17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0452 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0452  hypothetical protein  100 
 
 
682 aa  1383    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0907  hypothetical protein  27.59 
 
 
571 aa  160  5e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1662  hypothetical protein  30.16 
 
 
577 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1498  hypothetical protein  28.91 
 
 
582 aa  143  9e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1553  hypothetical protein  28.6 
 
 
582 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.623642 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3775  hypothetical protein  30.43 
 
 
613 aa  141  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464348  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1417  hypothetical protein  30.4 
 
 
606 aa  138  4e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0731587  normal  0.0956406 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2386  ATPase-like protein  27.81 
 
 
589 aa  136  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000327253  hitchhiker  0.000621551 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1913  ATPase-like protein  27.43 
 
 
578 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0219994  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1514  ATPase-like protein  25.49 
 
 
611 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1563  ATPase-like protein  25.49 
 
 
611 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4029  ATPase-like protein  26.99 
 
 
580 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.878422 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1724  ATPase  35.03 
 
 
585 aa  96.7  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6133  ATPase-like protein  39.87 
 
 
630 aa  83.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.869987  normal  0.698643 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  23.81 
 
 
611 aa  47.8  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  24.1 
 
 
616 aa  47.4  0.0009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3423  AAA ATPase  34.38 
 
 
1104 aa  46.2  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.598451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>