28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4029 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4029  ATPase-like protein  100 
 
 
580 aa  1167    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.878422 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1913  ATPase-like protein  63.17 
 
 
578 aa  719    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0219994  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2386  ATPase-like protein  63.96 
 
 
589 aa  686    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000327253  hitchhiker  0.000621551 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1553  hypothetical protein  72.6 
 
 
582 aa  844    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.623642 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1498  hypothetical protein  72.77 
 
 
582 aa  844    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3775  hypothetical protein  62.65 
 
 
613 aa  688    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464348  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1417  hypothetical protein  49.39 
 
 
606 aa  473  1e-132  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0731587  normal  0.0956406 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1724  ATPase  46.61 
 
 
585 aa  451  1e-125  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1662  hypothetical protein  45.63 
 
 
577 aa  438  1e-121  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0907  hypothetical protein  41.7 
 
 
571 aa  404  1e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6133  ATPase-like protein  40.62 
 
 
630 aa  374  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.869987  normal  0.698643 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1563  ATPase-like protein  33.73 
 
 
611 aa  259  6e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1514  ATPase-like protein  33.73 
 
 
611 aa  259  6e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0452  hypothetical protein  25.49 
 
 
682 aa  130  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3423  AAA ATPase  33.64 
 
 
1104 aa  55.5  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.598451  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  27.93 
 
 
679 aa  50.8  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  25.49 
 
 
508 aa  47.8  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  28 
 
 
496 aa  47.8  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1184  ATPase  24.84 
 
 
1071 aa  47.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2632  ATPase  32.17 
 
 
319 aa  46.6  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.57356 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  32.98 
 
 
531 aa  45.8  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3967  AAA ATPase  28.3 
 
 
1046 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  28.57 
 
 
579 aa  45.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  20.41 
 
 
557 aa  45.1  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  27.22 
 
 
544 aa  44.3  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2709  ATPase-like  23.42 
 
 
1106 aa  44.3  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  30.56 
 
 
607 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1183  AAA ATPase  28.08 
 
 
1043 aa  43.9  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>