36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6133 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6133  ATPase-like protein  100 
 
 
630 aa  1240    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.869987  normal  0.698643 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1913  ATPase-like protein  40.91 
 
 
578 aa  368  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0219994  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1553  hypothetical protein  40.79 
 
 
582 aa  364  2e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.623642 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4029  ATPase-like protein  40.56 
 
 
580 aa  363  5.0000000000000005e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.878422 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1498  hypothetical protein  40.62 
 
 
582 aa  361  2e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2386  ATPase-like protein  40.1 
 
 
589 aa  354  2.9999999999999997e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000327253  hitchhiker  0.000621551 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1724  ATPase  40.45 
 
 
585 aa  346  8e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3775  hypothetical protein  39.32 
 
 
613 aa  338  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464348  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1417  hypothetical protein  38.47 
 
 
606 aa  330  6e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0731587  normal  0.0956406 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1662  hypothetical protein  39.17 
 
 
577 aa  328  2.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0907  hypothetical protein  33.39 
 
 
571 aa  314  3.9999999999999997e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1514  ATPase-like protein  30 
 
 
611 aa  221  3e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1563  ATPase-like protein  30 
 
 
611 aa  221  3e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0452  hypothetical protein  39.87 
 
 
682 aa  83.6  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  31.13 
 
 
531 aa  60.5  0.00000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  27.21 
 
 
508 aa  57.4  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  28.46 
 
 
557 aa  57  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  28.22 
 
 
628 aa  53.9  0.000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1184  ATPase  28.44 
 
 
1071 aa  53.9  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0753  protein of unknown function DUF87  31.79 
 
 
506 aa  48.9  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0799035  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  28.71 
 
 
496 aa  48.5  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3423  AAA ATPase  31.78 
 
 
1104 aa  48.1  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.598451  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3967  AAA ATPase  28.85 
 
 
1046 aa  48.1  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1183  AAA ATPase  32.71 
 
 
1043 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1484  hypothetical protein  30.84 
 
 
1144 aa  47  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0469742  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  23.83 
 
 
611 aa  47  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  28.47 
 
 
523 aa  46.6  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  24.71 
 
 
605 aa  46.2  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5149  AAA ATPase  32.71 
 
 
1031 aa  45.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120671  normal  0.52051 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2632  ATPase  31.78 
 
 
319 aa  45.4  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.57356 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  27.45 
 
 
523 aa  45.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3642  ATPase-like  28.07 
 
 
558 aa  44.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.361749  normal  0.410506 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4031  hypothetical protein  24.76 
 
 
802 aa  43.9  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5417  hypothetical protein  32.77 
 
 
1698 aa  43.9  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.265481  normal  0.989313 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1696  hypothetical protein  26.85 
 
 
764 aa  43.9  0.01  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000294033  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3193  hypothetical protein  29.6 
 
 
653 aa  43.5  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>