144 aa  2280    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0469742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5089  AAA ATPase  41.72 
 
 		 1100 aa  731    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0231758  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5149  AAA ATPase  63.05 
 
 		 1031 aa  503  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120671  normal  0.52051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3967  AAA ATPase  45.33 
 
 		 1046 aa  435  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2631  hypothetical protein  38.75 
 
 		 886 aa  419  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.703653 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1184  ATPase  43.2 
 
 		 1071 aa  412  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2632  ATPase  64.31 
 
 		 319 aa  384  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.57356 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5114  AAA ATPase  40.69 
 
 		 1076 aa  383  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078899 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2709  ATPase-like  34.35 
 
 		 1106 aa  332  3e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2242  hypothetical protein  27.23 
 
 		 658 aa  104  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2606  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1050 aa  102  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320925  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4031  hypothetical protein  28.2 
 
 		 802 aa  95.1  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1505  hypothetical protein  25.93 
 
 		 753 aa  92.8  3e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3193  hypothetical protein  27.03 
 
 		 653 aa  92  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1696  hypothetical protein  27.05 
 
 		 764 aa  86.3  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000294033  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1346  hypothetical protein  28.05 
 
 		 859 aa  83.2  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1236  hypothetical protein  27.74 
 
 		 859 aa  80.9  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3326  hypothetical protein  24.6 
 
 		 800 aa  79.7  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000795061  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1085  hypothetical protein  26.79 
 
 		 847 aa  78.6  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0983  hypothetical protein  24.65 
 
 		 762 aa  76.6  0.000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.137038  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  26.57 
 
 		 524 aa  75.5  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  25.12 
 
 		 524 aa  75.1  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1311  hypothetical protein  26.93 
 
 		 847 aa  72.8  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  23.18 
 
 		 496 aa  70.9  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0239  hypothetical protein  24.1 
 
 		 734 aa  69.7  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.72436  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  29.35 
 
 		 523 aa  69.7  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  26.32 
 
 		 360 aa  69.3  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  26.09 
 
 		 523 aa  68.9  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  23.89 
 
 		 611 aa  65.9  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  24.2 
 
 		 508 aa  65.1  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  23.65 
 
 		 608 aa  65.1  0.000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  23.22 
 
 		 605 aa  64.7  0.000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  25.14 
 
 		 524 aa  64.3  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  22.99 
 
 		 628 aa  60.1  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  22.84 
 
 		 557 aa  60.5  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  23.72 
 
 		 531 aa  57.8  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0047  hypothetical protein  21.38 
 
 		 486 aa  57  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0018  protein of unknown function DUF87  22.51 
 
 		 537 aa  52.8  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.989354  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  21.5 
 
 		 492 aa  51.6  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3713  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  24.85 
 
 		 580 aa  50.8  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3912  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  25.07 
 
 		 579 aa  50.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  23.63 
 
 		 559 aa  49.7  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0467  ATPase-like protein  23.78 
 
 		 1034 aa  49.3  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0753  protein of unknown function DUF87  32.14 
 
 		 506 aa  49.3  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0799035  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  19.45 
 
 		 500 aa  48.9  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0911  ATPase-like protein  24.25 
 
 		 989 aa  48.5  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5417  hypothetical protein  27.39 
 
 		 1698 aa  47.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.265481  normal  0.989313 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0816  hypothetical protein  28.95 
 
 		 452 aa  47.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.723695  normal  0.916322 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6133  ATPase-like protein  30.84 
 
 		 630 aa  47.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.869987  normal  0.698643 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  23.72 
 
 		 563 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0321  hypothetical protein  24.82 
 
 		 499 aa  47.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0343  hypothetical protein  25.06 
 
 		 499 aa  47.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  24.87 
 
 		 561 aa  46.6  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1553  conserved hypothetical protein  22.98 
 
 		 998 aa  46.6  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  27.08 
 
 		 616 aa  46.2  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0941  AAA ATPase  27.4 
 
 		 456 aa  46.2  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0685894 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  24.1 
 
 		 557 aa  45.4  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1920  hypothetical protein  34.09 
 
 		 526 aa  45.4  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  28.75 
 
 		 564 aa  45.4  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  21.74 
 
 		 427 aa  45.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>