50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0162 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0162  hypothetical protein  100 
 
 		 591 aa  1190    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.222598  normal  0.0745617 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1131  AAA ATPase  43.43 
 
 		 600 aa  472  1e-132  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2821  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  20.06 
 
 		 827 aa  67.8  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.901669 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0720  hypothetical protein  25.95 
 
 		 351 aa  53.1  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0205  AAA ATPase  24.19 
 
 		 385 aa  52  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.519462  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0696  conjugal transfer ATPase TrbE  23.75 
 
 		 847 aa  51.6  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3089  conjugal transfer ATPase TrbE  21.98 
 
 		 812 aa  50.8  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0963  conjugal transfer ATPase TrbE  23.66 
 
 		 813 aa  50.1  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7443  conjugal transfer ATPase TrbE  23.37 
 
 		 809 aa  50.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1283  hypothetical protein  24.59 
 
 		 517 aa  50.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608046  normal  0.929249 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0863  type IV secretion system ATPase VirB4  24.03 
 
 		 803 aa  49.3  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2953  hypothetical protein  34.04 
 
 		 456 aa  49.7  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0311686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5417  hypothetical protein  24.5 
 
 		 1698 aa  48.9  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.265481  normal  0.989313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3367  conjugal transfer ATPase TrbE  21.15 
 
 		 814 aa  48.9  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5372  conjugal transfer ATPase TrbE  21.75 
 
 		 824 aa  48.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.259729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0246  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1577 aa  48.5  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2321  conjugal transfer ATPase TrbE  23.74 
 
 		 811 aa  47.4  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6206  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  24.45 
 
 		 839 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.623322  normal  0.0559252 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2827  conjugal transfer ATPase TrbE  20.85 
 
 		 812 aa  46.6  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.595122  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  23.26 
 
 		 500 aa  46.6  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2349  conjugal transfer ATPase TrbE  23.51 
 
 		 820 aa  46.6  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1838  conjugal transfer ATPase TrbE  20.93 
 
 		 808 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0931  hypothetical protein  29.27 
 
 		 616 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0714  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  25.19 
 
 		 611 aa  45.8  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5240  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like  29.59 
 
 		 779 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0858  type IV secretion system ATPase VirB4  33.73 
 
 		 801 aa  46.2  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3544  conjugal transfer ATPase TrbE  20.96 
 
 		 816 aa  46.2  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1191  conjugal transfer ATPase TrbE  20.96 
 
 		 816 aa  46.2  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0495  type IV secretion system ATPase VirB4  25.08 
 
 		 800 aa  45.8  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.97813  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1481  conjugal transfer ATPase TrbE  24.57 
 
 		 836 aa  46.2  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0386388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6405  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  33.8 
 
 		 819 aa  45.4  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0682909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1849  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  21.3 
 
 		 511 aa  45.1  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.892343  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1010  conjugal transfer ATPase TrbE  22.34 
 
 		 808 aa  45.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.611754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3197  conjugal transfer ATPase TrbE  20.76 
 
 		 877 aa  45.4  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.468072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3898  conjugal transfer ATPase TrbE  22.45 
 
 		 813 aa  45.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06795  hypothetical protein  23.78 
 
 		 516 aa  44.7  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.207511  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0598  conjugal transfer ATPase TrbE  21.33 
 
 		 809 aa  44.7  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4562  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  33.8 
 
 		 805 aa  44.7  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733697  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7744  conjugal transfer ATPase TrbE  21.94 
 
 		 812 aa  44.3  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.110925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1503  conjugal transfer ATPase TrbE  21.48 
 
 		 813 aa  44.3  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373275  normal  0.784639 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.92 
 
 		 595 aa  44.3  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  21.49 
 
 		 569 aa  44.3  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4099  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  22.87 
 
 		 530 aa  44.3  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0823505  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0343  hypothetical protein  22.44 
 
 		 499 aa  44.3  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2544  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  21.76 
 
 		 526 aa  43.9  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2908  conjugal transfer ATPase TrbE  21.32 
 
 		 811 aa  43.9  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.380632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1379  hypothetical protein  28.19 
 
 		 604 aa  43.9  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3215  conjugal transfer ATPase TrbE  23.02 
 
 		 836 aa  43.9  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  21.55 
 
 		 847 aa  43.9  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0321  hypothetical protein  22.44 
 
 		 499 aa  43.9  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>