60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5417 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5417  hypothetical protein  100 
 
 		 1698 aa  3366    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.265481  normal  0.989313 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1463  hypothetical protein  23.92 
 
 		 1506 aa  121  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0246  hypothetical protein  26.88 
 
 		 1577 aa  97.1  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2180  AAA ATPase  25.34 
 
 		 777 aa  89.4  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.520189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0826  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1734 aa  73.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  26.45 
 
 		 508 aa  72  0.00000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  25.6 
 
 		 496 aa  66.2  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  29.7 
 
 		 531 aa  64.3  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  24.72 
 
 		 605 aa  64.7  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0645  ATPase-like protein  24.78 
 
 		 989 aa  62.8  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0911  ATPase-like protein  24.78 
 
 		 989 aa  61.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  25.36 
 
 		 500 aa  58.9  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2263  ATPase-like protein  24.54 
 
 		 533 aa  57  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.539345 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1259  protein of unknown function DUF87  24.22 
 
 		 540 aa  57.4  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1825  ATPase-like protein  24.18 
 
 		 1065 aa  57  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.071271 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1088  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  26.44 
 
 		 1633 aa  57  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0467  ATPase-like protein  24.23 
 
 		 1034 aa  56.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1716  ATPase-like protein  23.69 
 
 		 1065 aa  55.8  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00601254 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  25.89 
 
 		 611 aa  55.8  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0466  hypothetical protein  21.25 
 
 		 1692 aa  55.8  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.189828  normal  0.0732856 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  22.13 
 
 		 608 aa  55.5  0.000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5437  ATPase-like protein  27.27 
 
 		 1143 aa  55.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.384057  normal  0.0313008 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0494  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  24.85 
 
 		 505 aa  54.3  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0635  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  23.4 
 
 		 513 aa  53.5  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  25.22 
 
 		 492 aa  53.9  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0934  ATPase-like  26.06 
 
 		 1097 aa  53.5  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.39548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  23.22 
 
 		 616 aa  52.4  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2528  AAA ATPase  23.15 
 
 		 621 aa  52.4  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  35.51 
 
 		 679 aa  52.4  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2315  hypothetical protein  24.32 
 
 		 1743 aa  51.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  24.2 
 
 		 569 aa  50.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  31.2 
 
 		 360 aa  50.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  28.3 
 
 		 623 aa  50.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  27.78 
 
 		 599 aa  50.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1467  hypothetical protein  26.51 
 
 		 739 aa  50.1  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1389  hypothetical protein  28.65 
 
 		 606 aa  49.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.103576 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  32.84 
 
 		 591 aa  49.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  21.23 
 
 		 524 aa  49.3  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0025  hypothetical protein  35.8 
 
 		 500 aa  48.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  28.1 
 
 		 546 aa  48.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0162  hypothetical protein  24.5 
 
 		 591 aa  48.5  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.222598  normal  0.0745617 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  26.43 
 
 		 591 aa  48.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5114  AAA ATPase  25.18 
 
 		 1076 aa  47.8  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078899 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0832  hypothetical protein  23.34 
 
 		 1037 aa  47.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0842823  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4588  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.78 
 
 		 1812 aa  47.8  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1283  hypothetical protein  23.49 
 
 		 517 aa  48.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608046  normal  0.929249 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1484  hypothetical protein  27.39 
 
 		 1144 aa  47.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0469742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  20.67 
 
 		 496 aa  47  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0920  putative ATP-binding protein  21.88 
 
 		 1090 aa  47.4  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.061859  normal  0.0138151 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1250  ATPase  22.81 
 
 		 1040 aa  47  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.515643 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  26.38 
 
 		 628 aa  47  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  24.84 
 
 		 709 aa  46.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  32.29 
 
 		 559 aa  46.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  22.73 
 
 		 520 aa  46.2  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  26 
 
 		 617 aa  45.4  0.008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2490  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  35.44 
 
 		 629 aa  45.8  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0053  hypothetical protein  24.74 
 
 		 547 aa  45.4  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.594463 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25990  predicted ATPase  24.93 
 
 		 540 aa  45.4  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2518  hypothetical protein  25 
 
 		 1830 aa  45.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.577468  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  26.09 
 
 		 603 aa  45.4  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>